Ipython: 无法打开或创建新的 Jupyter 笔记本

创建于 2015-11-17 · 33评论 · 资料来源: ipython/ipython

我最近在笔记本电脑上新安装了 Ubuntu 14.04，并通过 anaconda 安装了 IPython 4。但是，我无法打开或加载任何笔记本，包括那些在我的桌面上可以正常打开的笔记本。当我尝试加载笔记本时，出现以下错误： An unknown error occurred while loading this notebook. This version can load notebook formats v4 or earlier. See the server log for details.

终端给出：

Unhandled error in API request
Traceback (most recent call last):
  File "/home/ryan/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/traitlets/traitlets.py", line 432, in __get__
    value = obj._trait_values[self.name]
KeyError: 'db'

During handling of the above exception, another exception occurred:
Traceback (most recent call last):
  File "/home/ryan/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/notebook/base/handlers.py", line 436, in wrapper
    result = yield gen.maybe_future(method(self, *args, **kwargs))
  File "/home/ryan/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/tornado/gen.py", line 870, in run
    value = future.result()
  File "/home/ryan/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/tornado/concurrent.py", line 215, in result
    raise_exc_info(self._exc_info)
  File "<string>", line 3, in raise_exc_info
  File "/home/ryan/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/tornado/gen.py", line 230, in wrapper
    yielded = next(result)
  File "/home/ryan/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/notebook/services/contents/handlers.py", line 126, in get
    path=path, type=type, format=format, content=content,
  File "/home/ryan/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/notebook/services/contents/filemanager.py", line 350, in get
    model = self._notebook_model(path, content=content)
  File "/home/ryan/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/notebook/services/contents/filemanager.py", line 310, in _notebook_model
    self.mark_trusted_cells(nb, path)
  File "/home/ryan/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/notebook/services/contents/manager.py", line 447, in mark_trusted_cells
    trusted = self.notary.check_signature(nb)
  File "/home/ryan/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/nbformat/sign.py", line 220, in check_signature
    if self.db is None:
  File "/home/ryan/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/traitlets/traitlets.py", line 439, in __get__
    value = self._validate(obj, dynamic_default())
  File "/home/ryan/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/nbformat/sign.py", line 126, in _db_default
    db = sqlite3.connect(self.db_file, **kwargs)
sqlite3.OperationalError: unable to open database file

当我尝试创建一个新笔记本时，我收到另一个错误消息， Unexpected error while saving file: Dropbox/iPython Notebooks/Untitled.ipynb [Errno 13] Permission denied: '/home/ryan/.local/share/jupyter/notebook_secret'这似乎提供了更多信息，但我对 Linux/python/所有这些东西都比较陌生。

终端给出：

Error while saving file: Dropbox/iPython Notebooks/Untitled.ipynb [Errno 13] Permission denied:     '/home/ryan/.local/share/jupyter/notebook_secret'
Traceback (most recent call last):
  File "/home/ryan/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/traitlets/traitlets.py", line 432, in __get__
    value = obj._trait_values[self.name]
KeyError: 'secret'

During handling of the above exception, another exception occurred:

Traceback (most recent call last):
  File "/home/ryan/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/notebook/services/contents/filemanager.py", line 387, in save
    self.check_and_sign(nb, path)
  File "/home/ryan/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/notebook/services/contents/manager.py", line 431, in check_and_sign
    self.notary.sign(nb)
  File "/home/ryan/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/nbformat/sign.py", line 245, in sign
    signature = self.compute_signature(nb)
  File "/home/ryan/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/nbformat/sign.py", line 195, in compute_signature
    hmac = HMAC(self.secret, digestmod=self.digestmod)
  File "/home/ryan/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/traitlets/traitlets.py", line 439, in __get__
    value = self._validate(obj, dynamic_default())
  File "/home/ryan/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/nbformat/sign.py", line 173, in _secret_default
    self._write_secret_file(secret)
  File "/home/ryan/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/nbformat/sign.py", line 179, in _write_secret_file
    with io.open(self.secret_file, 'wb') as f:
PermissionError: [Errno 13] Permission denied: '/home/ryan/.local/share/jupyter/notebook_secret'

有人建议我包含python -c "import IPython; print(IPython.sys_info())"的输出，所以这里是：

{'commit_hash': 'f534027',
 'commit_source': 'installation',
 'default_encoding': 'UTF-8',
 'ipython_path': '/home/ryan/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/IPython',
 'ipython_version': '4.0.0',
 'os_name': 'posix',
 'platform': 'Linux-3.19.0-33-generic-x86_64-with-debian-jessie-sid',
 'sys_executable': '/home/ryan/anaconda3/bin/python',
 'sys_platform': 'linux',
 'sys_version': '3.5.0 |Anaconda 2.4.0 (64-bit)| (default, Oct 19 2015, '
                '21:57:25) \n'
                '[GCC 4.4.7 20120313 (Red Hat 4.4.7-1)]'}

如前所述，我不是计算问题的专家。我希望我没有做蠢事。我尝试卸载并重新安装 anaconda、不同版本的 python、重新启动计算机，我还尝试了在https://github.com/ipython/ipython/issues/2097和这里找到的解决方案https://github.com /ipython/ipython/issues/8294因为它们看起来很相似。

资料来源

rtdew1

最有用的评论

我通过将 ~/.local/share/jupyter 目录的所有权从 root 更改为 user 解决了这个问题。我不知道为什么会出现这个问题，因为它在我的其他系统上没有发生，所以也许这是一个错误，我将把它留在这里。

rtdew1 于 2015-11-18

👍33 ❤4 🎉4 😄2

所有33条评论

rtdew1 于 2015-11-18

👍33 ❤4 🎉4 😄2

我刚刚进行了全新安装并遇到了同样的问题。

此修复程序仍然有效。

wmvoje 于 2016-02-22

我在“jupyter notebook --ip 0.0.0.0”之前使用了“sudo”，它对我有用。

NicoSabbath 于 2016-04-16

👎21 👍10 ❤2

@metallikapo当我做同样的

tpoisot 于 2016-04-27

是的，我们不建议使用sudo运行笔记本服务器。这也会导致笔记本中的所有代码以 root 身份运行。正如@rtdew1发现的那样，将相关文件/目录更改为您的用户拥有是更好的做法。我不确定这种情况是如何产生的。

takluyver 于 2016-04-27

我在 mac 中使用了 sudo jupyter notebook，它也适用于我的系统。

pawanvirsingh 于 2016-10-22

@metallikapo非常感谢

ghost 于 2017-04-03

我在 mac 中使用了 sudo jupyter notebook，它也适用于我的系统。

@metallikapo非常感谢

同样，我们不建议使用 sudo 运行，并且 notebook 5.0 默认拒绝以 root 身份启动，因此这不是解决方案。

Carreau 于 2017-04-03

你用的什么命令？ jupyter notebook打开笔记本？我对jupyter notebook也有同样的问题。但是使用命令jupyter-notebook代替我解决了这个问题。

XuuLiu 于 2017-04-29

你如何更改 jupyter notebook 的所有权？

nakpok6 于 2017-09-20

👍2

那么更好的解决方案是什么？ @Carreau

yuli-yl 于 2017-11-20

更好的解决方案是修复权限，以便 Jupyter 可以在您的常规用户帐户中运行。很难为此给出准确的说明，因为有不同的事情可能会出错并导致类似的错误。但总的来说，你会想要做这样的事情：

查看您收到的“权限被拒绝”错误消息，并查看它所指的文件。如果它在您的主目录下（Linux 上/home/username ，Mac 上/Users/username ），则这些说明适用。如果它在其他地方，问题可能会有所不同。
打开终端，将cd转到包含该文件的文件夹。
运行ls -l以查看那里的所有文件。如果文件在那里，您可能会看到它的所有者是root ，而不是您自己的用户名。这是最常见的问题。如果文件不存在，它可能无法创建它 - 上一级并在目录上尝试相同的操作。
运行sudo chown username:username filename将文件的所有者（和组）更改为您自己的用户。如果您在目录上执行此操作，请使用-R标志也更改其中的所有文件。

您也可以从文件管理器执行此操作，但是有很多不同的管理器，因此我们不会给出说明。

takluyver 于 2017-11-20

👍9 😄1

（如果不清楚，请在这些说明中将username替换

takluyver 于 2017-11-20

我在 pynq FPGA 的 Linux 系统上运行，这完美地解决了我的问题，谢谢！ @takluyver

yuli-yl 于 2017-11-21

嗨，托马斯，

我在 Jupyter notebook 中执行代码后，遇到了另一个
问题：IPython dir ~/.ipython 不是可写位置，使用临时文件
目录。

你知道出了什么问题吗？

最好的事物，

于丽
计算机科学与工程，
香港中文大学,
香港沙田

2017-11-20 21:01 GMT+08:00 Thomas Kluyver [email protected] ：

（如果不清楚，请将 username 替换为您自己的用户名
那些说明）
—
您收到此消息是因为您发表了评论。
直接回复本邮件，在GitHub上查看
https://github.com/ipython/ipython/issues/8997#issuecomment-345688870 ，
或静音线程
https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AbRY_MLFebh-Y8ruW-vIi-e5ZJHy8H4aks5s4XgjgaJpZM4GkQxG
.

yuli-yl 于 2017-11-21

检查~/.ipython的权限，并尝试sudo chown username:username ~/ipython ，还要检查：

$ ls -al ~/
drwxr-xr-x    14 <username>  <usergroup>         476 Oct  9 05:30 .ipython

特别是第一列以drwx开头，如果不是，您可能需要sudo chmod o+w ~/.ipython 。凡o+w手段将W仪式权限至O wner。

Carreau 于 2017-11-21

👍1

最好将该文件夹chown归您的用户所有。使用chmod 777意味着任何用户都可以读取或写入它。我们确实在那里存储了一些秘密信息，例如用于跟踪受信任笔记本的数据库。

takluyver 于 2017-12-11

👍1

这个命令对我有用：
cd ~ && sudo chown用户名：用户名.local/share/
记得用你自己的用户名替换用户名

liwg06 于 2018-01-28

👍1

@liwg06
这是正确的做法。谢谢！

cd ~ && sudo chown用户名：用户名.local/share/

然而，
这对我来说还不够。我不得不回到 .local。

rbhambriiit 于 2018-02-09

在 Fedora 的情况下，您可能还想执行以下操作：
sudo chown -R user:user /run/user/1000/jupyter/

FractalMatter 于 2018-04-20

适合我的 Debian 解决方案：
在 /run/user/1000/jupyter/ 文件夹中：
chmod -R 0755用户：用户

仅授予读取权限并不能解决我的权限错误。

fronchetti 于 2018-05-12

我遇到了同样的问题，然后我发现当我运行 pip3 install jupyter 命令时，它会在当前目录中安装 jupyter，这是一个根级目录，如果我将该目录的所有者更改为普通用户，那将会很糟糕该目录用于 root ，我刚刚卸载了 jupyter 并将其重新安装在我的主目录中，一切对我来说都很完美

pranayj78 于 2018-05-13

我是一个 win10 用户，尽管我已经是上述目录的所有者，但我还是收到了这个错误。

kelvinwop 于 2018-05-16

所以不确定这是否会为每个人解决问题。我有同样的错误，没有一个解决方案对我有用。我使用 juypter --path 检查存储 jupyter 的路径。
将有一个按配置、数据和运行时分类的路径列表。我 cd 进入 config 下的路径，
看起来像这样
c:\users\dn.user\appdata\local\programs\python\python37\etc\jupyter
将目录更改为此处后
我再次运行 jupyter，没有错误。希望这有助于某人

Mazior 于 2018-07-26

👍1

Windows 用户呢？？

dhruveshsheladiya 于 2018-08-06

也许我应该更好地澄清。我是 Windows 用户，我使用的是普通命令行

Mazior 于 2018-08-07

👍1

我的意思是我使用的是 AWS WorkSpace，但由于 AWS 工作区的内部结构，我遇到了一些奇怪的文件位置问题！！后来才知道！！但是您能否提供解决方案和相对路径来解决文件创建和保存文件的“权限被拒绝”问题！！

dhruveshsheladiya 于 2018-08-08

Mazior 的方法帮助我修复了它。谢谢！

LightHub01 于 2018-08-16

与（XuuLiu 在 2017 年 4 月 29 日评论）相同：使用 Ubuntu 18.04 LS，
使用命令 jupyter-notebook 代替我解决了这个问题。

musiscient 于 2018-08-30

以上都没有解决它，但我 chown 用户所有的 sub /.ipynb-checkpoints 并且成功了。

anna-knez 于 2018-09-12

对于 Windows 用户：

您需要运行 Anaconda 提示以管理员身份

hesamjafarian 于 2018-09-20

我的记忆是满满的。我移动了一些东西，现在它工作正常。

abhimanyu3 于 2018-09-20

和我的问题类似，当我使用jupyter notebook命令启动服务器时，它可以运行。

ubuntu@ip-172-31-48-131:~/ssl$ jupyter notebook
[I 05:32:07.950 NotebookApp] Loading IPython parallel extension
[I 05:32:07.952 NotebookApp] Serving notebooks from local directory: /home/ubuntu/ssl
[I 05:32:07.952 NotebookApp] The Jupyter Notebook is running at:
[I 05:32:07.952 NotebookApp] https://(ip-172-31-48-131 or 127.0.0.1):8888/
[I 05:32:07.952 NotebookApp] Use Control-C to stop this server and shut down all kernels (twice to skip confirmation).

但是我在 Chrome 浏览器中通过 localhost URL 访问服务器，然后出现错误。

ERROR:asyncio:Exception in callback BaseAsyncIOLoop._handle_events(4, 1)
handle: <Handle BaseAsyncIOLoop._handle_events(4, 1)>
Traceback (most recent call last):
  File "/usr/lib/python3.6/asyncio/events.py", line 145, in _run
    self._callback(*self._args)
  File "/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/tornado/platform/asyncio.py", line 122, in _handle_events
    handler_func(fileobj, events)
  File "/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/tornado/stack_context.py", line 300, in null_wrapper
    return fn(*args, **kwargs)
  File "/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/tornado/netutil.py", line 262, in accept_handler
    callback(connection, address)
  File "/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/tornado/tcpserver.py", line 263, in _handle_connection
    do_handshake_on_connect=False)
  File "/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/tornado/netutil.py", line 565, in ssl_wrap_socket
    context = ssl_options_to_context(ssl_options)
  File "/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/tornado/netutil.py", line 540, in ssl_options_to_context
    context.load_cert_chain(ssl_options['certfile'], ssl_options.get('keyfile', None))
PermissionError: [Errno 13] Permission denied

我的系统信息

Distributor ID: Ubuntu
Description:    Ubuntu 18.04.1 LTS
Release:        18.04
Codename:       bionic

我的解决方案：使用sudo jupyter notebook --allow-root命令而不是jupyter notebook命令来启动服务器。（我不知道它为什么起作用，但它确实对我有用。）

# ubuntu@ip-172-31-48-131:~/ssl$ jupyter notebook
 ubuntu@ip-172-31-48-131:~/ssl$ sudo jupyter notebook --allow-root

Q10Viking 于 2018-09-24

此页面是否有帮助？

0 / 5 - 0 等级

Ipython: 无法打开或创建新的 Jupyter 笔记本

最有用的评论

所有33条评论

相关问题