Mpld3: xticks를 사용할 때 "TypeError: *** is not JSON serializable"

아 - mplexporter 이 xticks가 목록이라고 잘못 가정한 것 같습니다. 버그입니다.

그동안 xticks를 목록으로 수동으로 변환하면 작동합니다.

사실은 그렇지 않습니다. 즉, 다음은 잘 작동합니다.

fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, xticks=np.arange(11))
ax.plot([0, 10], [0, 10], '-k')
mpld3.show()

Pandas는 여기에서 틱으로 이상한 일을 하고 있습니다. 2000 가 직렬화할 수 없다는 오류가 표시됩니다. 이는 미친 짓입니다. Pandas에는 직렬화할 수 없는 부동 소수점 유형이 내장되어 있습니까?

숫자 2000이 아니라 연도입니다. datetime 지옥에 오신 것을 환영합니다.
(2014년 6월 19일 편집: datetime 가 문제인 것에 대해 제가 잘못 알고 있었던 것 같습니다...)

어... 어떻게 하는게 제일 좋을지 모르겠네요. 이견있는 사람?

to_json 에서 pandas to_json 를 사용하는 것이 도움이 됩니까?

http://pandas.pydata.org/pandas-docs/dev/io.html#date -handling

팬더에서 to_json을 사용하는 것이 도움이 됩니까?

아마도, 하지만 그러면 코드 내의 많은 일에 대해 try ... except 문을 수행해야 할 것입니다(즉, 값이 Pandas 변수인 경우 다음을 수행합니다. 그렇지 않으면 다른 방법으로) 그런 다음 자바스크립트 측의 축 레이블이 Pandas가 출력하기로 결정한 모든 JSON 구조를 처리할 수 있는지 확인하십시오. 나는 매우 취약한 솔루션과 유지 관리 악몽처럼 들리기 때문에 그러한 수준의 복잡성을 추가하지 않는 것을 선호합니다.

내가 참조. 이것은 Python이 사용자 정의 클래스에 대한 json 직렬화 방법을 노출할 수 없다는 점으로 요약됩니다. 이 문제를 닫을 수 있습니다.

우리는 그것을 열어 두어야합니다 ... 이것을 처리하는 더 좋은 방법이있을 수 있습니다. 나는 그것에 대해 생각합니다.

잠시만요. Python 2.7에서 잘 작동하는 것 같습니다. Python3에만 해당될 수 있습니까?

In [56]: matplotlib.__version__
Out[56]: '1.3.1'

In [57]: pandas.__version__
Out[57]: '0.13.1'

여러분 안녕하세요,
관련이 있는지 확실하지 않지만 이 seaborn 그래프를 그릴 때 비슷한 문제가 발생합니다. http://www.stanford.edu/~mwaskom/software/seaborn/examples/many_facets.html

mpld3.fig_to_html(grid.fig, 'test.html')
/home/vagrant/graph/local/lib/python2.7/site-packages/mpld3/mplexporter/exporter.py:82: UserWarni ng: Blended transforms not yet supported. Zoom behavior may not work as expected.
  warnings.warn("Blended transforms not yet supported. "
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/home/vagrant/graph/local/lib/python2.7/site-packages/mpld3/_display.py", line 236, in fig_to_html
    figure_json=json.dumps(figure_json),
  File "/usr/lib/python2.7/json/__init__.py", line 231, in dumps
    return _default_encoder.encode(obj)
  File "/usr/lib/python2.7/json/encoder.py", line 201, in encode
    chunks = self.iterencode(o, _one_shot=True)
  File "/usr/lib/python2.7/json/encoder.py", line 264, in iterencode
    return _iterencode(o, 0)
  File "/usr/lib/python2.7/json/encoder.py", line 178, in default
    raise TypeError(repr(o) + " is not JSON serializable")
TypeError: 0 is not JSON serializable

문제는 numpy.int64 숫자가 내부적으로 사용되며 기본적으로 json을 직렬화할 수 없다는 것입니다.
이를 처리하기 위해 json.JSONEncoder를 제공하기 위해 라이브러리에 후크가 있어야 합니다.

아이디어를 위한 공간 제공:

동일한 문제가 있지만 mpld3을 사용하는 프로젝트에서 사용 중인 프로젝트의 백엔드로 사용하는 Django에 연결되어 있습니다.

numpy 배열을 직렬화하려고 시도했는데 django 1.6을 사용할 때 이 오류가 발생했습니다. 나는 1.5로 다운 그레이드했고 작동합니다. 그 이유는 1.6 이상부터 직렬화가 json으로 수행되는 반면 1.5 이하에서는 Pickle을 통해 수행되기 때문입니다.

이것이 문제가 될 수 있음을 찾는 데 도움이 되기를 바랍니다.

메드 벤리그 힐센,
제라르도 데 라 리바 에스피노사
Høgskolektor
Høgskolen i Gjøvik
e-post: 제라르도. [email protected]
모빌: +47 950 13 322

2014년 6월 19일 16시 56분에 lvasseur [email protected]에서 다음과 같이 썼습니다.

여러분 안녕하세요,
관련이 있는지 확실하지 않지만 이 seaborn 그래프를 그릴 때 비슷한 문제가 발생합니다. http://www.stanford.edu/~mwaskom/software/seaborn/examples/many_facets.html

mpld3.fig_to_html(grid.fig, 'test.html')
/home/vagrant/graph/local/lib/python2.7/site-packages/mpld3/mplexporter/exporter.py:82: UserWarni ng: 혼합 변환은 아직 지원되지 않습니다. 확대/축소 동작이 예상대로 작동하지 않을 수 있습니다.
warnings.warn("혼합 변환은 아직 지원되지 않습니다. "
역추적(가장 최근 호출 마지막):
파일 "", 1행, 에서
파일 "/home/vagrant/graph/local/lib/python2.7/site-packages/mpld3/_display.py", 236행, fig_to_html
figure_json=json.dumps(Figure_json),
파일 "/usr/lib/python2.7/json/__init__.py", 231행, 덤프
반환 _default_encoder.encode(obj)
파일 "/usr/lib/python2.7/json/encoder.py", 201행, 인코딩
청크 = self.iterencode(o, _one_shot=True)
iterencode의 파일 "/usr/lib/python2.7/json/encoder.py", 264행
반환 _iterencode(o, 0)
파일 "/usr/lib/python2.7/json/encoder.py", 178행, 기본적으로
상승 TypeError(repr(o) + "는 JSON 직렬화 불가능")
TypeError: 0은 JSON을 직렬화할 수 없습니다.
문제는 numpy.int64 숫자가 내부적으로 사용되며 기본적으로 json을 직렬화할 수 없다는 것입니다.
이를 처리하기 위해 json.JSONEncoder를 제공하기 위해 라이브러리에 후크가 있어야 합니다.

—
이 이메일에 직접 회신하거나 GitHub에서 확인하세요.

참고로,

    from json import JSONEncoder
    class MyEncoder(JSONEncoder):
        def default(self, obj):
            if isinstance(obj, numpy.int64):
                return int(obj)
            return JSONEncoder.default(self, obj)

    return template.render(figid=json.dumps(figid),
                           d3_url=d3_url,
                           mpld3_url=mpld3_url,
                           figure_json=json.dumps(figure_json, cls=MyEncoder),
                           extra_css=extra_css,
                           extra_js=extra_js)

/mpld3/_display.py의 문제를 해결합니다: fig_to_html

지금은 시도할 시간이 없지만 이것이 문제이고 솔루션의 올바른 방향인 것 같습니다. json.dump 문서 를 보면 default 옵션이 있는 약간 더 가벼운 솔루션이 있다고 생각하지만 결국에는 한 줄만 더 짧을 수 있습니다. 풀 리퀘스트를 할 준비가 되었나요?

나는 이것이 PR #213에 의해 수정될 것이라고 예상했지만 , 원래 게시물의 ipython 노트북 은 여전히 ​​나를 위해 작동하지 않습니다. 다른 사람들이 시도해 볼 수 있습니까?

나는 이것을 어느 시점에서 시도 할 것이다

여전히 이것 때문에 혼란스럽습니다... #213이 실제로 여기에서 수정한 것이 있는지 확실하지 않습니다. 그것 없이 int64 개체를 직렬화할 수 있습니다 ...

해결되었나요?
나는 fig_to_html 팬더 생성 그림을 볼 수 없습니다 ( TypeError: 0 is not JSON serializable 얻습니다). 그림이 잘 생성됩니다.
plt.bar를 사용하여 재시도할 때 사용자 지정 문자열과 함께 yticks를 사용하는 경우에도 오류가 발생합니다.

해결 방법?

확실하지 않다. 축 레이블이 직렬화할 수 없는 정수 버전이라는 문제가 있는 것 같습니다. 알아낸 것이 있으면 알려주십시오.

사용할 때이 오류가 발생한다는 점을 지적하고 싶었습니다.

dates = df.Date.apply(lambda dt: dt.strftime('%B')[:3] + dt.strftime(' %d')).values
plt.xticks(x, dates, rotation='vertical')

하지만 함께

ax.set_xticklabels(dates, rotation='vertical')

도움이 되었기를 바랍니다.

편집: 추가 검사에서 후자 버전은 오류를 생성하지 않지만 결과 그림의 xticks는 실제로 설정되지 않습니다.

편집 2: 내 나쁜, 방금 틱이 지원되지 않는다는 것을 알았습니다(#22).

FWIW에서 boxplots를 사용하면 문제를 재현할 수 있습니다.

import numpy as np, mpld3
np.random.seed(937)
data = np.random.lognormal(size=(37, 4), mean=1.5, sigma=1.75)
labels = list('ABCD')
fs = 10  # fontsize

fig, axes = plt.subplots(1, 1, figsize=(6, 6)) 
axes.boxplot(data, labels=labels)
axes.set_title('Default', fontsize=fs)

html_fig = mppld3.fig_to_html(fig)

특히, 다음은 pip freeze의 버전입니다.

cycler==0.10.0
Jinja2==2.8
MarkupSafe==0.23
matplotlib==1.5.1
mpld3==0.2
numpy==1.10.4
pandas==0.17.1
ptyprocess==0.5.1
pyparsing==2.1.0
python-dateutil==2.5.0
pytz==2015.7
six==1.10.0
wheel==0.29.0

파이썬 3.4.3의 경우.

@lvasseur가 제안한 패치가 문제를 해결하는 것 같지만 _the_ 솔루션인지는 모르겠습니다.

원래 예제가 작동하도록 하려면 np.arange(2000,2002,1) 대신 [float(x) for x in range(2000,2002)]를 사용하십시오.

관련이 있는지 확실하지 않지만 이 seaborn 그래프를 그릴 때 비슷한 문제가 발생합니다. http://www.stanford.edu/~mwaskom/software/seaborn/examples/many_facets.html

seaborn barplot 그림에 대해 mtld3.display(fig) 를 시도하는 동안 동일한 오류가 발생합니다.

TypeError: 0은 JSON을 직렬화할 수 없습니다.

누구나 mpld3로 seaborn 플롯을 렌더링할 수 있습니까?

이것은 데이터 값에 nan 이 있기 때문에 발생하는 것 같습니다. _display.py:243 에서
figure_json dict에서 nan 를 None 로 바꾸면 예상되는 출력이 나옵니다.

편집: 위의 방법으로 문제가 해결되지 않는 것 같습니다(디버그 인터프리터에서 테스트했지만 작동했지만 mpld3을 사용할 때는 그렇지 않음).
따라서 sns.barplot() 렌더링 plt.bar() 작동하지 않지만 plt.bar() 작동합니다. 두 플롯의 수치에서 명백한 차이를 볼 수 없었지만 제공된 패치(https://github.com/mpld3/mpld3/pull/213)로 문제가 해결되었습니다.

나는 라인을 추가하여 이것을 고쳤다.

elif isinstance(obj, (numpy.ndarray,)):
        return obj.tolist()

/mpld3/_display.py로: NumpyEncoder

@jaklinger 감사합니다.

@jaklinger , 안녕하세요. 제안해 주셔서 감사합니다. 완벽하게 작동합니다! 한 가지를 명확히 하고 싶었습니다. numpy 배열을 사전으로 변환하고 반환하려고 했지만 사전에 문제가 없었지만 인쇄하고 확인했지만 "float 32 is not json serializable" 오류가 발생했습니다. tolist() 메서드를 사용하여 배열을 파이썬 목록으로 변환했습니다.
이전 :[100. 0. 0. 0. 0.]
with tolist: [100.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0] 완벽하게 반환되었습니다.
그렇다면 문제가 정확히 무엇이었습니까? 미리 감사드립니다.

@padmaksha18 무슨 말인지 100% 확신할 수 없습니다.

numpy 배열을 사전으로 변환

하지만 (간단히) numpy 및 python 유형은 동일하지 않습니다( float32 는 float 와 동일하지 않습니다. array 는 list 등과 같지 않으며 JSONEncoder 클래스 는 기본 python 유형만 '허용'합니다. 따라서... 이 함수 (새 수정 사항 포함)의 요점은 입력 obj 를 기본 python 해당하는 항목으로 변환하는 것입니다.

@jaklinger :안녕 Joel, 다시 한 번 감사드립니다. 사전으로 변환한다는 것은 이러한 배열 두 개를 가져와서 키 값 쌍을 형성했다는 의미입니다. 명확하게 설명하지 못해 죄송합니다. 이 점을 분명히 해 주셔서 감사합니다. 먼저 네이티브 파이썬 유형으로 변환해야 하고 그것이 문제였습니다. 사전을 jsonify하지 않고 있는 그대로 반환하려고 하면 jsonencoder 클래스가 그림에 나타날까요? 감사합니다!

pip 설치 "git+ https://github.com/javadba/mpld3@display_fix "