Относится к # 995

@akenmorris :
@sheryjoe Должны ли мы использовать ту же библиотеку для API или использовать библиотеки Python, такие как sklearn, для выполнения анализа PCA?
Если мы хотим использовать библиотеки Python, следуя тому же набору ShapeCohortGenPackage / DataAugmentationsPackage я могу начать работу над PCAPackage в библиотеке Python.

Studio использует класс ParticleShapeStatistics:

https://github.com/SCIInstitute/ShapeWorks/blob/master/Libs/Particles/ParticleShapeStatistics.h

В общем, я рекомендую использовать одну библиотеку для обоих. Это обеспечивает единообразие результатов и поведения для всех инструментов. Меня беспокоит, что наличие нескольких реализаций - это шаг назад к разрозненному набору инструментов, который мы пытались объединить с течением времени.

К вашему сведению, есть несколько разных планов на будущее статистического анализа, в том числе с использованием R.

Планируем ли мы создать оболочку pybind для ParticleShapeStatistics?

Планируем ли мы создать оболочку pybind для ParticleShapeStatistics?

Да, как часть библиотеки python shapeworks.

830 # 1172

Будет в 1000 раз проще получить эту функцию, просто экспортировав Eigen :: Matrix, который уже имеет все эти функции.