Numpy: 使用 numpy 1.19 时的 Buggy Accelerate Backend

这是设计使然。 您是否阅读了错误消息？ 不清楚吗？

那么如何通过更新 Accelerate 后端来修复此错误？ 我进行了搜索，但认为我无法为我的 MacOS 更新它。

@billlyzhaoyh在 MacOS 上构建时请求使用 OpenBLAS。 使用根 repo 目录中的 site.cfg 来构建。

关闭。 我们强烈建议不要使用加速。

关闭。 我们强烈建议不要使用加速。

当然，我们如何不使用它？ 在我的 macOS 中运行简单的import numpy时，我遇到了同样的错误

如果您正在构建自己的 NumPy，请获取 OpenBlas。 您可以使用python3 tools/openblas_support.py下载用于构建官方轮子的那个。 如果您使用的是提供商的 NumPy，请询问他们为什么使用 Accelerate。

如果您正在构建自己的 NumPy，请获取 OpenBlas。 您可以使用python3 tools/openblas_support.py下载用于构建官方轮子的那个。 如果您使用的是提供商的 NumPy，请询问他们为什么使用 Accelerate。

我绝对不是自己建造的。 我正在使用 macOS，并运行pip3 install -U numpy ，所以我不确定您所说的“提供者”是什么意思。

Pip 可以在背后从源代码构建。 如果安装时间超过几秒钟，则可能正在编译。 要强制 pip 只使用二进制轮而不编译，请使用

pip3 install --upgrade --only-binary :all: <package>

您可以尝试卸载 numpy 并使用--only-binary :all:参数进行安装吗？

这为我解决了问题。 （我用pip3替换了pip ... 今天的 numpy 版本将是 1.19.1）
https://gist.github.com/yatsu/47bdde35e8abbe7d14bbe730342aa9e0#file -numpy-openblas-macos-pip-sh

编辑：如果要点被删除，请粘贴完整的解决方案:)

# Setup HomeBrew if not already installed: https://brew.sh/
brew install openblas
mkdir /tmp/numpy_local
cd /tmp/numpy_local
pip3 download --no-binary :all: --no-deps numpy
unzip numpy-*.zip  # (assuming there's only one version in this folder)
cd numpy-1.19.1 # the version may be a later version than this

cat > site.cfg <<EOF
[openblas]
libraries = openblas
library_dirs = $(brew --prefix openblas)/lib
include_dirs = $(brew --prefix openblas)/include
runtime_library_dirs = $(brew --prefix openblas)/lib
EOF

pip3 install .
# cleanup
cd /tmp
rm -rf numpy_local

一个稍微简单的解决方案：

$ rm -v ~/Library/Caches/pip/wheels/<em i="7">/</em>/<em i="8">/</em>/<em i="9">numpy</em> # clear the pip wheel cache of any built numpy wheels

根据https://twitter.com/pradyunsg/status/1317081239526936576?s=20现在可以使用内置的pip命令来完成：

$ pip cache remove numpy
$ brew install openblas # make sure OpenBLAS is installed
$ # activate your pypy3 virtualenv
$ OPENBLAS="$(brew --prefix openblas)" pip install numpy # let numpy's setup.py know where OpenBLAS is installed

这具有额外的好处，即不需要重新构建轮子，并且 pypy3 上的任何未来pip install numpy都将起作用。

撇开变通方法不谈，为什么默认构建行为会产生甚至不能import的损坏的轮子？ 无论哪种方式，构建这样一个损坏的工件似乎都是“设计使然”的错误； 构建结束时的自检如果发现自己处于这种状态就会中止，这将是一个受欢迎的补充。 （特别是如果它可以提供有用的错误消息，例如“try brew install openblas ”或类似的信息。）

在构建之后尝试导入听起来是个好主意。

如果找不到 openblas，为什么不干脆拒绝在 macOS 上构建？

除了 OpenBLAS 之外，还有各种有效的 blas 后端。 唯一无效的是加速。 不幸的是，macOS 没有提供一种方式来告诉我们他们正在提供 Accelerate，我们只能在运行时通过触发已知的错误计算来检测它。 如果您能弄清楚如何更早地检测 Accelerate，那就太好了。 到目前为止，我们最好的方法是检测符号链接，但这非常脆弱。

如果任何 python-poetry 用户遇到此线程，我只想补充一点，如果您将最后一行替换为OPENBLAS="$(brew --prefix openblas)" poetry add numpy ， @glyph的解决方案也同样有效

我已经尝试过以前版本的 numpy，它对我有用
pip3 安装 numpy==1.18.0

希望这有帮助

卸载并安装 1.18.0——对我有用！ 对以上内容点赞^^

我在这里报告使用 openblas 的建议不起作用。 这会崩溃：

OPENBLAS="$(brew --prefix openblas)" pip install numpy
python -c 'import numpy'

# =>  RuntimeError: Polyfit sanity test emitted a warning, most likely due to using a buggy Accelerate backend. If you compiled yourself, see site.cfg.example for information. Otherwise report this to the vendor that provided NumPy.

虽然这没有任何问题：

pip install numpy==1.18.0
python -c 'import numpy'

@fny检查输出以查看 pip 是否使用缓存轮。 在这种情况下，您可能需要清除缓存。

@fny有关更新说明，请参阅https://github.com/numpy/numpy/issues/15947#issuecomment -686159427

任何人都可以提供一个链接，让人们可以阅读为什么 Accelerate 是一种不应该使用的糟糕 BLAS 实现？ 我尝试在谷歌上搜索“为什么苹果加速不好”，但一无所获。

我不知道全面的故障在哪里，但 Accelerate 存在线程问题，一些错误的结果，并暴露了一个过时的 LAPACK 版本。

作为参考，此解决方案失败。 为什么这不起作用？ 为什么这一切都是必要的？

@orome至于“为什么”问苹果。 他们是你从他们那里购买系统的人，并且正在运送有缺陷的软件，而 NumPy 的主要志愿者团队必须解决这些问题。 任何愤怒都应该针对他们，而不是针对我们。

@orome至于“为什么”问苹果......任何愤怒都应该针对他们，而不是针对我们。

这绝对是（再次）导演的地方！

这为我解决了问题。 （我用pip3替换了pip ... 今天的 numpy 版本将是 1.19.1）
https://gist.github.com/yatsu/47bdde35e8abbe7d14bbe730342aa9e0#file -numpy-openblas-macos-pip-sh

编辑：如果要点被删除，请粘贴完整的解决方案:)

# Setup HomeBrew if not already installed: https://brew.sh/
brew install openblas
mkdir /tmp/numpy_local
cd /tmp/numpy_local
pip3 download --no-binary :all: --no-deps numpy
unzip numpy-*.zip  # (assuming there's only one version in this folder)
cd numpy-1.19.1 # the version may be a later version than this

cat > site.cfg <<EOF
[openblas]
libraries = openblas
library_dirs = $(brew --prefix openblas)/lib
include_dirs = $(brew --prefix openblas)/include
runtime_library_dirs = $(brew --prefix openblas)/lib
EOF

pip3 install .
# cleanup
cd /tmp
rm -rf numpy_local

这在某种程度上对我不起作用。 我从源代码编译了 OpenBLAS 并将其安装在/opt/OpenBLAS ，并用/opt/OpenBLAS替换了每次出现的$(brew --prefix openblas) /opt/OpenBLAS 。 我的 Python 3 安装来自 Xcode 命令行工具，所以我使用pip3 install --user .而不是pip3 install . 。 除此之外，我完全遵循了脚本。 但是，在我运行python3 -c "import numpy" ，错误消息与以前完全一样：

RuntimeError：Polyfit 健全性测试发出警告，很可能是由于使用了有问题的 Accelerate 后端。 如果您自己编译，请参阅 site.cfg.example 以获取信息。 否则，将此报告给提供 NumPy 的供应商。
RankWarning：Polyfit 可能条件不佳

任何想法为什么会发生这种情况？

pip install pandas
pip3 install pandas
pip3 install pandas --no-build-isolation --no-cache-dir
sudo pip3 install pandas --no-cache-dir

问题描述

我已经通过 Homebrew ( brew install python3 ) 完成了 macOS Big Sur 的全新安装和 Python3.9 的全新安装。 之后，我使用brew install pip命令安装了 pip3 并且我想安装 Pandas，但我总是收到以下错误。 我已经尝试使用上面列出的所有命令在 macOS Big Sur 和 Python3 上安装 Pandas ...

任何人都可以帮忙吗？ 这些是实际安装的唯一软件包：

套餐版本

点 20.2.4
设置工具 50.3.2
车轮 0.35.1

预期产出

pip install pandas

同样的问题，同样的错误

这在 MacOS 11.0.1 Big Sur 上对我有用， Python 3.8.2 ：

pip3 install --force-reinstall numpy\<1.19
pip3 install --upgrade wheel

brew install libjpeg # optional
pip3 install pillow # optional
pip3 install matplotlib

....

Successfully installed matplotlib-3.3.3 

此问题已关闭。 如果您将 MacOS 11 与从 HomeBrew 安装的 python 一起使用，则从 2020 年 11 月起，您应该使用brew install NumPy而不是pip install numpy 。 请不要在这里发表评论，如果仔细阅读 gh-17784 不能帮助您弄清楚发生了什么，请打开一个新问题。

这些步骤帮助我解决了这个问题：
https://gist.github.com/mohammadnassiri/31ca8f4f2298d8694a8327814631455c