Dplyr: मैं postgresql schema.table को dplyr पैकेज से नहीं जोड़ सकता

@ हैडली आपके उत्तर के बारे में सोचकर मैं पूर्ण SQL वाक्य लिखने आया था

my_tbl = tbl(my_db, dplyr::sql('SELECT * FROM mortalidad.def0307'))

और वहां मैं स्कीमा और टेबल से जुड़ सकता था। बहुत - बहुत धन्यवाद। - डिएगो

ग्रीनप्लम के साथ काम करते समय मैं इसी मुद्दे को पोस्ट करने जा रहा था। आप एसक्यूएल विधि ने मेरी समस्या हल कर दी।

मैं इससे खुश हूं। केवल एक चीज जो मुझे चिंतित करती है वह यह है कि sql स्टेटमेंट में निम्नलिखित देखा जाता है:

"var1" चुनें, गिनती (*) के रूप में "n" से (चुनें * mortalidad.mort12 से)

जब कोई समूहीकरण किया जाता है। FROM के बाद एक सबक्वायरी है और मुझे नहीं पता कि sql क्वेरी की दक्षता के साथ इसमें किसी प्रकार की समस्या होगी या नहीं। मैं एक एपिडेमियोलॉजिस्ट हूं और मुझे इस बात की जानकारी नहीं है।

क्या आप मुझे SQL कमांड का एक क्रम देना चाहेंगे जिसे मैं उस स्कीमा में एक स्कीमा और एक डेटाबेस बनाने के लिए postgresql में चला सकता हूँ?

यहाँ देरी के लिए क्षमा करें मैं एक योजना बनाने के रूप में भेजता हूँ

तालिका बनाएं schema_name.table_name
(
कोडिगो कैरेक्टर अलग-अलग (3),
नॉमब्रे कैरेक्टर अलग-अलग(51),
महाद्वीपीय चरित्र भिन्न (7)
)

2014-03-19 18:56 GMT-03:00 हैडली विकम नोटिफिकेशन @github.com :

क्या आप मुझे SQL कमांड का एक क्रम देना चाहेंगे जिसमें मैं चला सकूं
postgresql उस स्कीमा में एक स्कीमा और एक डेटाबेस बनाने के लिए?

इस ईमेल का सीधे उत्तर दें या इसे Gi tHub पर देखेंhttps://github.com/hadley/dplyr/issues/244#issuecomment -38112148
.

डिएगो गार्सिलाज़ो
चिकित्सक
डिपार्टमेंट प्रोग्रामस डी सालुद
Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias
ए.वी. ब्लास परेरा 8260 // सांता फ़े // अर्जेंटीना //0342 - 4896850
http://www.anlis.gov.ar/inst/iner/

मुझे लगता है कि यहां मूल रूप से दो विकल्प हैं:

1. जब भी पहचानकर्ता में कोई बिंदु होता है तो विशेष मामला बच जाता है। इसका मतलब यह होगा कि x.y बचकर "x"."y" । इसका बहुत संक्षिप्त होने का लाभ है, इसका नुकसान यह है कि R से SQL में अनुवादित तालिकाएँ फ़ील्ड नामों में . का उपयोग नहीं कर सकती हैं (शायद बहुत सामान्य नहीं)।
2. एक नए भागने के तंत्र का प्रयोग करें। संभवतः ऐसा करने का सबसे आसान तरीका ident() को कई तर्कों को लेने के लिए विस्तारित करना होगा, उदाहरण के लिए ident("x", "y") । वैकल्पिक रूप से dot() को परिभाषित कर सकता है जो एनएसई आपको dot(x, y) लिखने की अनुमति देता है। यह अधिक टाइपिंग है, लेकिन किसी भी मौजूदा कोड को तोड़ने की गारंटी नहीं है।

यह तालिका नामों (जैसे schema.table ) और संभवतः जुड़ने में फ़ील्ड नामों को स्पष्ट करने के लिए महत्वपूर्ण है (उदाहरण के लिए table.field )

मैं वर्तमान में स्पष्ट dot() फ़ंक्शन की ओर झुक रहा हूं, क्योंकि विश्व स्तर पर भागने के कार्य को बदलना जोखिम भरा लगता है।

हम्मम्म, इस उपयोग के मामले के लिए, आप बस यह कर सकते हैं:

my_tbl <- tbl(my_db, sql('mortalidad.def0307'))

और भविष्य के संदर्भ के लिए कुछ अन्य कोड (सफल नहीं था)

dot <- function(...) {
  args <- dots(...)
  is_name <- vapply(args, is.name, logical(1))
  if (any(!is_name)) {
    stop("All arguments to dot() must be names.")
  }

  dots <- vapply(args, as.character, character(1))
  class(dots) <- c("ident_multi", "ident", "sql", "character")
  dots
}

dot <- function(...) {
  out <- paste(escape(c(...), parens = FALSE), collapse = ".")
  class(out) <- c("ident", "sql", "character")
  out
}

#' <strong i="6">@export</strong>
escape.ident_multi <- function(x, parens = FALSE, collapse = ", ", con = NULL) {
  y <- vapply(x, escape_ident, FUN.VALUE = character(1), con = con)
  paste(y, collapse = ".")
}

#' <strong i="7">@export</strong>
format.ident_multi <- function(x, ...) paste0("<SQL> ", paste(x, collapse = "."))

# lahman_sqlite() %>% tbl("Batting")
# lahman_sqlite() %>% tbl("main.Batting")
# lahman_sqlite() %>% tbl(sql("main.Batting"))
# lahman_sqlite() %>% tbl(dot("main", "Batting"))

हाय हैडली,

मेरे पास एक ही समस्या है और नेस्टिंग प्रदर्शन के लिए एक समस्या प्रतीत होती है (मेरे मामले में एक गंभीर मामला है क्योंकि मैं 100 मिलियन पंक्तियों के साथ डेटा पर काम कर रहा हूं)। क्या आप विस्तार से बता सकते हैं कि आपका अंतिम प्रयास क्यों विफल हुआ?

धन्यवाद

FWIW, कुछ उपयोग के मामलों के लिए एक सहायक मुहावरा है:

dbSendQuery(con$con, build_sql("SET search_path TO ", schema_name))

फिर उस कनेक्शन का उपयोग करने वाले बाद के प्रश्न उस स्कीमा के भीतर हैं।

हाय हारलन,

धन्यवाद - और मैं पहले से ही ऐसा कुछ उपयोग कर रहा हूं (सिवाय मैं स्कीमा द्वारा खोज पथ का विस्तार कर रहा हूं। लेकिन यह केवल अब तक मदद करता है। यदि आपके पास 2 स्कीमा में समान नाम वाले टेबल हैं, तो यह नहीं होगा।

वैसे भी, मैं सोच रहा था कि बेस_स्केलर एसक्यूएल अनुवादक में '$' चिह्न को अधिभारित क्यों न करें।

यह एक आर परिप्रेक्ष्य से भी समझ में आता है

a$b$c, वहां एक वातावरण (यानी एक स्कीमा), बीए टेबल और सीए कॉलम होगा। केवल एक ही विचार जिसे ठीक किया जाना है, वह है tbl_sql, जिसे डेटाबेस में तालिका_नाम मौजूद होने पर इतने सरल तरीके से जांचना नहीं चाहिए। इसके बजाय, यह जांच सकता है कि क्या "चयन" कथन SQL क्वेरी का हिस्सा है और यदि नहीं, तो सामने एक चयन * जोड़ें और इस तरह से चर जांचें।

इस मामले में, कोई एनएसई को टीबीएल फ़ंक्शन के लिए भी सक्षम कर सकता है?

अरे हाँ, एक और टिप्पणी:

डीबीसेंडक्वेरी

अक्सर आरजेडीबीसी (कम से कम वर्टिका के साथ) के लिए काम नहीं करता है। ऊपर दी गई क्वेरी, यानी SET search_path TO ...

परिणाम वापस नहीं करता है। dbSendQuery एक की अपेक्षा करता है। वर्टिका के लिए, यह काम नहीं करता है और किसी को dbSendUpdate का उपयोग करना पड़ता है। क्या यह MySQL के मामले में भी है (या कम से कम dbSendUpdate MySQL के लिए विफल नहीं होता है)?

मुझे $ ओवरलोड करने का विचार पसंद है। जब मैं अगली बार dplyr पर काम कर रहा हूं, तो मैं निश्चित रूप से इसके बारे में सोचूंगा।

@hhoeflin क्या आपने वर्टिका से बात करने के लिए RJDBC के बजाय RPostgreSQL की कोशिश की है?

नहीं - नहीं पता था कि RPostgreSQL एक विकल्प है। किसी भी मामले में - वर्टिका बैकएंड अब आरजेडीबीसी के लिए पहले से ही लागू है। हालांकि एक कोशिश की थी और पोस्टग्रेज टेबल के रूप में समस्याओं में भाग गया था, यह पता लगाने के लिए कि डेटाबेस में कौन सी टेबल मौजूद हैं, अलग-अलग प्रतीत होते हैं।

इसे धीरे-धीरे डीबीआई के माध्यम से हल किया जा रहा है: https://github.com/rstats-db/DBI/issues/24