Ipython: ノートブックの「すべて実行」が％matplotlibqtでハングする

WindowsのminicondaからPython2.7をインストールした場合にも同様のことがわかります。 最初のセルが次のノートブックを持っている場合：

%pylab

「すべて実行」は、その特定のセルを手動で実行した後でも、常にハングします。 この後、ノートブックが何かに応答するようにするには、カーネル->再起動する必要があります。 私の回避策は、そのセルを手動で実行し、次のセルに移動してから「以下ですべて実行」することです。

また、これをさらに追跡するのに役立つ詳細情報を提供できることをうれしく思います。

これを確認することもできます（最初のセルに%matplotlibといくつかのインポート（実行に時間がかかる）の両方があり、次のセルと一緒に実行したい場合はかなり面倒です）。

これを再現する簡単な方法：

1. 2つのセルを備えたノートブック：

%matplotlib import time time.sleep(10)

print "This will not print"

1. 両方を同時に実行します（Shiftキーを押しながらEnterキーを2回押します）
2. 最初のセルは実行されますが、カーネルがハングします（2番目のセルは実行されず、何も実行できませんが、インジケーターはカーネルの準備ができていることを示します）。

したがって、必ずしも「すべて実行」に関連しているわけではなく、1つのセルに%matplotlibがある複数のセルを実行することだけに関連しています。

IPython 2.1、Windows 64ビット、Firefox31で最後にテストしました

もう少し実験した後、この問題がバージョン2.0.0で最初に現れたことがわかりました。 バージョン1.2.1にロールバックした場合

conda install ipython=1.2.1

問題はなくなります。

Windows 32ビット、Python 2.7.7、Firefox 31

私もこのバグに遭遇し、 Windows 8、IPython2.3.1でPython3.4.1、Anaconda 2.1.0（64ビット）を使用して再現できます
これはかなり厄介なバグです。 それを追跡するために私にできることはありますか？ 4.0マイルストーンは（おおよそ）いつ完了すると予想されますか？

Linux Mint 17、python 3.4、matplotlib 1.4.0でgithub（e2778c5f4047d03f5f025bd53d1704a0cf9f0337）の最近のipythonバージョンを使用してバグを確認します。

この人に関するニュースはありますか？ 必要に応じて、さらにテストを行うことができます。 このバグは本当に迷惑です!!!

これは私にも起こることを確認できます。CentOSw/ python2.7とmatplotlib1.4.4で常に起こります。

セルを手動で実行すると機能しますか？

上記の私のコメント（https://github.com/ipython/ipython/issues/5629#issuecomment-50603511）を参照してください。複数のセルを手動で実行した場合にも表示されます

はい-基本的にはタイミングの問題だと思います。 Shift + Enterでセルを実行し、1秒待ってから、他のセルを続行すると、機能します。 Shift + Enterを繰り返し押すと、ハングします。 さらにセルを実行しても、コードは実際には実行されません（右上の小さな円はまだ空です）。

^それは私が観察したことでもあります。

Ipython Notebook3.1.0で検証済み。 回避策：

import time
%matplotlib
time.sleep(1)

醜いですが、すべてを実行するオプションをあきらめるのは面倒です。

これを自分のマシンでも動作させることができました。

7:02で金、2015年6月12日には、quicknir [email protected]は書きました：

Ipython Notebook3.1.0で検証済み。 回避策：

インポート時間
％matplotlib
time.sleep（1）

醜いですが、すべてを実行するオプションをあきらめるのは面倒です。

—
このメールに直接返信するか、GitHubで表示してください
https://github.com/ipython/ipython/issues/5629#issuecomment-111502934 。

これを4.1（または5.0）でマイルストーン化できますか？
ノートブックをぶら下げることは、ウィッシュリストのマイルストーンにふさわしいよりも少し厳しいように聞こえます（私には）。 また、このバグは、matplotlibを使用するときに厄介です（回避策にもかかわらず）。

理由がわかるまで、回避策としてmatplotlibマジック自体にsleep(1)を含める必要がありますか？

：+1：

睡眠の回避策が私にとってうまくいくことはめったにありません。 私はそれが数回動作するのを見ましたが、私がそれを試したほとんどの場合、ノートブックはまだハングしています。

私にとって一貫して機能する唯一の回避策は、次のとおりです。

1. ％matplotlibを含むセルを手動で実行します
2. カーネルアイドルの表示を待つ
3. 次のセルを選択します
4. 「以下をすべて実行」

FWIWこれを少しテストして、これがどの程度うまく機能するかをより合理的に見積もろうとしました。

次の3つのセルでノートブックを作成しました。

import time

%matplotlib qt
time.sleep(1)

with open("test_log.txt", "a") as fid:
    fid.write("it worked\n")

その後、シェルで実行されました：

for i in {1..100}; do
    ipython nbconvert --execute test_qt.ipynb  --inplace;
done
wc -l test_log.txt

このテストは正しいコードを実行していない可能性がありますが、問題なく機能しているようです。

4.1とマークされているので、それを確認します。

ありがとうございました。
@mwaskomの再現を試したところ、同じ結果が得られました。 しかし、その後、時間とスリープのコードを取り除いて、シェル部分を再度実行すると、それは_また_機能しました！ したがって、これは適切な再現手順（または内部回避策）ではないようです。 ：-/
また、 @ tanderlのように、睡眠の回避策が一貫して機能しないこともわかりました。 これは、Ubuntu64ビットのipython3.2.1にあります。 明日はWindowsでも同じことができます。

Windows 8.1では、Anaconda経由でインストールされたIpython 3.2.0を使用して、スリープの回避策が機能しないこともわかりました。つまり、matplotlibマジックのRunと同じセルにsleep(1) （またはそれ以上の値）がある場合です。新しく再起動したカーネルのすべては、次のセルに星が付いたままハングします（または何もせず、UIは引き続き機能します）。 セルを1つずつ手動で実行し、その間に待機しても、引き続き機能します。

LinuxMintの更新されたanacondaスタックで

こんにちは、
私はちょうど同様の問題を経験しました。 ％matplotlibインラインまたはノートブックマジックを使用するノートブックを実行すると、「すべてのセルを実行」がハングすることがあり、すべてのセルを手動で実行する必要があります。
Windows 7、Python 3.5、IPython 5.1.0、Notebook 4.1.0、matplotlib1.5.3を実行しています。
回避策として、すべての出力をクリーンアップすると、機能するようです。 残念ながら、再生可能なノートブックを提供することはできません（将来これに遭遇した場合は提供します）。

宜しくお願いします、
フロリアン

これは、jupyterノートブックとラボの両方でまだ問題になっています。

@thomasaarholt信頼できる複製手順はありますか？

@bilderbuchiはこの号の元の投稿を参照してください、それはまだ同じ問題です。 これが私のマシンでこれを再現したGIFです（OSX w /最新のjupyterとqt4）

@Carreau 、その再現は十分に機能しますか？ ぶら下がっているバグは「ウィッシュリスト」よりも緊急である必要がありますか？

@bilderbuchi @Carreau 、ウィッシュリストタグを見つけました。
このバグの優先度をはるかに高くする必要があることを主張したいと思います。

多くの新しいjupyterユーザーは、既存のノートブックでjupyterの使い方を学びます。 たとえば、プラグインが提供するサンプルワークブックを実行しようとします。 現在の動作では、[すべて実行]コマンドを使用するか、ノートブックをすばやく「Shift + Enter」するユーザーは、ノートブックが最初の瞬間からハングしていることに気付くでしょう。これにより、第一印象が非常に悪くなります。 このような印象は、コーディングを初めて学ぶ人や、過去に悪い経験（クラス/試験）を経験した人にとって、「複雑なコーディング」がいかに重要であるかを強調することがよくあります。

このバグの優先度をはるかに高くする必要があることを主張したいと思います。

さて、それはもはや優先順位の問題ではありません、バグは2年以上開いています、そして問題は誰もそれを理解することができないということです。 私たちはそれを理解しようとしましたが、それはとらえどころのない修正であるように思われ、周りのすべてのフレームワークイベントループとライブラリの専門家になることはできません。 喜んで何かをしたいと思いますが、この問題は長い間長引いているため、優先度の高いタグを付けても効果はありません。 何が起こっているのかを知っている開発者はいません。 そうでなければ、私たちはそれを修正したでしょう。

@Carreau ipythonコードのどこでカーネルサーバーとGUIの統合が行われるべきかを

プログラムでノートブックをブラウザで開き、すべてのセルを実行する方法はありますか？ それはおそらく、コードをgit bisectして、これを引き起こす変更を特定することを可能にするでしょう。
ターミナルからIPythonセッション内からnbconvert --executeを介して問題のあるノートブックを実行しようとしましたが、今のところハングさせることができませんでした。

@bilderbuchi最初に、自分のマシンでバグを「手作業で」再現できますか？

はい。 魔法のさまざまなバリエーションを試してみると、いくつかの興味深い行動が見つかりました
最初のセルの内容：

%matplotlib notebook -> works
%matplotlib inline -> works
%matplotlib -> prints Using matplotlib backend: Qt5Agg, then hangs
%matplotlib qt -> prints ModuleNotFoundError: No module named 'PyQt4' (I think that's a different unrelated bug)
%matplotlib qt5 -> prints nothing, then hangs

（ %matplotlib qt実行するときの別のバグは、ContinuumIO / anaconda-issues＃1068だと思います。）
2番目のセルには

print("This will not print")

上記で「ハング」と言った場合、2番目のセルの番号には常に「2」ではなく星が付いており、メッセージが出力されることはありません。
これらはすべてカーネルで実行されました-すべてを再起動して実行し、スレートをきれいにします。 これは、Windows 10、IPython 5.3.0、Firefox52.0.2のAnacondaを介したPython3.6.1にあります。

ipythonコードのどこでカーネルサーバーとGUIの統合が行われるべきかを教えていただけますか？

イベントループ統合がどのように機能するかについての説明はここにあります： http： //ipython.readthedocs.io/en/stable/config/eventloops.html#event -loops-in-the-kernel

そして、Qt 5イベントループのコードはここから始まります： https ：

確認するだけです-問題は間違いなく%matplotlibの「matplotlib」部分にあり、一般的な魔法ではありませんか？ 他の魔法の実行にかかる時間が短いため、バグが目立たなくなる場合に備えて。

この問題は%gui qtマジックでも発生しますが、状況によってはmatplotlibをインポートしようとしていると思うので、よくわかりません。

これは（直接）matplotlibや魔法とは何の関係もありません。 ショーを実行している1つのイベントループから別のイベントループにハンドオフする場合、これはほぼ確実に競合状態です。

私の推測では、 https：//github.com/ipython/ipython/pull/10301/filesへの同様の修正がここで必要なものだと思います。

Spyderを更新した後、同様の問題に直面しました

これが％guiqtでまだ発生していることを確認できます。 ノートブックから呼び出すQtのものがたくさんあり、それらのノートブックでは、最初のセルを手動で実行し、完了するのを待ってから、以下をすべて実行する必要があります。