Xgboost: 如何在 R (Mac OS) 中安装 OpenMP 版本

创建于 2016-04-22 · 3评论 · 资料来源: dmlc/xgboost

你好。

我需要一些帮助来理解在 R (Mac OS) 中安装 OpenMP 版本的说明。以下陈述让我感到困惑：

将 Makevars 文件设置为 R 的最高优先级。
关键是，有三个 Makevars ：~/.R/Makevars、xgboost/R-package/src/Makevars 和 /usr/local/Cellar/r/3.2.0/R.framework/Resources/etc/Makeconf (最后一个是通过运行 file.path(R.home("etc"), "Makeconf") in R) 得到的，默认没有设置 SHLIB_OPENMP_CXXFLAGS！！经过尝试，似乎第一个具有最高的优先级（惊讶！）。

“将 Makevars 文件设置为 R 的最高优先级”是什么意思？我该如何处理优先级？我该怎么做才能设置“SHLIB_OPENMP_CXXFLAGS”变量？

资料来源

choushishi

最有用的评论

就我而言，我必须设置更多CXX才能使其工作：

CC=gcc-7
CXX=g++-7
CXX1X=g++-7
CXX11=g++-7
CXX14=g++-7
CXX17=g++-7

SHLIB_OPENMP_CFLAGS= -fopenmp
SHLIB_OPENMP_CXXFLAGS= -fopenmp
SHLIB_OPENMP_FCFLAGS= -fopenmp
SHLIB_OPENMP_FFLAGS= -fopenmp

renkun-ken 于 2017-06-28

👍3

所有3条评论

回复：Makevars...我在 ~/.R/Makevars 中进行了更改。除了 SHLIB 标志之外，我还必须将编译器更改为“clang-omp”。对于编译器，我使用 brew 来安装支持 OpenMP 的 clang 版本。

jimthompson5802 于 2016-04-22

我终于通过使用从@jimthompson5802的答案修改的以下代码来实现这一点。代码放入~/.R/Makevars ：

CC=gcc-5
CXX=g++-5
CXX1X = g++-5

SHLIB_OPENMP_CFLAGS= -fopenmp
SHLIB_OPENMP_CXXFLAGS= -fopenmp
SHLIB_OPENMP_FCFLAGS= -fopenmp
SHLIB_OPENMP_FFLAGS= -fopenmp

在我的情况R.将搜索/Library/Frameworks/R.framework/Resources/etc/Makeconf为未定义必要的参数~/.R/Makevars 。它会尝试在Makeconf找到CXX1X的设置。所以这就是clang++编译器在我上一篇文章中的错误中

我收到一堆[-Wunused-variable]警告，但我想这很好。这次没有OpenMP is not available警告。

此外，由于我遵循了 mac os 的官方构建说明，因此我安装了 gcc，并使用它成功构建了“主”xgboost 之前的 OpenMP。因此，我建议任何像我一样遵循相同说明的人将Makevars设置为这样。

choushishi 于 2016-04-23

👍1

就我而言，我必须设置更多CXX才能使其工作：

CC=gcc-7
CXX=g++-7
CXX1X=g++-7
CXX11=g++-7
CXX14=g++-7
CXX17=g++-7

SHLIB_OPENMP_CFLAGS= -fopenmp
SHLIB_OPENMP_CXXFLAGS= -fopenmp
SHLIB_OPENMP_FCFLAGS= -fopenmp
SHLIB_OPENMP_FFLAGS= -fopenmp

renkun-ken 于 2017-06-28

👍3

此页面是否有帮助？

0 / 5 - 0 等级

Xgboost: 如何在 R (Mac OS) 中安装 OpenMP 版本

最有用的评论

所有3条评论

相关问题