Pecan: R 3.1.0 및 Mac OSX 10.9에 RPostgreSQL을 설치할 수 없음

최첨단 문제일 수 있습니다.

> install.packages('RMySQL', repos='http://cran.rstudio.com/')
Installing package into ‘/Users/sserbin/R/library’
(as ‘lib’ is unspecified)

   package ‘RMySQL’ is available as a source package but not as a binary

Warning in install.packages :
  package ‘RMySQL’ is not available (for R version 3.1.0)

Rob, http://postgresapp.com/ 에서 Postgres 빌드를 사용할 때 RPostgreSQL을 어떻게 설치했
pg_config http://iangow.wordpress.com/2014/05/09/installing-rpostgresql-with-r-3-1-0-mavericks-build/ 를 찾아야 할 것 같습니다.

그러나 우리는 .app 버전을 사용하기 때문에 MacPorts 버전과 같은 위치에 있지 않습니다. Mac에서 이와 관련된 문제가 발생했습니까? MacPorts 또는 .app 버전의 Postgres를 사용하고 있습니까?

이것을 시도, 여전히 운이 없습니다 .....

> Sys.setenv(PG_CONFIG='"/Users/sserbin/Library/Application Support/Postgres/var-9.3/postgresql.conf"')
> install.packages("~/Downloads/RPostgreSQL_0.4.tar.gz", repos = NULL, type="source")

MacPorts와 .app 버전을 둘 다 설치하고 싶지는 않지만... 아마도 이것이 문제가 아닐 수도 있습니다. 으악

터미널에 pg_config를 입력하면 어떻게 되나요?

찾지 못하면 터미널에서 루트로 다음을 실행할 수 있습니까?

echo "/Applications/Postgres93.app/Contents/MacOS/bin" > /etc/paths.d/postgresql

그러면 경로에 postgres 바이너리가 추가되고 새 터미널을 열고 pg_config를 입력합니다. 작동하면 R을 사용하여 postgresql을 설치하십시오.

더 많은 패키지를 설치하지 않고도 gdal, ncdf4 등을 컴파일할 수 없었으므로 3.1이 바이너리 패키지로 더 채워질 때까지 조금 기다리는 것이 좋습니다. 지금은 http://cran.r-project.org/bin/macosx/old/ 에서 언제든지 이전 버전(3.0.3)을 설치할 수 있습니다.

나는 또한이 문제가 있습니다. 나는 또한 그것을 해결하기 위해 3.0으로 롤백했다.

모든 패키지를 지원하기 때문에 지금은 3.0으로 롤백했습니다. 다른 옵션은 R-3.1.0-snowleopard.pkg를 사용하는 것입니다. R-3.1.0-snowleopard.pkg에는 새로운 XCode 컴파일러의 모든 새로운 기능이 포함되어 있지는 않지만(정확히 무엇인지 확실하지 않음) contrib 폴더에 더 많은 패키지가 있는 것 같습니다.

참고로,

1. R 3.0이 출시되었을 때도 마찬가지였습니다.
2. PostgreSQL을 설치하기 위해 psql을 설치할 필요는 없습니다. psql이 설치되어 있지 않은 R 3.0.2가 설치된 Windows 컴퓨터에서 이것을 테스트했습니다(패키지가 설치되고 작동합니다. 하지만 액세스 권한이 있는 유효한 서버와 암호를 사용해야 합니다(이 경우에는 ebi- 예측 및 ebi_production 각각)

install.packages("PostgreSQL") ## if this worked
library(PostgreSQL)
dbparms <- list(driver = "PostgreSQL", dbname = "ebi_production", user = "bety", host = "ebi-forecast.igb.illinois.edu", password = "bety")

### put correct settings below
x <- dbConnect(dbDriver("PostgreSQL"),dbname = "bety", user = "bety", host = "myremoteserver", password = "bety")
rs <- dbSendQuery(x, statement = "select count(*) from traits")
rs
data <- fetch(rs, n = -1)
data

같은 문제가 있었지만(이 문제는 인터넷 검색을 통해 찾았습니다) 작동합니다.

터미널에서 Google 코드 별로 다운로드

cd ~/Downloads
svn checkout http://rpostgresql.googlecode.com/svn/trunk/ rpostgresql-read-only

R에서 devtools를 사용하여 설치

library(devtools) # install.packages('devtools') if needed
install('~/Downloads/rpostgresql-read-only/RPostgreSQL')

rpostgresql 문제 #61 로 보고됨

이것은 rposqresql의 버그이므로 닫습니다. @bbest 를 게시

으....지금은 작동하지 않습니다.

130-199-9-232:pecan sserbin$ cd 스크립트/
130-199-9-232:스크립트 sserbin$ cd ~/다운로드
130-199-9-232: sserbin$ svn 체크아웃 다운로드 http://rpostgresql.googlecode.com/svn/trunk/ rpostgresql-read-only
svn: E175002: URL ' http://rpostgresql.googlecode.com/svn/trunk '의 저장소에 연결할 수 없습니다.
svn: E175002: ' http://rpostgresql.googlecode.com/svn/trunk '의 옵션: 상태 표시줄을 읽을 수 없습니다. 서버(http://rpostgresql.googlecode.com)에서 연결을 닫았습니다.
130-199-9-232: sserbin$ svn 체크아웃 다운로드 http://rpostgresql.googlecode.com/svn/trunk/ rpostgresql-read-only
svn: E175002: URL ' http://rpostgresql.googlecode.com/svn/trunk '의 저장소에 연결할 수 없습니다.
svn: E175002: ' http://rpostgresql.googlecode.com/svn/trunk '의 옵션: 상태 표시줄을 읽을 수 없습니다. 서버(http://rpostgresql.googlecode.com)에서 연결을 닫았습니다.

@serbinsh 이것은 코드를 체크아웃할 수 없는 옵션처럼 보입니다. 컴파일해서가 아닙니다. 내 Mac에서 코드를 잘 확인할 수 있습니다. 네트워크에 문제가 생길 수 있습니까?

이것을 시도했습니다 : http://computersandbuildings.com/how-to-install-rpostgresql-on-osx-mavericks/
불운. Mac에서 이 작업을 수행하려면 더 나은 방법이 있어야 합니다.

수정!
R: install.packages('DBI')

다운로드 소스: http://cran.r-project.org/web/packages/RPostgreSQL/index.html

pg_config를 가리킵니다.
sudo ln -s /Applications/Postgres.app/Contents/Versions/9.3/bin/pg_config /usr/local/bin/

그 다음에
sudo R CMD 설치 RPostgreSQL_0.4.tar.gz

http://computersandbuildings.com/how-to-install-rpostgresql-on-osx-mavericks/

*RPostgreSQL 버전이 변경됩니다.

이 오류를 검색하는 사람은 다음을 수행해야 할 수도 있습니다.
sudo ln -s /usr/local/Cellar/postgresql /usr/local/opt/postgresql
또는 homebrew를 사용하여 설치하는 경우 유사합니다. 그렇지 않으면 오류가 표시될 수 있습니다.
Library not loaded: /usr/local/opt/postgresql/lib/libpq.5.dylib 이유 때문에 image not found .
이 스레드의 상단에 표시된 libpq-fe.h not found 오류를 성공적으로 해결한 후에도.

나는 이것을 다음과 같이 고쳤다.
> install.packages('DBI')
$ brew install postgresql (불필요할 수 있음)
$ sudo ln -s /usr/local/Cellar/postgresql /usr/local/opt/postgresql

어느 쪽이 트릭을 수행했는지 확실하지 않지만 지금은 작동합니다.

나는 같은 문제가 있었고 문제를 해결하기 위해 libqp-dev 를 설치해야 했습니다.

sudo apt-get install libpq-dev

나는 같은 문제가 있었고 문제를 해결하기 위해 libqp-dev 를 설치해야 했습니다.

sudo apt-get install libpq-dev

감사합니다!