Data.table: Gruppierungssätze

Erstellt am 5. Okt. 2015  ·  3Kommentare  ·  Quelle: Rdatatable/data.table

Einige Stichworte: GROUPING SETS, ROLLUP, CUBE, GROUPING
Einige Referenzen: postgres , Oracle , SQL Server , Gruppierungen kombiniert mit beliebigen Funktionen

_Sets gruppieren_ und Freunde sind nützlich, um verschiedene Aggregationsebenen vorzuberechnen, was oft gewünscht wird. Die API für diese Funktion in data.table ist nicht sehr benutzerfreundlich, siehe Aggregieren von Zwischensummen und Gesamtsummen mit data.table .

Im Fall von _rollup_ sind dies Aggregationen für bereitgestellte by von oben nach unten. Siehe Beschreibung von postgres man und Beispielcode unten.

ROLLUP ( e1, e2, e3, ... )

ist äquivalent zu:

GROUPING SETS (
    ( e1, e2, e3, ... ),
    ...
    ( e1, e2 )
    ( e1 )
    ( )
)

Ich frage mich, ob es eine billige Beschleunigung dieses Prozesses geben könnte? Dies ist eine potenziell schwere Rechenaufgabe. Es wäre toll, wenn die Berechnung der _Gruppierungsmengen_-Funktion in C entwickelt würde, damit alle _Rollup/Würfel_ und andere Funktionen auf _Gruppierungsmengen_ einfacher in R mit voller Geschwindigkeit aufgebaut werden könnten.


Antworten zum Aktualisieren, wenn geschlossen:

library(plyr)
grp.cols <- c("vs", "am", "gear", "carb", "cyl")
plyr.r = do.call(
    rbind.fill,
    lapply(1:length(grp.cols), function(x) ddply(mtcars, grp.cols[1:x], summarize, agg=mean(mpg)))
)

library(data.table) # 1.9.7+
dt.r = rollup(as.data.table(mtcars), j = .(agg=mean(mpg)), by=grp.cols)
all.equal(
    as.data.table(plyr.r),
    dt.r[-.N], # exclude grand total, not present in BrodieG answer
    ignore.row.order = TRUE,
    ignore.col.order = TRUE
)
#[1] TRUE
# install.packages("data.table", type = "source", repos = "https://Rdatatable.github.io/data.table")
library(data.table)
set.seed(1)
DT = data.table(
    group=sample(letters[1:2],100,replace=TRUE), 
    year=sample(2010:2012,100,replace=TRUE),
    v=runif(100))

cube(DT, mean(v), by=c("group","year"))
#    group year        V1
#1:     a 2011 0.4176346
#2:     b 2010 0.5231845
#3:     b 2012 0.4306871
#4:     b 2011 0.4997119
#5:     a 2012 0.4227796
#6:     a 2010 0.2926945
#7:    NA 2011 0.4463616
#8:    NA 2010 0.4278093
#9:    NA 2012 0.4271160
#10:     a   NA 0.3901875
#11:     b   NA 0.4835788
#12:    NA   NA 0.4350153
cube(DT, mean(v), by=c("group","year"), id=TRUE)
#    grouping group year        V1
#1:        0     a 2011 0.4176346
#2:        0     b 2010 0.5231845
#3:        0     b 2012 0.4306871
#4:        0     b 2011 0.4997119
#5:        0     a 2012 0.4227796
#6:        0     a 2010 0.2926945
#7:        2    NA 2011 0.4463616
#8:        2    NA 2010 0.4278093
#9:        2    NA 2012 0.4271160
#10:        1     a   NA 0.3901875
#11:        1     b   NA 0.4835788
#12:        3    NA   NA 0.4350153

# install.packages("data.table", type = "source", repos = "https://Rdatatable.github.io/data.table")

Auch einige andere Fragen können neue Antworten bekommen:

feature request

Hilfreichster Kommentar

Das ist einfach toll. Erleichtert das Arbeiten mit Pivot-Tabellen in Shiny.

Alle 3 Kommentare

+1

library(data.table) # version 1.10.5 required
dt = data.table(ggplot2::diamonds)
groupingsets(dt, c(lapply(.SD, mean), list(COUNT = .N)), 
     by = names(dt)[2:4], .SDcols = 5:10, id = FALSE,
     sets = as.list(names(dt)[2:4]))
          cut color clarity    depth    table    price        x        y        z COUNT
 1:     Ideal    NA      NA 61.70940 55.95167 3457.542 5.507451 5.520080 3.401448 21551
 2:   Premium    NA      NA 61.26467 58.74610 4584.258 5.973887 5.944879 3.647124 13791
 3:      Good    NA      NA 62.36588 58.69464 3928.864 5.838785 5.850744 3.639507  4906
 4: Very Good    NA      NA 61.81828 57.95615 3981.760 5.740696 5.770026 3.559801 12082
 5:      Fair    NA      NA 64.04168 59.05379 4358.758 6.246894 6.182652 3.982770  1610
 6:        NA     E      NA 61.66209 57.49120 3076.752 5.411580 5.419029 3.340689  9797
 7:        NA     I      NA 61.84639 57.57728 5091.875 6.222826 6.222730 3.845411  5422
 8:        NA     J      NA 61.88722 57.81239 5323.818 6.519338 6.518105 4.033251  2808
 9:        NA     H      NA 61.83685 57.51781 4486.669 5.983335 5.984815 3.695965  8304
10:        NA     F      NA 61.69458 57.43354 3724.886 5.614961 5.619456 3.464446  9542
11:        NA     G      NA 61.75711 57.28863 3999.136 5.677543 5.680192 3.505021 11292
12:        NA     D      NA 61.69813 57.40459 3169.954 5.417051 5.421128 3.342827  6775
13:        NA    NA     SI2 61.77217 57.92718 5063.029 6.401370 6.397826 3.948478  9194
14:        NA    NA     SI1 61.85304 57.66254 3996.001 5.888383 5.888256 3.639845 13065
15:        NA    NA     VS1 61.66746 57.31515 3839.455 5.572178 5.581828 3.441007  8171
16:        NA    NA     VS2 61.72442 57.41740 3924.989 5.657709 5.658859 3.491478 12258
17:        NA    NA    VVS2 61.66378 57.02499 3283.737 5.218454 5.232118 3.221465  5066
18:        NA    NA    VVS1 61.62465 56.88446 2523.115 4.960364 4.975075 3.061294  3655
19:        NA    NA      I1 62.73428 58.30378 3924.169 6.761093 6.709379 4.207908   741
20:        NA    NA      IF 61.51061 56.50721 2864.839 4.968402 4.989827 3.061659  1790

Das ist einfach toll. Erleichtert das Arbeiten mit Pivot-Tabellen in Shiny.

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