Devtools: namespace tidak menghapus informasi lama ketika @importFrom berubah

Apakah Anda menggunakan roxygen2 versi terbaru? Itu harus membuat ulang file NAMESPACE dari awal setiap saat.

Ya, saya menggunakan roxygen2 v3.0.0

info sesi()
R versi 3.0.2 (2013-09-25)
Platform: x86_64-apple-darwin10.8.0 (64-bit)

lokal:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8

paket dasar terlampir:
[1] stats grafik dataset grDevices utils metode dasar

paket terlampir lainnya:
[1] plyr_1.8 ...
ekstrafont_0.15
[25] roxygen2_3.0.0 testthat_0.7.1
[27] devtools_1.4.1

dimuat melalui namespace (dan tidak dilampirkan):
[1] biglm_0.9-1 boot_1.3-9 brew_1.0-6 cluster_1.14.4 codetools_0.2-8
[6] colorspace_1.2-4 corrplot_0.73 data.table_1.8.10 dichromat_2.0-0 digest_0.6.4
[11] evaluasi_0.5.1 format ekstrafontdb_1.0R_0.10 Rumus_1.1-1 ggplot2_0.9.3.1
[16] gmp_0.5-11 grid_3.0.2 gtable_0.1.2 Hmisc_3.13-0 httr_0.2
[21] pelabelan knitr_1.5_0.2 lattice_0.20-24 lubridate_1.3.3 MASS_7.3-29
[26] memoise_0.1 munsell_0.4.2 parallel_3.0.2 proto_0.3-10 R.cache_0.9.0
[31] R.methodsS3_1.5.2 R.oo_1.15.8 R.utils_1.28.4 RColorBrewer_1.0-5 RCurl_1.95-4.1
[36] reshape2_1.2.2 rjson_0.2.13 Rttf2pt1_1.2 scales_0.2.3 splines_3.0.2
[41] stringr_0.6.2 survival_2.37-4 tools_3.0.2 whisker_0.3-2 xtable_1.7-1

Apakah Anda yakin tidak punya <strong i="5">@importFrom</strong> x y lain di tempat lain?

Tidak ada yang jelas, tetapi sepertinya saya harus memiliki sesuatu yang tertinggal di tempat yang tidak saya harapkan. Saya akan terus mencari; maaf mengganggu.

Saya membuka kembali masalah ini karena saya dapat membuat MWE yang menghasilkan kesalahan yang terkait dengan @importFrom (walaupun saya tidak sepenuhnya yakin terkait dengan posting asli saya).

Saya membuat paket kerangka dengan file barebone dan hanya mengedit file help.R , yang sangat sederhana:

#' <strong i="9">@docType</strong> package
#'
#' <strong i="10">@importFrom</strong> plyr ddply
NULL

Ketika saya memanggil document(package_directory, clean = TRUE) (di mana package_directory adalah variabel yang memegang jalur ke paket), semuanya berfungsi dengan baik. Sekarang, saya mengubah help.R menjadi:

#' <strong i="17">@docType</strong> package
#'
#' <strong i="18">@importFrom</strong> plyr
NULL

dan panggil document(package_directory, clean = TRUE) , yang menyebabkan kesalahan, seperti yang diharapkan:

Error in asChar(ivars) : 
  empty name in directive 'importFrom' in 'NAMESPACE' file

Sekarang, mari kembali dan perbaiki help.R sehingga kembali ke aslinya:

#' <strong i="27">@docType</strong> package
#'
#' <strong i="28">@importFrom</strong> plyr ddply
NULL

Ketika saya menelepon document(package_directory, clean = TRUE) , secara mengejutkan saya masih mendapatkan kesalahan yang saya dapatkan ketika bangkrut help.R . Saya akan berpikir itu akan bekerja dengan baik di sini karena document mengabaikan file NAMESPACE .

Sentuhan tambahan adalah jika alih-alih menggunakan document setelah merusak sesuatu, saya menggunakan roxygenize , itu berfungsi dengan baik.

Menurut dokumentasi roxygen , "Jika Anda memiliki paket sederhana, Anda dapat menggunakan roxygenise() , tetapi untuk hal yang lebih rumit, saya sarankan Anda menggunakan document() ." Jadi, mengapa document tidak berfungsi di sini tetapi roxygenize berfungsi? Dan kapan masing-masing harus digunakan?

Adapun versi, saya up to date:

> sessionInfo()
R version 3.0.3 (2014-03-06)
Platform: x86_64-apple-darwin10.8.0 (64-bit)

locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8

attached base packages:
[1] stats     graphics  datasets  grDevices utils     methods   base     

other attached packages:
[1] plyr_1.8.1     extrafont_0.16 roxygen2_3.1.0 testthat_0.8.1 devtools_1.4.1

Ah, masalahnya adalah document() pertama-tama harus menjalankan load_all() untuk memuat paket, dan setelah Anda merusak namespace, tidak ada cara untuk memuatnya. Dalam skenario ini saya biasanya hanya membatalkan perubahan di git.

hapus file namespace dan lakukan load_all() dan kemudian lakukan devtools::document(). Itu harus melakukan pekerjaan.

Masalah lama ini telah dikunci secara otomatis. Jika Anda yakin telah menemukan masalah terkait, harap ajukan masalah baru (dengan reprex) dan tautkan ke masalah ini. https://reprex.tidyverse.org/