Relacionado con # 995

@akenmorris : Actualmente, ¿qué biblioteca utiliza Studio para realizar el análisis de componentes principales?
@sheryjoe ¿Deberíamos usar la misma biblioteca para la API o usar bibliotecas de Python como sklearn para realizar el análisis de PCA?
Si queremos usar bibliotecas de Python, siguiendo el mismo conjunto de ShapeCohortGenPackage / DataAugmentationsPackage puedo empezar a trabajar en PCAPackage en la biblioteca de Python.

Studio usa la clase ParticleShapeStatistics:

https://github.com/SCIInstitute/ShapeWorks/blob/master/Libs/Particles/ParticleShapeStatistics.h

En general, mi recomendación es utilizar una sola biblioteca para ambos. Esto mantiene la coherencia de los resultados y el comportamiento en todas las herramientas. Me preocupa que tener múltiples implementaciones sea un paso atrás hacia un conjunto de herramientas disjunto que hemos estado tratando de consolidar con el tiempo.

Para su información, hay algunos planes diferentes para el futuro del análisis estadístico, incluido el uso de R.

¿Estamos planeando crear una envoltura pybind de ParticleShapeStatistics?

¿Estamos planeando crear una envoltura pybind de ParticleShapeStatistics?

Sí, como parte de la biblioteca de python de shapeworks.

830 # 1172

Será 1000 veces más fácil sacar esta función simplemente exportando Eigen :: Matrix que ya tiene todas estas funciones.