Mpld3: xticksを使用する場合の「TypeError：***はJSONシリアル化可能ではありません」

ああ- mplexporterはxticksがリストであると誤って想定しているようです。 それはバグです。

それまでの間、xticksを手動でリストに変換すると、機能するはずです。

実際にはそうではありません。 つまり、以下は問題なく機能します。

fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, xticks=np.arange(11))
ax.plot([0, 10], [0, 10], '-k')
mpld3.show()

パンダはここでそのダニで奇妙なことをしています：エラーは2000がシリアル化できないことを示しています、これはクレイジーです。 パンダには、ある種の組み込みのシリアル化できない浮動小数点型がありますか？

それは2000年ではなく、年です。 datetime地獄へようこそ。
（2014年6月19日編集： datetimeが問題であるというのは間違っていたようです...）

うーん...どうすればいいのかわからない。 何かご意見は？

to_jsonでpandas to_jsonを使用するのに役立ちますか？

http://pandas.pydata.org/pandas-docs/dev/io.html#date -handling

パンダでto_jsonを使用するのに役立ちますか？

おそらく、しかしその後、コード内の多くのことに対してtry ... exceptステートメントを実行する必要があります（つまり、値がPandas変数の場合は、一方向に実行します。それ以外の場合は別の方法で）、javascript側の軸ラベルがPandasが出力することを決定したJSON構造を処理できることを確認します。 非常に壊れやすいソリューションであり、メンテナンスの悪夢のように聞こえるので、そのレベルの複雑さを追加したくありません。

そうですか。 これは、Pythonがユーザー定義クラスのjsonシリアル化メソッドを公開できないことに要約されます。 この問題を解決できます。

開いたままにしておく必要があります...これを処理するためのより良い方法があるかもしれません。 考えておく。

ちょっと待ってください。これはPython2.7でうまく機能しているようです。 Python3の問題だけでしょうか？

In [56]: matplotlib.__version__
Out[56]: '1.3.1'

In [57]: pandas.__version__
Out[57]: '0.13.1'

皆さんこんにちは、
関連するかどうかはわかりませんが、この海のグラフをプロットしようとすると、同様の問題が発生します： http ：//www.stanford.edu/~mwaskom/software/seaborn/examples/many_facets.html

mpld3.fig_to_html(grid.fig, 'test.html')
/home/vagrant/graph/local/lib/python2.7/site-packages/mpld3/mplexporter/exporter.py:82: UserWarni ng: Blended transforms not yet supported. Zoom behavior may not work as expected.
  warnings.warn("Blended transforms not yet supported. "
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/home/vagrant/graph/local/lib/python2.7/site-packages/mpld3/_display.py", line 236, in fig_to_html
    figure_json=json.dumps(figure_json),
  File "/usr/lib/python2.7/json/__init__.py", line 231, in dumps
    return _default_encoder.encode(obj)
  File "/usr/lib/python2.7/json/encoder.py", line 201, in encode
    chunks = self.iterencode(o, _one_shot=True)
  File "/usr/lib/python2.7/json/encoder.py", line 264, in iterencode
    return _iterencode(o, 0)
  File "/usr/lib/python2.7/json/encoder.py", line 178, in default
    raise TypeError(repr(o) + " is not JSON serializable")
TypeError: 0 is not JSON serializable

問題は、numpy.int64番号が内部で使用されており、これらはデフォルトでjsonシリアル化できないことです。
これを処理するためのjson.JSONEncoderを提供するために、ライブラリにフックが必要です。

アイデアの余地を提供するためだけに：

同じ問題が発生しますが、mpld3を使用するプロジェクトで使用しているプロジェクトのバックエンドとして使用しているDjangoに接続しています。

numpy配列をシリアル化しようとしましたが、django 1.6を使用すると、このエラーが発生しました。 1.5にダウングレードしましたが、動作します。 その理由は、1.6以降ではjsonで、1.5以下ではPickle経由でシリアル化が行われるためです。

これが問題の可能性を見つけるのに役立つことを願っています。

Med vennlig hilsen、
ジェラルドデラリヴァエスピノサ
Høgskolelektor
HøgskoleniGjøvik
電子メール：ジェラルド。 [email protected]
モービル：+47950 13322

2014年6月19日には、午後04時56分で、lvasseur [email protected]書きました：

皆さんこんにちは、
関連するかどうかはわかりませんが、この海のグラフをプロットしようとすると、同様の問題が発生します： http ：//www.stanford.edu/~mwaskom/software/seaborn/examples/many_facets.html

mpld3.fig_to_html（grid.fig、 'test.html'）
/home/vagrant/graph/local/lib/python2.7/site-packages/mpld3/mplexporter/exporter.py:82：UserWarni ng：混合変換はまだサポートされていません。 ズーム動作が期待どおりに機能しない場合があります。
warnings.warn（ "ブレンドされた変換はまだサポートされていません。"
トレースバック（最後の最後の呼び出し）：
ファイル ""、1行目、
ファイル "/home/vagrant/graph/local/lib/python2.7/site-packages/mpld3/_display.py"、236行目、fig_to_html
figure_json = json.dumps（figure_json）、
ファイル「/usr/lib/python2.7/json/__init__.py」、231行目、ダンプ
return _default_encoder.encode（obj）
ファイル "/usr/lib/python2.7/json/encoder.py"、行201、エンコード
チャンク= self.iterencode（o、_one_shot = True）
iterencodeのファイル "/usr/lib/python2.7/json/encoder.py"、行264
return _iterencode（o、0）
ファイル "/usr/lib/python2.7/json/encoder.py"、行178、デフォルト
TypeError（repr（o）+ "はJSONシリアル化可能ではありません"）を発生させます
TypeError：0はJSONシリアル化可能ではありません
問題は、numpy.int64番号が内部で使用されており、これらはデフォルトでjsonシリアル化できないことです。
これを処理するためのjson.JSONEncoderを提供するために、ライブラリにフックが必要です。

—
このメールに直接返信するか、GitHubで表示してください。

ご参考までに、

    from json import JSONEncoder
    class MyEncoder(JSONEncoder):
        def default(self, obj):
            if isinstance(obj, numpy.int64):
                return int(obj)
            return JSONEncoder.default(self, obj)

    return template.render(figid=json.dumps(figid),
                           d3_url=d3_url,
                           mpld3_url=mpld3_url,
                           figure_json=json.dumps(figure_json, cls=MyEncoder),
                           extra_css=extra_css,
                           extra_js=extra_js)

/mpld3/_display.pyの問題を解決します：fig_to_html

今は試す時間がありませんが、これは問題であり、解決策の正しい方向性であるように思われます。 json.dumpドキュメントでは、 defaultオプションを使用すると、わずかに軽量なソリューションがあると思いますが、最終的には1行短くなる可能性があります。 プルリクエストを実行する準備はできていますか？

これはPR＃213で修正されると思っていましたが、元の投稿のipythonノートブックがまだ機能していません。 他の誰かがそれを試すことができますか？

いつか試してみます

まだこれで混乱しています...＃213が実際にここで何かを修正したかどうかはわかりません。 それなしでint64オブジェクトをシリアル化することができます...

これは解決されましたか？
私はfig_to_htmlパンダが生成した図を見ることができません（私はTypeError: 0 is not JSON serializableを取得します）。 図はうまく生成されます。
plt.barを使用して再試行したときに、カスタム文字列でyticksを使用した場合にもエラーが発生します。

の解き方？

わからない。 軸ラベルが整数のシリアル化できないバージョンであることに問題があるようです。 あなたが何かを理解した場合は、私たちに知らせてください。

使用するとこのエラーが発生することを指摘したかっただけです

dates = df.Date.apply(lambda dt: dt.strftime('%B')[:3] + dt.strftime(' %d')).values
plt.xticks(x, dates, rotation='vertical')

しかし、ではありません

ax.set_xticklabels(dates, rotation='vertical')

お役に立てれば。

編集：さらに詳しく調べると、後者のバージョンではエラーは発生しませんが、結果の図形のxticksは実際には設定されません。

編集2：私の悪い、ちょうど見つけたダニはサポートされていません（＃22）。

FWIW、箱ひげ図を使用すると、問題が再現される可能性があります。

import numpy as np, mpld3
np.random.seed(937)
data = np.random.lognormal(size=(37, 4), mean=1.5, sigma=1.75)
labels = list('ABCD')
fs = 10  # fontsize

fig, axes = plt.subplots(1, 1, figsize=(6, 6)) 
axes.boxplot(data, labels=labels)
axes.set_title('Default', fontsize=fs)

html_fig = mppld3.fig_to_html(fig)

具体的には、ここにpipfreezeのバージョンがあります

cycler==0.10.0
Jinja2==2.8
MarkupSafe==0.23
matplotlib==1.5.1
mpld3==0.2
numpy==1.10.4
pandas==0.17.1
ptyprocess==0.5.1
pyparsing==2.1.0
python-dateutil==2.5.0
pytz==2015.7
six==1.10.0
wheel==0.29.0

Python3.4.3の場合。

@lvasseurによって提案されたパッチは問題を修正しているようですが、それが解決策であるかどうかはわかりません。

元の例を機能させるには、np.arange（2000,2002,1）の代わりに[float（x）for x in range（2000,2002）]を使用します。

関連するかどうかはわかりませんが、この海のグラフをプロットしようとすると、同様の問題が発生します： http ：//www.stanford.edu/~mwaskom/software/seaborn/examples/many_facets.html

海の棒グラフの図にmtld3.display(fig)を試しているときに、同じエラーが発生します。

TypeError：0はJSONシリアル化可能ではありません

誰でもmpld3で海のプロットをレンダリングできますか？

これは、データ値にnanがあるために発生するようです。 _display.py:243で壊れた
figure_json dictでnanをNoneに置き換えると、期待どおりの出力が得られます。

編集：上記は問題を解決していないようです（私はデバッグインタープリターでテストしていましたが、mpld3を使用した場合は機能しませんでした）。
したがって、 sns.barplot()レンダリングは機能しませんが、 plt.bar()レンダリング

行を追加してこれを修正しました

elif isinstance(obj, (numpy.ndarray,)):
        return obj.tolist()

/mpld3/_display.pyへ：NumpyEncoder

ありがとう@jaklingerこれは

@jaklinger 、こんにちは、あなたの提案に感謝します、それは完璧に機能します！ 1つだけ明確にしたかったのですが、numpy配列を辞書に変換して返そうとしましたが、辞書に問題はありませんでしたが、「float 32はjsonシリアル化できません」というエラーがスローされ、印刷して確認しました。 tolist（）メソッドを使用するだけで、配列がPythonリストに変換されました。
前：[100。 0。0。0。0。]
tolist付き：[100.0、0.0、0.0、0.0、0.0]そしてそれは完全に戻りました。
では、問題は正確には何でしたか？ よろしくお願いします。

@ padmaksha18あなたが何を意味するのか100％

numpy配列を辞書に変換しました

しかし（要するに） numpyとpythonタイプは同じではありません（ float32はfloatと同じではありません; arrayはlistなどと同じではなく、 JSONEncoderクラスは 'ネイティブのpythonタイプのみを許可します。 したがって...この関数（新しい修正を含む）のポイントは、入力objをネイティブのpython相当するものに変換することです。

@jaklinger ：こんにちはジョエル、どうもありがとう

pip install "git + https://github.com/javadba/mpld3@display_fix "