Pyradiomics: Questão de extração de recursos baseada em Voxel

Criado em 23 jul. 2020 · 3Comentários · Fonte: AIM-Harvard/pyradiomics

Oi,

Sou relativamente novo nisso e tenho muito pouca experiência em programação. Tenho extraído recursos 2D da linha de comando no Anaconda. Eu queria tentar extrair alguns recursos 3D, mas não consigo fazer isso. Tentei digitar:
piradiomics mri.nrrd segmentation.nrrd --mode voxel
assim como:
piradiomics mri.nrrd segmentation.nrrd -o results.csv -f csv --mode voxel

Nenhum dos dois parece estar funcionando. Estou fazendo algo errado? Não estou recebendo uma mensagem de erro, parece que ainda está em execução, embora eu o tenha deixado em execução por muito tempo.

Tentei digitar:
piradiomics mri.nrrd mri.nrrd --mode voxel
e isso funciona (usando a imagem original como máscara), mas quero usar a máscara que criei.

Qualquer ajuda seria apreciada.

Estou usando Python 3.7.4

question

Fonte

AT3432984

Comentários muito úteis

Se você não tem muita experiência em programação, pode ser mais fácil começar usando a extensão 3D Slicer, desde que você trabalhe em casos individuais. Depois de ganhar alguma familiaridade e otimizar a extração para seu caso de uso, os parâmetros de extração podem ser facilmente trazidos para a extração em lote.