Mimic-code: 他のプロジェクト/研究から受け継がれた複雑なSQLスクリプトを実行する方法についてのアドバイスはありますか？

同じ問題を抱えている可能性のあるまったく新しい初心者のためのヒントをいくつか紹介します。

• pgAdmin4のquery toolを使用してクエリの複数のブロックを実行するには、各ブロックをセミコロンで終了してみてください。

問題は、最後のクエリだけがData Output Panel実際に実行されているように見えることです-どういうわけかそれらをマージするには、 UNIONまたはJOIN句を使用する必要があると思いますか？

• 最終的なテーブルを保存するには、つまりPostgresからCSVにエクスポートするには、 COPYステートメントを使用できます。＃214を参照してください。

私は一般的な解決策を提供できるとは思いませんが、おそらくあなたを正しい方向に向けることはできます。 私のお気に入りの作業方法は、特定の概念（換気など）のデータのマテリアライズドビューを作成するモジュラーSQLスクリプトを作成することです。 次に、これらすべてのビューを最後に組み合わせて1つの大きなテーブルを作成し、それをCSVに出力するか、Pythonに直接読み込みます。 あなたがSQLを学びたいと思っているなら、私はそれを助けるためにオンラインで多くのチュートリアルがあると確信しています。 特にマテリアライズドビューについては、後で使用できる中間テーブルを作成するのに非常に役立つので読みます（これが最後の質問で必要なことだと思います）。

alineサブフォルダー（https://github.com/MIT-LCP/mimic-code/tree/master/notebooks/aline）を見ると、完全に再現可能な臨床研究の例を見ることができます。 そのフォルダで行われているようなことをすることをお勧めします。 基礎となるテーブルを生成するモジュラーSQLファイルがたくさんあります-最初に「コホート」テーブルaline_cohort.sqlを生成することがわかります-「これらは私が興味を持っているicustay_idです」と書かれています。 次に、他のいくつかのスクリプトを実行して、これらのicustay_idの概念を生成します。 最後に、ノートブックはこれらのテーブルからすべてのデータを抽出します（aline.ipynb @ [7]内）。 ノートブックはさらに一歩進んで、実際には上記のすべてのクエリをPythonから直接実行します。 少なくとも、複数のSQLクエリからコホート/データセットを構築する方法についてのアイデアが得られるはずです。 お役に立てば幸いです。

こんにちはAlistair @ alistairewj 、この素晴らしい助けに感謝します：+1：

私は、留置動脈カテーテル研究（アライン研究）とあなたのsepsis3-mimicノートブックを調べることに時間を費やしています。

少し急な学習曲線ですが、それは理にかなっています:)電子健康記録の

素晴らしい！ 幸運を！