Numpy: Количество образцов на гистограмме отрицательное с bins = "auto"

Созданный на 27 авг. 2019 · 4Комментарии · Источник: numpy/numpy

Получение Number of samples, -20, must be non-negative. при попытке построить гистограмму моего набора данных.

Воспроизведение примера кода:

import numpy as np

my_data = np.loadtxt("my_data.csv", delimiter=',', dtype=np.int16)

n_base, bins_base = np.histogram(my_data, bins="auto")

Вот my_data.csv

Сообщение об ошибке:

Число отсчетов -20 не должно быть отрицательным.

Информация о версии Numpy / Python:

1.16.4 3.7.4 (по умолчанию, 13 августа 2019 г., 20:35:49)
[GCC 7.3.0]

00 - Bug numpy.lib

Источник

alexsmartens

Самый полезный комментарий

Спасибо за сообщение об ошибке. Я могу подтвердить, что эта ошибка существует и в основной ветке.

Разработчики NumPy: проблема в том, что существует внутренняя функция _hist_bin_sturges в histograms.py , которая использует метод ptp для вычисления разницы максимума и минимума массива с dtype int16 . В этом случае максимум составляет 32767, а минимум -16, поэтому разница должна быть 32783. Но ptp возвращает значение того же типа, что и массив, поэтому он возвращает -32753, что приводит к неверный расчет.

Это можно исправить, заменив x.ptp() чем-нибудь вроде x.max().item() - x.min().item() .