Numpy: 运行时错误：implementation_array_function 方法已经有一个文档字符串

创建于 2019-08-28  ·  20评论  ·  资料来源: numpy/numpy

重现代码示例： 

from flask import Flask

import numpy

app = Flask(__name__)

作为 uwsgi 应用程序。

完整环境： https :

错误信息： 

|> test_bot_1                 | [uWSGI] getting INI configuration from /config/uwsgi.ini
|> test_bot_1                 | *** Starting uWSGI 2.0.18 (64bit) on [Wed Aug 28 00:25:33 2019] ***
|> test_bot_1                 | compiled with version: 6.3.0 20170516 on 04 May 2019 16:28:22
|> test_bot_1                 | os: Linux-4.4.0-75-generic #96-Ubuntu SMP Thu Apr 20 09:56:33 UTC 2017
|> test_bot_1                 | nodename: 2dd932a7998b
|> test_bot_1                 | machine: x86_64
|> test_bot_1                 | clock source: unix
|> test_bot_1                 | pcre jit disabled
|> test_bot_1                 | detected number of CPU cores: 8
|> test_bot_1                 | current working directory: /app
|> test_bot_1                 | detected binary path: /usr/local/bin/uwsgi
|> test_bot_1                 | your processes number limit is 1048576
|> test_bot_1                 | your memory page size is 4096 bytes
|> test_bot_1                 | detected max file descriptor number: 1048576
|> test_bot_1                 | lock engine: pthread robust mutexes
|> test_bot_1                 | thunder lock: disabled (you can enable it with --thunder-lock)
|> test_bot_1                 | uwsgi socket 0 bound to UNIX address /sockets/bots/test_bot.sock fd 3
|> test_bot_1                 | Python version: 3.6.8 (default, Mar 27 2019, 08:49:59)  [GCC 6.3.0 20170516]
|> test_bot_1                 | *** Python threads support is disabled. You can enable it with --enable-threads ***
|> test_bot_1                 | Python main interpreter initialized at 0x55b90bbdc100
|> test_bot_1                 | your server socket listen backlog is limited to 100 connections
|> test_bot_1                 | your mercy for graceful operations on workers is 60 seconds
|> test_bot_1                 | mapped 1239640 bytes (1210 KB) for 16 cores
|> test_bot_1                 | *** Operational MODE: preforking ***
|> test_bot_1                 | WSGI app 0 (mountpoint='') ready in 0 seconds on interpreter 0x55b90bbdc100 pid: 1 (default app)
|> test_bot_1                 | mounting main.py on /test_bot
|> test_bot_1                 | Traceback (most recent call last):
|> test_bot_1                 |   File "main.py", line 3, in <module>
|> test_bot_1                 |     import numpy
|> test_bot_1                 |   File "/usr/local/lib/python3.6/site-packages/numpy/__init__.py", line 142, in <module>
|> test_bot_1                 |     from . import core
|> test_bot_1                 |   File "/usr/local/lib/python3.6/site-packages/numpy/core/__init__.py", line 17, in <module>
|> test_bot_1                 |     from . import multiarray
|> test_bot_1                 |   File "/usr/local/lib/python3.6/site-packages/numpy/core/multiarray.py", line 14, in <module>
|> test_bot_1                 |     from . import overrides
|> test_bot_1                 |   File "/usr/local/lib/python3.6/site-packages/numpy/core/overrides.py", line 47, in <module>
|> test_bot_1                 |     """)
|> test_bot_1                 | RuntimeError: implement_array_function method already has a docstring

Numpy/Python 版本信息：

新安装的numpy ，2019-08-28。

57 - Close?
资料来源
picture luckydonald

最有用的评论

将 numpy 降级到 numpy==1.15.4 对我有用。

picture alexandra-chron 于 2020-04-13
👍12

所有20条评论

经过相当多的测试，我很确定这与在uwsgi内运行有关。

luckydonald picture luckydonald 于 2019-08-28

这敲响了一个模糊的钟声。 IIRC uwsgi执行某种文档字符串操作，例如使用-OO 。

rgommers picture rgommers 于 2019-08-28

这也发生在 Spyder 中，它使用 IPython 作为其 Python 控制台。 他们有一种称为“用户模块重新加载器”的技术，它“强制 Python 重新加载在 Python 或 IPython 控制台中执行文件时导入的模块”。 基本上这是del sys.modules[modname] 。

当尝试运行一个导入 numpy 的脚本时，我得到一个以

[...]
将 numpy 导入为 np

文件“C:\Program Files\Python35\lib\site-packagesnumpy\__init__.py”，第 142 行，在
从 。 进口核心

文件“C:\Program Files\Python35\lib\site-packagesnumpy\core\__init__.py”，第 17 行，在
从 。 导入多阵列

文件“C:\Program Files\Python35\lib\site-packagesnumpy\core\multiarray.py”，第 14 行，在
从 。 导入覆盖

文件“C:\Program Files\Python35\lib\site-packagesnumpy\core\overrides.py”，第 47 行，在
""")

运行时错误：implementation_array_function 方法已经有一个文档字符串

pythoneerd picture pythoneerd 于 2019-09-23
👍4 👎1

也发生在我身上（Django 服务器）：

  File "/opt/project/consensx/graph/values_graph.py", line 2, in <module>
    import matplotlib.pyplot as plt
  File "/pyroot/lib/python3.7/site-packages/matplotlib/__init__.py", line 138, in <module>
    from . import cbook, rcsetup
  File "/pyroot/lib/python3.7/site-packages/matplotlib/cbook/__init__.py", line 31, in <module>
    import numpy as np
  File "/pyroot/lib/python3.7/site-packages/numpy/__init__.py", line 142, in <module>
    from . import core
  File "/pyroot/lib/python3.7/site-packages/numpy/core/__init__.py", line 17, in <module>
    from . import multiarray
  File "/pyroot/lib/python3.7/site-packages/numpy/core/multiarray.py", line 14, in <module>
    from . import overrides
  File "/pyroot/lib/python3.7/site-packages/numpy/core/overrides.py", line 47, in <module>
    """)
RuntimeError: implement_array_function method already has a docstring

蟒蛇 7.3.7
麻木：1.17.2

puinenveturi picture puinenveturi 于 2019-10-07

这里真正的问题是 NumPy 不支持在此过程中重新初始化。 这可以追溯到 2012 年的 gh-665。解决这个问题需要仔细捕获我们在结构中创建的所有全局状态，并通过模块上的 getter 访问它。

mattip picture mattip 于 2019-12-08
😕3 🎉1 👍1

哦，全球人。 这些总是很有趣。

luckydonald picture luckydonald 于 2019-12-08
👍2

将 numpy 降级到 numpy==1.15.4 对我有用。

alexandra-chron picture alexandra-chron 于 2020-04-13
👍12

将 numpy 降级到 numpy==1.15.4 对我有用。

此版本的 numpy (1.15.4) 适用于女巫版本的熊猫？
因为有了熊猫 1.0.3 =
ValueError: numpy.ufunc size changed, may indicate binary incompatibility. Expected 216 from C header, got 192 from PyObject

另一个问题，你认为这个错误会很快修复吗？

多谢。

el-dge picture el-dge 于 2020-05-11

另一个问题，你认为这个错误会很快修复吗？

如果“这个错误”是指允许删除和重新导入 numpy，那么答案是“它不在我们的路线图上”。 这是开源的，因此任何人都可以为修复它做出贡献，但这将是一项相当大的任务。

mattip picture mattip 于 2020-05-11

如果您只有一个导入警告，那么您可以忽略它。 但我猜你正在使用 uwsgi ...

如果这是由于 uwsgi 造成的，那么我的答案是我们不会支持它，您将不得不为此付出非常大的努力。 目前，甚至不是所有Python 都支持这一点，他们正在研究它，并模糊地希望有一天它会起作用。 但要求我们完成这项工作根本不会有任何结果。 当然，您可以尝试投入时间和金钱来改善情况，这是受欢迎的，但不要抱有希望。

在Python 最终之后（这可能需要一段时间，他们已经为此工作了很多年）并且有相当大的用户群，可能会有一些人对它感兴趣。
目前，我们有公共 API，据我所知，它与 wsgi 所做的（使用子解释器）根本不兼容，并且我们可能有一些我们可能想要的优化缓存，据我所知 Python还没有提供任何机制来制作他们在这个设置中很快。

事实是，wsgi 默认使用的子解释器根本不受合理大小的 C 扩展系统的支持。 在可预见的未来，这不会发生。 如果有人认为或期望这是 NumPy 路线图的重要内容，那么在我看来，Python 开发人员的信号是错误的（我已经说过了，而且似乎在那里得到了承认）。 因为他们应该告诉每个人，必须假设子解释器在绝大多数 C 扩展中都失败了，没有人应该期望情况会在中期（未来几年）发生变化，并且基本上该功能是实验性的它涉及到 C 扩展支持。

是的，许多 Python 核心开发人员很高兴地朝着让事情工作的方向前进，但从 NumPy 等项目的角度来看，支持子解释器（wsgi 默认值）并不比 Python 2 到 Python 3 的转换更容易，只需一小部分潜在用户，目前甚至没有技术来正确支持一切！

所以，在这个咆哮之后......我会结束这个，如果有人想花精力让 NumPy 工作（更好地使用子解释器），这是一项崇高的努力。 我很高兴被证明是错误的......但我同意子解释器（wsgi）必须被视为实验性和功能的观点。 即，如果您使用子解释器，则更像是使用一些边缘 Python 实现（如早期的 PyPy）。 几年后，任何使用 PyPy 的人都希望在 PyPy 中运行 NumPy（而 PyPy 为实现这一目标做了所有工作）......

seberg picture seberg 于 2020-05-11

嗯，我完全同意我们不关心子解释器（无论如何），但这是一个更简单的问题 - 它在 1.15.4 和 Django、Spyder 等报告中不涉及uwsgi 。 我将快速更改__array_function__的文档字符串附件。

rgommers picture rgommers 于 2020-05-11

真的错过了那些。 虽然我也想知道......在这种情况下它应该是相当安全的。 从某种意义上说，它希望只会泄漏内存。 （我仍然有点想知道 Spyder 是否不应该只是跳过 C 扩展模块，至少在 CPython 获得更多机制来说明 C 扩展模块安全地实现它之前......即便如此，对于大多数 C 扩展模块重新加载可能几乎什么都不做）。

seberg picture seberg 于 2020-05-11

即便如此，对于大多数 C 扩展模块，重新加载可能几乎没有任何作用）。

我不认为这是重点。 说reload(any_module)比在尝试之前弄清楚是否有一些编译的扩展作为 Python 包的一部分挂起来要容易得多。

不确定 Django 究竟做了什么，但它可能是相似的。

rgommers picture rgommers 于 2020-05-11

我不想太烦你。

我有一个使用 Flask 和 Numpy 的网络服务，我想我不是唯一一个。
我对 Flask 中包含的开发服务器（当然是 Werkzeug）没有任何错误。

事实上，在生产中，我使用 Python3 的 apache2 WSGI 模块，它允许我保持负载（几个线程）

我是开放的，告诉我用什么：

非常感谢。

el-dge picture el-dge 于 2020-05-13

子解释器段落中的任何内容都应该是关于 NumPy 的合理建议。 我不能就什么可能适用于网络服务提供任何建议，但也许这个线程中的其他人可以。

我只是想明确一点，让情况稍微好一点可能是好的（并帮助一些人），但在可预见的未来不会解决深层问题。 在任何情况下，我想我们可能会尝试消除此故障，而是给出一个巨大的警告，即这可能会导致难以调试的问题。

seberg picture seberg 于 2020-05-13

也许它会帮助某人，因为它之前没有提到：
我正在使用uwsgi （使用 Nginx）并且“ single-interpreter = true ”ini 配置（或--single-interpreter开关）为我解决了这个问题。

在这里我找到了这个标志的解释：

默认情况下，uWSGI 将在进程的子解释器中执行 Python 代码，而不是在 Python 首次初始化时创建的主 Python 解释器。 这样做是为了允许多个单独的 Python Web 应用程序在一个进程中运行，但要充分分离，以免相互干扰。 然而，当使用启用线程的子解释器时，旧版本的 uWSGI 可能会失败。 因此，最安全的做法是使用此选项并将自己限制在每个进程的单个 Web 应用程序中。 使用 uWSGI 在每个进程中运行单个 Web 应用程序是正常用例，因此此限制不太可能成为问题。

因此，作为一种解决方法，您可以使用此配置切换到 uwsgi，或者尝试为您的环境找到类似的东西。

vac picture vac 于 2020-05-14
👍2

将重新打开，直到我们实际合并修复/解决方法 - 应该很快。

rgommers picture rgommers 于 2020-05-15
🎉1 👍1

昨天我也遇到了同样的错误，我就是不知道发生了什么。 为了完成起见，我将在这里说明原因：我有一个名为 logger.py 的记录器模块，它正在覆盖 Numpy 中的某些内容。 更改了模块名称，没有错误。 也许其他人会看到这个评论并找出类似的事情发生在他们身上。

JRitmeester picture JRitmeester 于 2020-06-09
👍1

我们已经为 1.19 推送了一个修复程序。 或者更确切地说是一种解决方法，因为错误仍然表明正在发生的事情可能会产生问题。

seberg picture seberg 于 2020-06-09
👍1

@seberg使用 1.19 中的解决方法我们应该关闭它吗？

rossbar picture rossbar 于 2020-07-23
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