Pandas: ENH: рдкрд╛рдардХреЛрдВ рдХреЗ рд╕рд╛рде рдХрдИ рдЯрд┐рдкреНрдкрдгреА рдкрд╛рддреНрд░реЛрдВ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рд╕рдорд░реНрдерди

рдХреЛ рдирд┐рд░реНрдорд┐рдд 4 рдирд╡ре░ 2014  ┬╖  3рдЯрд┐рдкреНрдкрдгрд┐рдпрд╛рдБ  ┬╖  рд╕реНрд░реЛрдд: pandas-dev/pandas

рдореБрдЭреЗ рдмрд╣реБрдд рдЦреБрд╢реА рд╣реЛрдЧреА рдЕрдЧрд░ рдкрдВрдбреЛрдВ рдиреЗ рдлрд╛рдЗрд▓реЛрдВ рд╕реЗ рдбреЗрдЯрд╛ рдкрдврд╝рддреЗ рд╕рдордп рдХрдИ рдЯрд┐рдкреНрдкрдгреА рд╡рд░реНрдгреЛрдВ рдХрд╛ рд╕рдорд░реНрдерди рдХрд┐рдпрд╛ред рдХреЗ рдЕрдиреБрд╕рд╛рд░:

import pandas as pd
df = pd.read_table("data.dat", comment=("#","@"), delim_whitespace=True)

рдореБрдЭреЗ рдирд╣реАрдВ рдкрддрд╛ рдХрд┐ рдЗрд╕рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдорд╛рдореВрд▓реА рдпрд╛ рдмрдбрд╝реЗ рдХрд╛рд░реНрдпрд╛рдиреНрд╡рдпрди рдкреНрд░рдпрд╛рд╕ рдХреА рдЖрд╡рд╢реНрдпрдХрддрд╛ рд╣реИ рдпрд╛ рдирд╣реАрдВ?

рд╢реНрд░реЗрд╖реНрда,
рдПрд░рд┐рдХреЛ

рд╕рдмрд╕реЗ рдЙрдкрдпреЛрдЧреА рдЯрд┐рдкреНрдкрдгреА

рд╕рдореНрдмрдВрдзрд┐рдд:

рдмрд╣реБрдд рдЕрдЪреНрдЫрд╛ рд╣реЛрдЧрд╛ рдпрджрд┐ рдПрдХ рдЯрд┐рдкреНрдкрдгреА рдЪрд░рд┐рддреНрд░ рд╡рд╛рд╕реНрддрд╡ рдореЗрдВ рджреЛ рд╡рд░реНрдг рднреА рд╣реЛ рд╕рдХрддрд╛ рд╣реИ, рдЙрджрд╛рд╣рд░рдг рдХреЗ рд▓рд┐рдП "##"ред рдЙрджрд╛рд╣рд░рдг рдХреЗ рд▓рд┐рдП, рд╡реАрд╕реАрдПрдл рдлрд╛рдЗрд▓реЛрдВ рдореЗрдВ, рд╡рд╛рд╕реНрддрд╡рд┐рдХ рддрд╛рд▓рд┐рдХрд╛ рд╢реБрд░реВ рд╣реЛрдиреЗ рд╕реЗ рдкрд╣рд▓реЗ "##" рдХреЗ рд╕рд╛рде рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдХреА рд╢реБрд░реБрдЖрдд рдореЗрдВ рдХреБрдЫ рдореЗрдЯрд╛ рдбреЗрдЯрд╛ рдирд┐рд░реНрджрд┐рд╖реНрдЯ рдХрд┐рдпрд╛ рдЬрд╛рддрд╛ рд╣реИ:

http://www.internationalgenome.org/wiki/Analysis/vcf4.0/

рдЕрдХреНрд╕рд░ рдХреЛрдИ рдЗрдиреНрд╣реЗрдВ рдирдЬрд╝рд░рдЕрдВрджрд╛рдЬрд╝ рдХрд░рдирд╛ рдЪрд╛рд╣рддрд╛ рд╣реИ, рд▓реЗрдХрд┐рди:

df = pd.read_csv("data.vcf", comment="##")

рдХрд╛рдо рдирд╣реАрдВ рдХрд░рддрд╛ред рдзреНрдпрд╛рди рджреЗрдВ рдХрд┐ рд╡реАрд╕реАрдПрдл рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдпрд╣ рдХреЗрд╡рд▓ comment="#" рдХрд╛ рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд░рдиреЗ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдХрд╛рдо рдирд╣реАрдВ рдХрд░реЗрдЧрд╛ рдХреНрдпреЛрдВрдХрд┐ рд╣реЗрдбрд░ рд▓рд╛рдЗрди рд╡рд╛рд╕реНрддрд╡ рдореЗрдВ рдПрдХ "#" рд╕реЗ рд╢реБрд░реВ рд╣реЛрддреА рд╣реИред

рд╕рднреА 3 рдЯрд┐рдкреНрдкрдгрд┐рдпрд╛рдБ

рдпрд╣ рдПрдХ рдЫреЛрдЯрд╛ рд╕рд╛ рдкреНрд░рдпрд╛рд╕ рд╣реЛрдЧрд╛ред рдкрд╛рдардХ рдореВрд▓ рд░реВрдк рд╕реЗ рдмрд╛рдЗрдЯ рджреНрд╡рд╛рд░рд╛ рдмрд╛рдЗрдЯ (рдХреБрдЫ рдмреИрдХрд░реЗрдл рдХреНрд╖рдорддрд╛ рдХреЗ рд╕рд╛рде) рд╣реЛрддрд╛ рд╣реИред рддреЛ рдЗрд╕реЗ рдлрд┐рд░ рд╕реЗ рдЯрд┐рдкреНрдкрдгреА рд╡рд░реНрдгреЛрдВ рдХреЗ рдПрдХ рдмрдлрд░ рдХреА рдЬрд╛рдВрдЪ рдХрд░рдиреА рд╣реЛрдЧреА (рдпрд╣ рд╕рд┐рд░реНрдл рдПрдХ рдЪрд╛рд░ рдХреЗ рдЦрд┐рд▓рд╛рдл рдЬрд╛рдВрдЪ рдХрд░рддрд╛ рд╣реИ, рд▓реЗрдХрд┐рди рдХреЗрд╡рд▓ рддрднреА рдЬрдм рдпрд╣ рдиреНрдпреВрд▓ рдирд╣реАрдВ рд╣реЛрддрд╛ рд╣реИ), рдПрдХ рдкреНрд░рджрд░реНрд╢рдирдХрд╛рд░реА рддрд░реАрдХреЗ рд╕реЗред рдХрд┐рдпрд╛ рдЬрд╛ рд╕рдХрддрд╛ рдерд╛ред

рд╕рдореНрдмрдВрдзрд┐рдд:

рдмрд╣реБрдд рдЕрдЪреНрдЫрд╛ рд╣реЛрдЧрд╛ рдпрджрд┐ рдПрдХ рдЯрд┐рдкреНрдкрдгреА рдЪрд░рд┐рддреНрд░ рд╡рд╛рд╕реНрддрд╡ рдореЗрдВ рджреЛ рд╡рд░реНрдг рднреА рд╣реЛ рд╕рдХрддрд╛ рд╣реИ, рдЙрджрд╛рд╣рд░рдг рдХреЗ рд▓рд┐рдП "##"ред рдЙрджрд╛рд╣рд░рдг рдХреЗ рд▓рд┐рдП, рд╡реАрд╕реАрдПрдл рдлрд╛рдЗрд▓реЛрдВ рдореЗрдВ, рд╡рд╛рд╕реНрддрд╡рд┐рдХ рддрд╛рд▓рд┐рдХрд╛ рд╢реБрд░реВ рд╣реЛрдиреЗ рд╕реЗ рдкрд╣рд▓реЗ "##" рдХреЗ рд╕рд╛рде рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдХреА рд╢реБрд░реБрдЖрдд рдореЗрдВ рдХреБрдЫ рдореЗрдЯрд╛ рдбреЗрдЯрд╛ рдирд┐рд░реНрджрд┐рд╖реНрдЯ рдХрд┐рдпрд╛ рдЬрд╛рддрд╛ рд╣реИ:

http://www.internationalgenome.org/wiki/Analysis/vcf4.0/

рдЕрдХреНрд╕рд░ рдХреЛрдИ рдЗрдиреНрд╣реЗрдВ рдирдЬрд╝рд░рдЕрдВрджрд╛рдЬрд╝ рдХрд░рдирд╛ рдЪрд╛рд╣рддрд╛ рд╣реИ, рд▓реЗрдХрд┐рди:

df = pd.read_csv("data.vcf", comment="##")

рдХрд╛рдо рдирд╣реАрдВ рдХрд░рддрд╛ред рдзреНрдпрд╛рди рджреЗрдВ рдХрд┐ рд╡реАрд╕реАрдПрдл рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдпрд╣ рдХреЗрд╡рд▓ comment="#" рдХрд╛ рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд░рдиреЗ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдХрд╛рдо рдирд╣реАрдВ рдХрд░реЗрдЧрд╛ рдХреНрдпреЛрдВрдХрд┐ рд╣реЗрдбрд░ рд▓рд╛рдЗрди рд╡рд╛рд╕реНрддрд╡ рдореЗрдВ рдПрдХ "#" рд╕реЗ рд╢реБрд░реВ рд╣реЛрддреА рд╣реИред

рдпрд╣ рдореБрд╢реНрдХрд┐рд▓ рд╣реЛрдЧрд╛ред рдореИрдВ рдЗрд╕реЗ рдЕрднреА рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдмрдВрдж рдХрд░ рд░рд╣рд╛ рд╣реВрдБ

рдХреНрдпрд╛ рдпрд╣ рдкреГрд╖реНрда рдЙрдкрдпреЛрдЧреА рдерд╛?
0 / 5 - 0 рд░реЗрдЯрд┐рдВрдЧреНрд╕

рд╕рдВрдмрдВрдзрд┐рдд рдореБрджреНрджреЛрдВ

ericdf picture ericdf  ┬╖  3рдЯрд┐рдкреНрдкрдгрд┐рдпрд╛рдБ

swails picture swails  ┬╖  3рдЯрд┐рдкреНрдкрдгрд┐рдпрд╛рдБ

venuktan picture venuktan  ┬╖  3рдЯрд┐рдкреНрдкрдгрд┐рдпрд╛рдБ

Abrosimov-a-a picture Abrosimov-a-a  ┬╖  3рдЯрд┐рдкреНрдкрдгрд┐рдпрд╛рдБ

marcelnem picture marcelnem  ┬╖  3рдЯрд┐рдкреНрдкрдгрд┐рдпрд╛рдБ