これらの画像のビニングを選択したことが原因である可能性があります。 ビンの数を増やして、これが違いを生むかどうかを確認しようとしましたか？

こんにちはフェドロフ、
ビンの数を変更する方法がわかりません...説明していただけませんか。それが可能かどうかを確認します。
どうもありがとう

これは、設定ファイルの次の行を使用して行うことができます： https ：

ありがとうFedorov-binWidth = 50のデータのサブセットでテストしましたが、残念ながら結果は同じです。

こんにちは、
c
マスク内の強度の範囲を確認できますか？
ビンの数が30から
130で提案されているように
https://pyradiomics.readthedocs.io/en/latest/faq.html#what -about-gray-value-discretization-fixed-bin-width-fixed-bin-count

ピラディオミクスをどのように実行していますか？ パラメータファイルを渡していますか
正しく？

これが問題の発見に役立つことを願っています

terça、14/01/2020、午後5時28分、GitHubのユーザ名、ハイフン[email protected]
escreveu：

こんにちはフェドロフ、binWidth = 50のデータのサブセットでテストしましたが、
結果は同じです。

—
このスレッドにサブスクライブしているため、これを受け取っています。
このメールに直接返信し、GitHubで表示してください
https://github.com/Radiomics/pyradiomics/issues/552?email_source=notifications&email_token=AGGB5ZLWAWZCFF5SEVV4GI3Q5XY3HA5CNFSM4KGWGJWKYY3PNVWWK3TUL52HS4DFVREXG43VMVBW63LNMVXHJKT
または購読を解除する
https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AGGB5ZPEZ7UXDR22NCWIKCTQ5XY3HANCNFSM4KGWGJWA
。

こんにちはジョアン、
マスクはバイナリであるため、値は1または0のいずれかです。
さまざまな画像を使用していますが、画像にオーバーレイしたときに正の値のみをカバーするようにマスクを設定しています。

元々はデフォルト設定のbinWidth = 25を使用していましたが、Fedorovの提案に従って50（任意の数）に変更しましたが、それでも同じ結果が得られました。 PyCharmを使用してピラディオミクスを実行します。これは、パラメーターファイルのparams.yamlファイルを呼び出すと思います。 以前は他のデータセットでこの問題は発生していませんでした。

申し訳ありませんが、私が言及していた範囲は
マスクが1つである画像の強度。

ピラディオミクスを実行しているコードのコマンド/行をここに表示できますか？
だから私たちはあなたをよりよく助けます！

ありがとう

terça、14/01/2020、午後06時47分、GitHubのユーザ名、ハイフン[email protected]
escreveu：

こんにちはジョアン、
マスクはバイナリであるため、値は1または0のいずれかです。
さまざまな画像を使用していますが、マスクを設定して
画像にオーバーレイすると、正の値のみがカバーされます。

元々はデフォルト設定のbinWidth = 25を使用していましたが、変更しました
フェドロフによって提案されたように50（任意の数）まで
結果。 私たちはPyCharmを使用してピラディオミクスを実行します。
パラメータファイルのparams.yamlファイル。 この問題はありませんでした
以前は他のデータセットを使用していました。

—
あなたがコメントしたのであなたはこれを受け取っています。
このメールに直接返信し、GitHubで表示してください
https://github.com/Radiomics/pyradiomics/issues/552?email_source=notifications&email_token=AGGB5ZPIXVJU5KUVHW7VNPDQ5YCDXA5CNFSM4KGWGJWKYY3PNVWWK3TUL52HS4DFVREXG43VMVBW63LNMVXHJKT
または購読を解除する
https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AGGB5ZMGT2UAT6L5WO5GQP3Q5YCDXANCNFSM4KGWGJWA
。

こんにちはジョアン、
申し訳ありませんが、私はこのすべての初心者です-これはあなたが求めていたものだと思いますか？

`radiomics import featureextractor、getTestCaseから
6つインポート
sys、osをインポートします

定数を設定する

dataDir = 'E：\ Texture Analysis Files \ PyCharm Projects \ SR_FE_Codes \ IVIM_D_ThresholdedIndiv_20200110 \ Test'
forYAML = 'E：\ Texture Analysis Files \ PyCharm Projects \ SR_FE_Codes'
params = os.path.join（forYAML、 "examples"、 "exampleSettings"、 "Params.yaml"）
extractor = featureextractor.RadiomicsFeatureExtractor（params）
a = [] `

それはまさに私が尋ねたものでした。

問題は、IVIM分析からのDのスケールにあるのではないかと思います。 ザ・
ビン幅の値は、内部の値に対して高すぎるか低すぎる可能性があります
マスク。 単位（mm²/ sまたはその他）とそれらの値がどのようになっているのかによって異なります
表示（・10 ^ -6またはその他）。

値の範囲を理解する最も簡単な方法は、ロードすることだと思います
3Dスライサーと定量化で画像とマスクを選択します
セグメンテーション統計（または同様のもの）、最小値を確認し、
最大にし、それに応じてビンの幅を定義します。

あなたがそれを解決することができたかどうか私に知らせてください

terça、14/01/2020、午後07時21分、GitHubのユーザ名、ハイフン[email protected]
escreveu：

こんにちはジョアン、
申し訳ありませんが、私はこのすべての初心者です-これはあなたが求めていたものだと思います
ために？

`radiomics import featureextractor、getTestCaseから
6つインポート
sys、osをインポートします
定数を設定する

dataDir = 'E：\ Texture Analysis Files \ PyCharm
Projects \ SR_FE_Codes \ IVIM_D_ThresholdedIndiv_20200110 \ Test '
forYAML = 'E：\ Texture Analysis Files \ PyCharm Projects \ SR_FE_Codes'
params = os.path.join（forYAML、 "examples"、 "exampleSettings"、
"Params.yaml"）
extractor = featureextractor.RadiomicsFeatureExtractor（params）
a = [] `

—
あなたがコメントしたのであなたはこれを受け取っています。
このメールに直接返信し、GitHubで表示してください
https://github.com/Radiomics/pyradiomics/issues/552?email_source=notifications&email_token=AGGB5ZP2EPWNOVFBG66UU53Q5YGFHA5CNFSM4KGWGJWKYY3PNVWWK3TUL52HS4DFVREXG43VMVBW63LNMVXHJKTDN
または購読を解除する
https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AGGB5ZNKSMN6ZZGCVBVEGO3Q5YGFHANCNFSM4KGWGJWA
。

binWidth代わりにここで説明されているようにbinCountパラメーターを使用することもできます： https ：//pyradiomics.readthedocs.io/en/latest/customization.html#feature -class-level

こんにちはジョアン、フェドロフ、

あなたの提案を両方ともありがとう。
いくつかのケースをスライサーにインポートしました。 さまざまなしきい値が設定されたさまざまなIVIMマップ（つまり、ADC、D、f）を調べているため、最小/最大は異なります。 ただし、以下のいくつかの例：

ADC：8.33816e-05〜0.00217475
D：6.71817e-05から0.3
f：0.000594766〜0.299469

提案はbinWidthを30〜130の間に設定するように見えますが、私が何をテストできるかについて、どちらかが提案を持っているかどうか疑問に思っていましたか？ さまざまなマップでさまざまな縮尺を指定するために、binWidthをどの方向に変更する必要があるかわかりません。

ご助力ありがとうございます、

したがって、問題は、25または50のビン幅が範囲に対して高すぎることです。
（最大-最小）ADC、D、およびfの値。 たとえば、選択することができます
ADCの場合、ビン幅は
（0.00217475-8.33816e-05）/ 80
ここで、80はビンの数です。
値80は、ビンの幅を取得するための単なる例です。
あなたは、ピラジオミクスで提案されていることを実行することができます
特徴抽出を1回行い、firstorder_rangeを調べて、
選択したビンの幅で割ると、大多数の患者が
30〜130ビン（30〜130のビン幅ではありません）。

Andreyによるソリューションを試すことができ、それらの値が
変化する。

それはあなたを助けるのに十分明確であったことを願っています

terça、14/01/2020、午後9時10分、GitHubのユーザ名、ハイフン[email protected]
escreveu：

こんにちはジョアン、フェドロフ、

あなたの提案を両方ともありがとう。
いくつかのケースをスライサーにインポートしました。 私たちは見ています
異なるしきい値が設定された異なるIVIMマップ（つまり、ADC、D、f）で、
最小/最大は異なります。 ただし、以下のいくつかの例：

ADC：8.33816e-05〜0.00217475
D：6.71817e-05から0.3
f：0.000594766〜0.299469

binWidthを30〜130の間に設定することが提案されているようですが、
私が何をテストできるかについて、あなたのどちらかが提案を持っているかどうか疑問に思っていましたか？ 私
binWidthをどの方向に変更すればよいかわからない
さまざまなマップで拡大縮小します。

ご助力ありがとうございます、

—
あなたがコメントしたのであなたはこれを受け取っています。
このメールに直接返信し、GitHubで表示してください
https://github.com/Radiomics/pyradiomics/issues/552?email_source=notifications&email_token=AGGB5ZJMMWFJBVIEFAMQCOLQ5YS3PA5CNFSM4KGWGJWKYY3PNVWWK3TUL52HS4DFVREXG43VMVBW63LNMVXHJKTDN
または購読を解除する
https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AGGB5ZOTFERRJZDRYKDQYPTQ5YS3PANCNFSM4KGWGJWA
。

Joaoに感謝します、それはとても役に立ちました！

私はあなたの提案を試してみて、何が公開されているかを見てみましょう
上手。

1月14日、夜04時31分に2020年には、ジョアンSantinhaの[email protected]は書きました：

したがって、問題は、25または50のビン幅が範囲に対して高すぎることです。
（最大-最小）ADC、D、およびfの値。 たとえば、選択することができます
ADCの場合、ビン幅は
（0.00217475-8.33816e-05）/ 80
ここで、80はビンの数です。
値80は、ビンの幅を取得するための単なる例です。
あなたは、ピラジオミクスで提案されていることを実行することができます
特徴抽出を1回行い、firstorder_rangeを調べて、
選択したビンの幅で割ると、大多数の患者が
30〜130ビン（30〜130のビン幅ではありません）。

Andreyによるソリューションを試すことができ、それらの値が
変化する。

それはあなたを助けるのに十分明確であったことを願っています

terça、2020年1月14日、21：10、GitHub-username-hyphen >>
escreveu：

こんにちはジョアン、フェドロフ、

あなたの提案を両方ともありがとう。
いくつかのケースをスライサーにインポートしました。 私たちは見ています
異なるしきい値が設定された異なるIVIMマップ（つまり、ADC、D、f）で、
最小/最大は異なります。 ただし、以下のいくつかの例：

ADC：8.33816e-05〜0.00217475
D：6.71817e-05から0.3
f：0.000594766〜0.299469

binWidthを30〜130の間に設定することが提案されているようですが、
私が何をテストできるかについて、あなたのどちらかが提案を持っているかどうか疑問に思っていましたか？ 私
binWidthをどの方向に変更すればよいかわからない
さまざまなマップで拡大縮小します。

ご助力ありがとうございます、

—
あなたがコメントしたのであなたはこれを受け取っています。
このメールに直接返信し、GitHubで表示してください
<
https://github.com/Radiomics/pyradiomics/issues/552?email_source=notifications&email_token=AGGB5ZJMMWFJBVIEFAMQCOLQ5YS3PA5CNFSM4KGWGJWKYY3PNVWWK3TUL52HS4DFVREXG43VMVBW63LNMVXHJKTDN
、
または購読を解除する
<
https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AGGB5ZOTFERRJZDRYKDQYPTQ5YS3PANCNFSM4KGWGJWA

。

—
スレッドを作成したため、これを受け取っています。
このメールに直接返信し、GitHubで表示してください
https://github.com/Radiomics/pyradiomics/issues/552?email_source=notifications&email_token=AOAQCNIEPHMNDHUL2LV7SPTQ5YVKLA5CNFSM4KGWGJWKYY3PNVWWK3TUL52HS4DFVREXG43VMVBW63LNMVXHJKTDN
または購読を解除する
https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AOAQCNPKNW3LUEBDZAUN6RLQ5YVKLANCNFSM4KGWGJWA
。

こんにちはフェドロフ、
binCountとbinWidthの調整を検討していますが、binCountのコードに行が見つかりません。 これをどこで見つけることができるかアドバイスできますか？
ありがとうございました

特徴抽出にコマンドラインツールを使用して実験し、構成ファイルでパラメーターを指定するのが最も簡単です。 この設定ファイルから始めて、 binCount代わりにbinWidthを指定できますか？

こんにちは、みんな、

この問題は、画像の値のスケールを反映するようにbinWidthを変更することで解決されたと思います。

Joao、Fedorovに感謝します！