Scikit-learn: Mejorar el diseño de clases para AgglomerativeClustering y FeatureAgglomeration (estaba pooling_func en AgglomerativeClustering no funciona)

Creado en 28 sept. 2017 · 3Comentarios · Fuente: scikit-learn/scikit-learn

Descripción

pooling_func en AgglomerativeClustering no funciona.

Pasos / Código para reproducir

from sklearn import metrics
from sklearn.datasets.samples_generator import make_blobs
from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering


centers = [[1, 1], [-1, -1], [1, -1]]
X, labels_true = make_blobs(n_samples=300, centers=centers, cluster_std=0.5,
                            random_state=0)

model = AgglomerativeClustering(linkage='complete',
                                connectivity=None,
                                affinity = 'cosine',
                                pooling_func = "test_error",
                                n_clusters=3)
model.fit(X)

Resultados previstos

Genere el error porque pooling_func no se puede llamar. Es una cuerda.

Resultados actuales

Sin advertencia, sin error

Versiones

Linux-4.4.0-64-generic-x86_64-con-debian-stretch-sid
Python 3.5.3 | empaquetado por conda-forge | (predeterminado, 9 de febrero de 2017, 14:37:12)
[GCC 4.8.2 20140120 (Red Hat 4.8.2-15)]
NumPy 1.13.1
CIENCIA 0.19.1
Scikit-Learn 0.19.0

Easy help wanted

Fuente

yinruiqing

Todos 3 comentarios

Me parece que esto es un problema de diseño de clase: FeatureAgglomeration se deriva de AgglomerativeClustering pero pooling_func solo se usa en AgglomerativeClustering.transform.

Siéntete libre de abrir un PR. No he mirado en detalle, pero una posible solución sería que FeatureAgglomeration y AgglomerativeClustering deriven de una clase base común y tener pooling_func solo en FeatureAgglomeration.

Dicho esto, puede haber razones por las que se hizo así, aunque no puedo pensar en ninguna.

lesteve en 28 sept. 2017

(Y FeatureAgglomeration probablemente debería ser una envoltura o una mezcla ...)

El 28 de septiembre de 2017 a las 21:24, "Loïc Estève" [email protected] escribió:

Me parece que esto es un problema de diseño de clase: FeatureAgglomeration
deriva de AgglomerativeClustering pero pooling_func solo se usa en
AgglomerativeClustering.transform.
Siéntete libre de abrir un PR. No he mirado en detalle pero una posible solución.
sería tener FeatureAgglomeration y AgglomerativeClustering derivar
de una clase base común y tener pooling_func solo en FeatureAgglomeration.
Habiendo dicho que puede haber razones por las que se hizo así, aunque yo
no puedo pensar en ninguno.
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