Scikit-learn: ImportError : image introuvable après l'installation de la version dev

Créé le 20 avr. 2016  ·  3Commentaires  ·  Source: scikit-learn/scikit-learn

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La description

Version de développement installée pour la première fois. J'obtiens une erreur d'importation lorsque j'essaie de charger un outil.

Étapes/Code à reproduire

Exemple : md5-c7388c0cd54243d77b145783344f4c4c Si le code est trop long, n'hésitez pas à le mettre dans un gist public et à le lier dans le numéro : https://gist.github.com

de sklearn.ensemble importer RandomForestRegressor

Résultats attendus

Exemple : aucune erreur n'est générée. Veuillez coller ou décrire les résultats attendus.

Pas d'erreur.

Résultats actuels

Veuillez coller ou décrire spécifiquement la sortie ou le retraçage réel.
ImportError                               Traceback (most recent call last)
<ipython-input-1-4b1325c8d865> in <module>()
----> 1 from sklearn.ensemble import RandomForestRegressor

/Users/timothychan/.local/lib/python2.7/site-packages/sklearn/ensemble/__init__.py in <module>()
      5 
      6 from .base import BaseEnsemble
----> 7 from .forest import RandomForestClassifier
      8 from .forest import RandomForestRegressor
      9 from .forest import RandomTreesEmbedding

/Users/timothychan/.local/lib/python2.7/site-packages/sklearn/ensemble/forest.py in <module>()
     54 from ..externals.joblib import Parallel, delayed
     55 from ..externals import six
---> 56 from ..feature_selection.from_model import _LearntSelectorMixin
     57 from ..metrics import r2_score
     58 from ..preprocessing import OneHotEncoder

/Users/timothychan/.local/lib/python2.7/site-packages/sklearn/feature_selection/__init__.py in <module>()
     18 from .variance_threshold import VarianceThreshold
     19 
---> 20 from .rfe import RFE
     21 from .rfe import RFECV
     22 

/Users/timothychan/.local/lib/python2.7/site-packages/sklearn/feature_selection/rfe.py in <module>()
     15 from ..base import is_classifier
     16 from ..externals.joblib import Parallel, delayed
---> 17 from ..model_selection import check_cv
     18 from ..model_selection._validation import _safe_split, _score
     19 from ..metrics.scorer import check_scoring

/Users/timothychan/.local/lib/python2.7/site-packages/sklearn/model_selection/__init__.py in <module>()
----> 1 from ._split import BaseCrossValidator
      2 from ._split import KFold
      3 from ._split import LabelKFold
      4 from ._split import StratifiedKFold
      5 from ._split import LeaveOneLabelOut

/Users/timothychan/.local/lib/python2.7/site-packages/sklearn/model_selection/_split.py in <module>()
     33 from ..utils.fixes import signature
     34 from ..base import _pprint
---> 35 from ..gaussian_process.kernels import Kernel as GPKernel
     36 
     37 __all__ = ['BaseCrossValidator',

/Users/timothychan/.local/lib/python2.7/site-packages/sklearn/gaussian_process/__init__.py in <module>()
     11 """
     12 
---> 13 from .gpr import GaussianProcessRegressor
     14 from .gpc import GaussianProcessClassifier
     15 from . import kernels

/Users/timothychan/.local/lib/python2.7/site-packages/sklearn/gaussian_process/gpr.py in <module>()
     13 
     14 from sklearn.base import BaseEstimator, RegressorMixin, clone
---> 15 from sklearn.gaussian_process.kernels import RBF, ConstantKernel as C
     16 from sklearn.utils import check_random_state
     17 from sklearn.utils.validation import check_X_y, check_array

/Users/timothychan/.local/lib/python2.7/site-packages/sklearn/gaussian_process/kernels.py in <module>()
     28 from scipy.spatial.distance import pdist, cdist, squareform
     29 
---> 30 from ..metrics.pairwise import pairwise_kernels
     31 from ..externals import six
     32 from ..base import clone

/Users/timothychan/.local/lib/python2.7/site-packages/sklearn/metrics/__init__.py in <module>()
     31 from .classification import brier_score_loss
     32 
---> 33 from . import cluster
     34 from .cluster import adjusted_mutual_info_score
     35 from .cluster import adjusted_rand_score

/Users/timothychan/.local/lib/python2.7/site-packages/sklearn/metrics/cluster/__init__.py in <module>()
     17 from .supervised import v_measure_score
     18 from .supervised import entropy
---> 19 from .unsupervised import silhouette_samples
     20 from .unsupervised import silhouette_score
     21 from .bicluster import consensus_score

/Users/timothychan/.local/lib/python2.7/site-packages/sklearn/metrics/cluster/unsupervised.py in <module>()
      9 from ...utils import check_random_state
     10 from ...utils import check_X_y
---> 11 from ..pairwise import pairwise_distances
     12 from ...preprocessing import LabelEncoder
     13 

/Users/timothychan/.local/lib/python2.7/site-packages/sklearn/metrics/pairwise.py in <module>()
     27 from ..externals.joblib.parallel import cpu_count
     28 
---> 29 from .pairwise_fast import _chi2_kernel_fast, _sparse_manhattan
     30 
     31 

ImportError: dlopen(/Users/timothychan/.local/lib/python2.7/site-packages/sklearn/metrics/pairwise_fast.so, 2): Library not loaded: libmkl_intel_lp64.dylib
  Referenced from: /Users/timothychan/.local/lib/python2.7/site-packages/sklearn/metrics/pairwise_fast.so
  Reason: image not found

Versions

Veuillez exécuter l'extrait suivant et coller la sortie ci-dessous. plate-forme d'importation ; print(platform.platform()) import sys; print("Python", sys.version) import numpy; print("NumPy", numpy.__version__) import scipy; print("SciPy", scipy.__version__) import sklearn; print("Scikit-Learn", sklearn.__version__)

Darwin-15.4.0-x86_64-i386-64bit
('Python', '2.7.11 |Anaconda personnalisé (x86_64)| (par défaut, 6 décembre 2015, 18:57:58) \n[GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5577)]')
('NumPy', '1.11.0')
('SciPy', '0.17.0')
('Scikit-Learn', '0.18.dev0')

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Commentaire le plus utile

Salut, après avoir essayé beaucoup de choses, cela a semblé fonctionner (le mérite revient à Dennis Engermann qui a posté ceci sur https://groups.google.com/a/continuum.io/forum/#!topic/anaconda/F8Q-8xyvrks )

Relier symboliquement toutes les bibliothèques anaconda...

for lib in ~/anaconda/lib/*; do ln -s $lib /usr/local/lib/$(basename $lib); done

Tous les 3 commentaires

En recherchant les numéros précédents, le #3606 semble pertinent. Même moi, je ne suis pas au courant des internes, mais faites-nous savoir si cela vous aide.

Salut, après avoir essayé beaucoup de choses, cela a semblé fonctionner (le mérite revient à Dennis Engermann qui a posté ceci sur https://groups.google.com/a/continuum.io/forum/#!topic/anaconda/F8Q-8xyvrks )

Relier symboliquement toutes les bibliothèques anaconda...

for lib in ~/anaconda/lib/*; do ln -s $lib /usr/local/lib/$(basename $lib); done

Je clos le sujet, merci pour le partage de cette solution

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