Astropy: संरचित dtype के साथ प्रारंभिक तालिका असंगत/भ्रमित परिणाम उत्पन्न करती है

को निर्मित 23 मई 2020 · 3टिप्पणियाँ · स्रोत: astropy/astropy

विवरण

फेसबुक समूह में एक चर्चा ने सामने लाया कि एक मौजूदा तालिका से एक नई, खाली तालिका का निर्माण किया जा सकता है dtype :

>>> oldtable.dtype
dtype([('wavelength', '<f8'), ('flux', '<f4'), ('uncertainty', '<f4')])
>>> Table(dtype=oldtable.dtype)
<Table length=0>
wavelength   flux  uncertainty
 float64   float32   float32  
---------- ------- -----------

और इसे अधिक पैदल यात्री तरीके से प्रारंभ करना भी उतना ही संभव है

>>> newtable = Table(names=oldtable.colnames, dtype=[dt for n, dt in oldtable.dtype.descr])

लेकिन सीधे पुराने dtype का उपयोग करके यदि names पहले से ही निर्दिष्ट हैं तो इन अपवादों को फेंक देता है:

 >>> newtable = Table(names=oldtable.colnames, dtype=oldtable.dtype)
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/Users/derek/lib/python3.8/site-packages/astropy/table/table.py", line 621, in __init__
    self._check_names_dtype(names, dtype, n_cols)
  File "/Users/derek/lib/python3.8/site-packages/astropy/table/table.py", line 873, in _check_names_dtype
    raise ValueError(f'{inp_str} must be a list or None')
ValueError: dtype must be a list or None

>>> newtable = Table(names=oldtable.colnames, dtype=oldtable.dtype.descr)
Traceback (most recent call last):
  File "/Users/derek/lib/python3.8/site-packages/astropy/table/table.py", line 1088, in _convert_data_to_col
    col = col_cls(name=name, data=data, dtype=dtype,
  File "/Users/derek/lib/python3.8/site-packages/astropy/table/column.py", line 879, in __new__
    self = super().__new__(
  File "/Users/derek/lib/python3.8/site-packages/astropy/table/column.py", line 254, in __new__
    if np.dtype(dtype).char == 'S':
TypeError: data type 'wavelength' not understood

ऐसा ही तब होता है जब Table को एक स्ट्रक्चर्ड ऐरे के साथ इनिशियलाइज़ किया जाता है।

अपेक्षित् व्यवहार

Table को या तो अधिक सार्थक त्रुटि देनी चाहिए, या (शायद अधिमानतः) संरचित dtype स्वीकार करना चाहिए, संभवतः एक चेतावनी के साथ कि dtype.names को निर्दिष्ट names बदल दिया जाएगा

वास्तविक व्यवहार

ऊपर देखो। जबकि दस्तावेज़ में अनुशंसित विधि newtable = oldtable[:0].copy() काम करती है (और किसी भी unit गुणों को अतिरिक्त रूप से कॉपी करने का लाभ है), अकेले dtype निर्दिष्ट करने के बीच विसंगतिपूर्ण व्यवहार, और साथ में names संभावित रूप से भ्रमित करने वाला है, और अपवाद बहुत स्पष्ट नहीं हैं।

https://github.com/astropy/astropy/blob/eeb9b7ac0e18b262fae64cd2fa46d0e1cff1e4d5/astropy/table/table.py#L592 -L594

कोई अन्य names जानकारी उपलब्ध न होने पर dtype स्वचालित रूप से "अनपैक" करता है, और names सेट के साथ भी ऐसा ही किया जा सकता है (लेकिन dtype.names छोड़कर, क्योंकि names निश्चित रूप से प्राथमिकता लेनी चाहिए)।

थोड़ा संबंधित नोट पर, तालिका कॉलम के लिए सभी इकाइयों को सीधे एक रूप में प्राप्त करने के लिए एक विधि होना सुविधाजनक होगा जिसे units= रूप में पारित किया जा सकता है। बेशक कोई newtable = oldtable[:0].copy() पद्धति पर लौट सकता है, लेकिन यदि नाम या प्रकार को संशोधित करना वांछित है, तो ऐसा विकल्प काम आएगा।

सिस्टम विवरण

एस्ट्रोपी संस्करण 4.2.dev112+g595484597।
दिनांक: 2020-05-22T19:44:39
प्लेटफ़ॉर्म: macOS-10.12.6-x86_64-i386-64bit
निष्पादन योग्य: /sw/bin/python3.8
पूर्ण पायथन संस्करण:
3.8.3 (डिफ़ॉल्ट, 14 मई 2020, 22:17:35)
[क्लैंग 9.0.0 (क्लैंग-900.0.39.2)]

पैकेज संस्करण:
सुन्न: 1.19.0rc1
सिसिपी: 1.4.1
माटप्लोटलिब: 3.2.1
h5py: 2.9.0
पांडा: उपलब्ध नहीं
साइथन: 0.29.16

Bug table

स्रोत

dhomeier

सभी 3 टिप्पणियाँ

धन्यवाद! वास्तव में oldtable क्या था? क्या पूरी तरह से प्रतिलिपि प्रस्तुत करने योग्य स्निपेट प्रदान करना संभव है?

pllim 26 मई 2020

import numpy as np
from astropy.table import Table
arr = np.ones(2, dtype=np.dtype([('A', 'i'), ('B', 'f4'), ('C', 'f8')]))
tab1 = Table(arr)
tab1

tab2 = Table(dtype=tab1.dtype)
tab2

tab3 = Table(names=['X', 'Y', 'Z'], dtype=[dt for n, dt in tab1.dtype.descr])
tab3

निम्नलिखित आउटपुट उत्पन्न करता है:

<Table length=2>
  A      B       C   
int32 float32 float64
----- ------- -------
    1     1.0     1.0
    1     1.0     1.0

<Table length=0>
  A      B       C   
int32 float32 float64
----- ------- -------

<Table length=0>
  X      Y       Z   
int32 float32 float64
----- ------- -------

जबकि

>>> tab3 = Table(names=['X', 'Y', 'Z'], dtype=tab1.dtype)
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/sw/lib/python3.8/site-packages/astropy/table/table.py", line 621, in __init__
    self._check_names_dtype(names, dtype, n_cols)
  File "/sw/lib/python3.8/site-packages/astropy/table/table.py", line 873, in _check_names_dtype
    raise ValueError(f'{inp_str} must be a list or None')
ValueError: dtype must be a list or None

>>> tab3 = Table(names=['X', 'Y', 'Z'], dtype=tab1.dtype.descr)
Traceback (most recent call last):
  File "/sw/lib/python3.8/site-packages/astropy/table/table.py", line 1088, in _convert_data_to_col
    col = col_cls(name=name, data=data, dtype=dtype,
  File "/sw/lib/python3.8/site-packages/astropy/table/column.py", line 879, in __new__
    self = super().__new__(
  File "/sw/lib/python3.8/site-packages/astropy/table/column.py", line 254, in __new__
    if np.dtype(dtype).char == 'S':
TypeError: data type 'A' not understood

During handling of the above exception, another exception occurred:

Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/sw/lib/python3.8/site-packages/astropy/table/table.py", line 624, in __init__
    init_func(data, names, dtype, n_cols, copy)
  File "/sw/lib/python3.8/site-packages/astropy/table/table.py", line 955, in _init_from_list
    col = self._convert_data_to_col(col, copy, default_name, dtype, name)
  File "/sw/lib/python3.8/site-packages/astropy/table/table.py", line 1092, in _convert_data_to_col
    raise ValueError('unable to convert data to Column for Table')
ValueError: unable to convert data to Column for Table



md5-9116051d321cf97db138d26f38a78850



>>> tab3 = Table(arr, dtype=tab1.dtype.descr)
Traceback (most recent call last):
  File "/sw/lib/python3.8/site-packages/astropy/table/table.py", line 1088, in _convert_data_to_col
    col = col_cls(name=name, data=data, dtype=dtype,
  File "/sw/lib/python3.8/site-packages/astropy/table/column.py", line 879, in __new__
    self = super().__new__(
  File "/sw/lib/python3.8/site-packages/astropy/table/column.py", line 254, in __new__
    if np.dtype(dtype).char == 'S':
TypeError: data type 'A' not understood

During handling of the above exception, another exception occurred:

Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/sw/lib/python3.8/site-packages/astropy/table/table.py", line 624, in __init__
    init_func(data, names, dtype, n_cols, copy)
  File "/sw/lib/python3.8/site-packages/astropy/table/table.py", line 1108, in _init_from_ndarray
    self._init_from_list(cols, names, dtype, n_cols, copy)
  File "/sw/lib/python3.8/site-packages/astropy/table/table.py", line 955, in _init_from_list
    col = self._convert_data_to_col(col, copy, default_name, dtype, name)
  File "/sw/lib/python3.8/site-packages/astropy/table/table.py", line 1092, in _convert_data_to_col
    raise ValueError('unable to convert data to Column for Table')
ValueError: unable to convert data to Column for Table

dhomeier 29 मई 2020

👍1

#10419 देखें।

taldcroft 30 मई 2020

👍1

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