Mayavi: 전경 개체의 잘못된 순서(잘못된 개체 가시성)

에 만든 2018년 06월 21일 · 27코멘트 · 출처: enthought/mayavi

저는 3D 비주얼리제이션에 능숙하지 않고 이것이 마야비 문제인지 확실하지 않지만(잘못된 나무를 짖는 경우 사과합니다) 다음과 같은 예기치 않은 동작을 관찰했습니다.

환경:

conda, anaconda 3, conda 대신 pip install mayavi vtk pyqt5 사용하여 mayavi를 설치했습니다(#652와 유사한 문제가 발생한 후).

Debian 4.9.88-1+deb9u1 (2018-05-07) x86_64 GNU/Linux
Name: mayavi
Version: 4.6.0
Name: vtk
Version: 8.1.0
Location: /home/xxxyyy/anaconda3/envs/ELA/lib/python3.6/site-packages

레프로

# example from https://stackoverflow.com/a/10740780
from mayavi import mlab
import numpy as np

# Generate some random hypocenters
x, y, z, mag = np.random.random((4, 500))

# Make a curved well bore...
wellx, welly, wellz = 3 * [np.linspace(0, 1.5, 10)]
wellz =  wellz**2

# Plot the hypocenters, colored and scaled by magnitude
mlab.points3d(x, y, z, mag)

# Plot the wellbore
mlab.plot3d(wellx, welly, wellz, tube_radius=0.1)

mlab.show()

유색 공은 회색 파이프를 둘러싸고 그 일부를 아래에 숨겨야 합니다.
다른 OS-Windows(mayavi 버전 TBC, 아마도 4.5)에서 이전 버전의 mayavi에서 예상되는 동작을 얻습니다.

incorrect_foreground

출처

jmp75

👍10

가장 유용한 댓글

지난 몇 주 동안 Python3을 사용하여 동일한 문제(잘못된 깊이 순서 렌더링)로 어려움을 겪고 있으며 여기에서도 내 경험을 공유할 것이라고 생각했습니다(2019-04-15 현재).

우리가 같은 페이지에 있기 때문에 내가 보고 있는 버전은 다음과 같습니다.

마야비: 4.6.2
특성: 5.0.0
특성수이: 6.0.0
vtk: 8.1.2
상상하다: 4.7.1
파이페이스: 6.0.0
파이Qt5: 5.12.1
PyQt4: 4.11.4(_dpkg_에서)
PySide: 1.2.2(_dpkg_에서)
파이사이드2: 5.12.2

Mayavi/VTK/traits는 'wx' 툴킷 또는 'qt4' 툴킷을 사용할 수 있습니다. 'qt4' 툴킷을 사용하면 QT API를 지정하는 추가 옵션이 있습니다. 선택 사항은 'pyqt', 'pyqt5', 'pyside' 및 'pyside2'입니다. 이는 환경 변수 ETS_TOOLKIT(wx 또는 qt4로 설정) 및 QT_API(pyqt, pyqt5, pyside 또는 pyside2로 설정, ETS_TOOLKIT가 qt4로 설정된 경우에만 적용 가능)로 지정됩니다.

Mint 18.3(그리고 아마도 모든 Ubuntu 16.04 변형의 경우)에서 공식 Python3은 3.5.2입니다. 일부 모듈은 apt/dpkg에서 사용할 수 있지만 일부는 pip를 사용하여 설치해야 합니다. Python3용으로 wxPython을 설치할 수 없습니다. Qt를 사용하면 결과가 달라집니다.

ETS_TOOLKIT=qt4 및 QT_API=pyqt : 올바르게 렌더링됩니다.
ETS_TOOLKIT=qt4 및 QT_API=pyqt5 : 잘못된 순서로 렌더링
ETS_TOOLKIT=qt4 및 QT_API=pyside : 올바르게 렌더링됩니다.
ETS_TOOLKIT=qt4 및 QT_API=pyside2 : 잘못된 순서로 렌더링

Mint 19.1(및 아마도 모든 Ubuntu 18.04 변형)의 경우 결과가 비슷합니다. Python3 버전은 3.6.7입니다. 여기에서 pip3으로 wxPython(4.0.1)을 설치할 수 있다는 점을 제외하고 모든 모듈은 이전과 동일합니다. 이 경우 ETS_TOOLKIT=wx를 설정하면 올바른 깊이 순서가 제공됩니다. qt4 툴킷의 경우 결과는 Mint 18.3 결과와 동일했습니다(즉, pyqt 및 pyside는 올바르게 렌더링되었지만 pyqt5 및 pyside2는 그렇지 않음).

소스에서 PySide2를 컴파일하려고 시도했고 컴파일할 수 있었습니다. 그러나 렌더링은 여전히 잘못되었습니다.

또한 pyenv를 사용하여 다양한 버전의 Python3(특히 3.5.2 및 3.7.3)을 테스트해 보았습니다. 두 경우 모두, 공식 PySide 코드가 3.4 이상의 Python 버전을 지원하지 않는다는 점을 제외하고는 pip3을 통해 필요한 모듈을 설치할 수 있습니다. PyQt5와 마찬가지로 PySide2를 사용할 수 있습니다. 둘 다 제대로 작동하지 않습니다. wxPython을 컴파일할 수 없습니다.

이쯤 되면 VTK 문제가 아니라 QT 문제가 아닐까(지금은 wxPython을 포기했다). 하지만 이상하게도 내 업무용 노트북(Mint 18.3 포함)에서 pyenv를 사용하여 Python 3.7.3을 실행했고 이 경우 깊이 순서 가 PyQt5 또는 PySide2를 사용하여 올바르게 렌더링

마지막으로 VirtualBox(xfce가 포함된 Mint 19.1)로 몇 가지 테스트를 실행해 보았습니다. 나는 여전히 다른 조합을 시도하고 있지만 지금까지 결과는 동일합니다. (glxinfo는 OpenGL/GLX 드라이버를 SGI로 보고합니다).

sid5432 에 2019년 04월 16일

👍6

모든 27 댓글

'지구본' 주위에 배치된 plot3d 포인트와 동일한 문제가 있는 것 같습니다.

    sphere = mlab.points3d(0, 0, 0, scale_mode='none',
                           scale_factor=2,
                           # color=(0.67, 0.77, 0.93),
                           color=ocean_blue,
                           resolution=50,
                           opacity=.85,
                           name='Earth')
    #
    # These parameters, as well as the color, where tweaked through the GUI,
    # with the record mode to produce lines of code usable in a script.
    sphere.actor.property.specular = 0.45
    sphere.actor.property.specular_power = 5
    # Backface culling is necessary for more a beautiful transparent
    # rendering.
    sphere.actor.property.backface_culling = True

chiranthsiddappa 에 2018년 06월 24일

pyqt/pyside 백엔드의 경우 +1, [email protected] 및 [email protected]을 사용하여 데비안 스트레치에서 테스트

jeasinema 에 2018년 07월 03일

이것은 VTK의 일반적인 문제이며 #574 및 #491에서 이전에 나타났습니다. 나는 이것을 탐색하거나 해결책을 찾을 시간이 없었습니다.

prabhuramachandran 에 2018년 07월 04일

@jmp75 저도 같은 문제가 있었습니다. 어떤 버전의 mayavi가 작동하는지 확인해 주시겠습니까?

lhvalentini 에 2018년 07월 18일

@lhvalentini 나는 이것을 Mayavi 4.5.0 및 vtk 6.3.0 패키지와 함께 Windows 10에서 Anaconda 2(python 2.7.15)를 사용하여 작동하고 있습니다.

jmp75 에 2018년 07월 23일

여러분, 이것이 불투명도의 문제라면 그것은 다른 문제입니다.

OPs 코드를 시도했는데 제대로 작동합니다. 이것이 OS 관련 문제인 경우 VTK 8.1.1 및 마스터의 Mayavi가 있는 Mac OS 컴퓨터에서 확실히 보기에 드라이버에 문제가 있을 수 있습니다. 이 문제를 해결하기 위해 Mayavi에서 변경된 사항이 있는지 의심됩니다.

prabhuramachandran 에 2018년 08월 26일

@prabhuramachandran (a) 근본 원인을 분리하기 위해 추가 진단이 가능한지 확인하겠습니다. 실제로 mayavi는 문제가 해결되어야 하는 위치가 아닐 가능성이 높지만 도움이 되는 항목을 가리킬 수 있는 경우 이 스레드에서 보고할 것입니다.

jmp75 에 2018년 08월 27일

RHEL 7, PyQt5 및 Mayavi 4.6.2에서 문제를 재현할 수 있습니다(위의 컬러 볼 예제 사용). PyQt5를 제거하고 wxPython을 설치하여 올바르게 작동하도록 만들 수 있었습니다. 불행히도 PyQt5가 필요합니다. 작업 중인 두 컴퓨터 중 하나에서 VirtualGL(여전히 RHEL 7, PyQt5 및 Mayavi 4.6.2 사용)에서 실행할 수 있으며 문제가 사라집니다. 그러나 다른 시스템(프로덕션 시스템)에서 VirtualGL로 인해 Mayavi가 충돌합니다.

PyQt5를 사용할 때 이 문제를 해결하는 방법에 대한 제안 사항이 있습니까?

gregoryrd 에 2018년 11월 02일

PyQt5에서는 문제를 재현했지만 wxPython에서는 재현하지 않았다는 사실이 단서를 제공합니까?

gregoryrd 에 2018년 11월 02일

Linux Mint 18, 64비트(Anaconda, Python 3.6, Qt 5.6.2, pyqt 5.6.0, VTK 8.1.1, Mayavi 4.6.2, conda-forge에서 설치)에 비슷한 문제가 있습니다.

바닐라 mlab.test_points3d() 하면 개체 순서가 올바르지 않습니다.

test
test2
앞서 언급한 scene.renderer.use_depth_peeling 및 f.scene.renderer.maximum_number_of_peels 설정으로 실험을 시도했지만 성공하지 못했습니다.
어떤 아이디어가 이유가 될 수 있습니까?

solarjoe 에 2018년 11월 11일

업데이트. 이 문제는 Linux의 Qt5 문제처럼 보입니다. 내 우분투 시스템에서는 이것을 볼 수 있지만 OS X에서는 볼 수 없습니다. Windows는 확실하지 않습니다. Qt4 백엔드에서는 보이지 않습니다. 그래서 우리가 Qt5와 QVTKRenderWindowInteractor를 사용할 때 어떻게든 렌더링이 엉망인 것처럼 보입니다. 나는 이 문제를 VTK 사람들에게도 업스트림으로 보고했습니다. 문제가 무엇인지 잘 모르겠습니다.

prabhuramachandran 에 2018년 11월 12일

동일한 문제가 있습니다. Qt4로 다시 이동했고 모든 것이 잘 작동합니다.

ronceray 에 2019년 01월 23일

👍2

Qt4가 있는 Linux에서 이 문제가 있습니다(ipython의 %gui qt4로 활성화됨). Intel Graphics(알려진 문제에서 이미 언급한 것과 관련된 것)가 있기 때문일 수 있습니다.

bsxfun 에 2019년 01월 28일

Qt4도 설치해야 했습니다. 어떻게 든 그 전에 옵션에 "qt4"를 넣으면 오류 메시지가 생성되지 않고 대신 Qt5가 사용되었습니다.

ronceray 에 2019년 02월 01일

👍2

좋아, 나는 qt4가 내 끝에 설치되지 않았다는 것을 깨닫지 못했습니다 (실제로, @ronceray , 그것은 오류를 일으키지 않습니다) ...

PyQt 4.12.3이 실행되지 않았지만 버전 4.12.1에서 작동하도록 할 수 있었습니다.

PyQt5보다 훨씬 느리지만 이 전경 문제가 없습니다... 다른 그래픽 카드를 설정하지 않아도 됩니다!

bsxfun 에 2019년 02월 01일

Fedora 27 -> Fedora 29에서 업그레이드 하고 최신 NVIDIA 그래픽 드라이버를 설치했습니다 . 그 후, Mayavi는 pyqt5를 사용하여 예상대로 수행합니다.

derekbrokeit 에 2019년 03월 11일

우리가 같은 페이지에 있기 때문에 내가 보고 있는 버전은 다음과 같습니다.

마야비: 4.6.2
특성: 5.0.0
특성수이: 6.0.0
vtk: 8.1.2
상상하다: 4.7.1
파이페이스: 6.0.0
파이Qt5: 5.12.1
PyQt4: 4.11.4(_dpkg_에서)
PySide: 1.2.2(_dpkg_에서)
파이사이드2: 5.12.2

ETS_TOOLKIT=qt4 및 QT_API=pyqt : 올바르게 렌더링됩니다.
ETS_TOOLKIT=qt4 및 QT_API=pyqt5 : 잘못된 순서로 렌더링
ETS_TOOLKIT=qt4 및 QT_API=pyside : 올바르게 렌더링됩니다.
ETS_TOOLKIT=qt4 및 QT_API=pyside2 : 잘못된 순서로 렌더링

소스에서 PySide2를 컴파일하려고 시도했고 컴파일할 수 있었습니다. 그러나 렌더링은 여전히 잘못되었습니다.

sid5432 에 2019년 04월 16일

👍6

VTK ML의 이 스레드 는 동일한 문제를 언급하는 것 같습니다. 불행히도, 그것은 답변되지 않은 채로 남겨졌습니다 ...

nlgranger 에 2019년 04월 16일

👍1

직감으로 보고할 가치가 있는 데비안 랩톱에서 무언가를 시도했습니다. 이것은 Debian wiki 에 설명된 대로 NVIDIA Optimus 노트북

짧은 이야기: 다른 모든 것은 내가 게시한 원래 테스트 스크립트와 동일하지만 Intel 카드에서는 잘못 렌더링되지만 NVIDIA 하드웨어에서는 올바르게 렌더링됩니다.

환경(관련 패키지):

envisage                  4.7.2                    pypi_0    pypi
mayavi                    4.6.2                    pypi_0    pypi
pyface                    6.0.0                    pypi_0    pypi
pygments                  2.3.1                    pypi_0    pypi
pyqt5                     5.12.2                   pypi_0    pypi
pyqt5-sip                 4.19.17                  pypi_0    pypi
python                    3.6.8                h0371630_0  
traits                    5.1.1                    pypi_0    pypi
traitsui                  6.0.0                    pypi_0    pypi
vtk                       8.1.2                    pypi_0    pypi

optirun 를 사용하는 방법 은 데비안 위키 를 참조하세요. optirun python ~/src/tmp/qtbug.py 올바르게 작동했습니다. 샘플 앱을 사용하여 optirun 없는 차이를 설명하려면 다음을 수행하십시오.

glxgears -info 반환

GL_RENDERER   = Mesa DRI Intel(R) HD Graphics 630 (Kaby Lake GT2) 
GL_VERSION    = 3.0 Mesa 18.3.4
GL_VENDOR     = Intel Open Source Technology Center

반면 optirun glxgears -info

GL_RENDERER   = Quadro M1200/PCIe/SSE2
GL_VERSION    = 4.6.0 NVIDIA 418.56
GL_VENDOR     = NVIDIA Corporation

jmp75 에 2019년 05월 08일

여기 Dell Precision 5520의 Arch Linux에서 또 다른 확인 사항을 추가하기 위해 Intel 칩에서는 문제가 실행되고 있지만 optirun 를 통한 nvidia 카드에서는 문제가 발생하지 않습니다. 이것은 모두 Arch의 공식 저장소를 통해 설치된 Python 3.7, Qt5 및 mayavi와 함께입니다.

chrisjbillington 에 2019년 05월 22일

동일한 문제로, PyQt5 백엔드로 Mayavi를 실행하면 Debian Stretch에서 Mesa/SGI 드라이버를 사용하여 잘못된 렌더링 순서가 발생하지만 ETS_TOOLKIT=wx 환경 변수 세트와 함께 작동합니다.

agarret7 에 2019년 09월 12일

PyQt 대신 wxPython을 사용하여 이 문제를 해결했습니다.

gstfrr 에 2019년 12월 18일

이 스레드는 문제를 해결하는 데 매우 유용했습니다. 의견 주셔서 감사합니다.

같은 문제로 wx에서는 작동하지 않으므로 python-pyqt4를 설치하고 ETS_TOOLKIT=qt4 및 QT_API=pyqt 를 설정하면 해결되었습니다.

jolaem 에 2019년 12월 19일

위에서 언급한 구성 중 하나에 대한 또 다른 확인을 추가하고 싶습니다. 저는 Ubuntu 18.04를 OS로 사용하는 Linux 컴퓨터에서 작업하고 있습니다. 내 시스템에는 Intel 그래픽 카드가 있습니다. 나는 하전 입자의 움직임을 애니메이션하기 위해 anaconda3를 사용하고 있습니다. 최종 결과는 중심을 통과하는 선이 있는 나선이어야 합니다. Mayavi 4.6.2, vtk 8.1.2 및 pyqt 5.9.2가 있는 Python 3.6.8 환경의 경우 다음과 같이 표시됩니다.
snapshot
빨간색 선은 잘못된 나선의 외부에 있는 것처럼 보입니다.