Mimic-code: 关于如何运行从其他项目/研究传递过来的复杂 SQL 脚本的建议？

好吧，这里有一些提示，适用于可能有同样问题的新手，

• 要运行多个查询块，使用 pgAdmin4 中的query tool ，尝试用分号结束每个块；

问题是似乎只有最后一个查询在Data Output Panel实际执行 - 我猜您需要使用UNION或JOIN子句以某种方式合并它们？

• 要保存最终表格，即从 Postgres 导出到 CSV，您可以使用COPY语句，请参阅 #214

我不认为我可以提供通用的解决方案，但也许我可以为您指明正确的方向。 我最喜欢的工作方式是编写模块化 SQL 脚本，这些脚本为特定概念（例如通风）创建数据的物化视图。 然后我在最后将所有这些视图组合在一起形成一个大表，然后将其输出到 CSV 或直接读取到 Python 中。 如果您想学习 SQL，那么我相信网上有很多教程可以帮助您解决这个问题。 特别是我会阅读物化视图，因为它们对于创建中间表非常有用，您可以稍后使用这些表（我认为这就是您在上一个问题中所需要的）。

如果您查看aline子文件夹 (https://github.com/MIT-LCP/mimic-code/tree/master/notebooks/aline)，您可以看到一个完全可重复的临床研究示例。 我建议做一些类似于该文件夹中所做的事情。 有一堆生成底层表的模块化 SQL 文件——你可以看到我首先生成了一个“队列”表aline_cohort.sql——它说“这些是我感兴趣的icustay_id s”。 然后我运行许多其他脚本来为这些icustay_id生成概念。 最后，笔记本从这些表中提取所有数据（在 aline.ipynb@[7] 中）。 Notebook 更进一步，实际上直接从 Python 运行上述所有查询。 至少它应该让您了解如何从多个 SQL 查询构建群组/数据集。 我希望这有帮助！

嗨，Alistair @alistairewj ，非常感谢您的大力帮助，非常感谢：+1：

我正在花一些时间进行留置动脉导管研究（ aline研究）和您的

有点陡峭的学习曲线，但它开始变得有意义:)电子健康记录的

伟大的！ 祝你好运！