Shapeworks: API Python PCA

Dibuat pada 23 Feb 2021 · 7Komentar · Sumber: SCIInstitute/ShapeWorks

Perlu dukungan python API untuk melakukan semua operasi PCA untuk model korespondensi yang saat ini ada di Studio.
API harus menghitung hal berikut:

nilai eigen
vektor eigen
Pemuatan PCA
Skor / Varians Komponen PCA

Semua jumlah ini harus disimpan sebagai array numpy.

Feature Request

Sumber

iyerkrithika21

Komentar yang paling membantu

Studio menggunakan kelas ParticleShapeStatistics:

https://github.com/SCIInstitute/ShapeWorks/blob/master/Libs/Particles/ParticleShapeStatistics.h

Secara umum, rekomendasi saya adalah menggunakan satu perpustakaan untuk keduanya. Ini menjaga hasil dan perilaku tetap konsisten di seluruh alat. Saya khawatir bahwa memiliki beberapa implementasi adalah langkah mundur ke dalam seperangkat alat yang terpisah yang telah kami coba konsolidasikan dari waktu ke waktu.

FYI, ada beberapa rencana berbeda untuk masa depan analisis statistik termasuk menggunakan R.

akenmorris pada 2 Mar 2021

👍3

Semua 7 komentar

Terkait dengan #995

iyerkrithika21 pada 23 Feb 2021

@akenmorris : Saat ini, perpustakaan mana yang digunakan Studio untuk melakukan analisis komponen utama?
@sheryjoe Haruskah kita menggunakan perpustakaan yang sama untuk API atau menggunakan perpustakaan python seperti sklearn untuk melakukan analisis PCA?
Jika kita ingin menggunakan pustaka python, mengikuti rangkaian ShapeCohortGenPackage / DataAugmentationsPackage saya dapat mulai mengerjakan PCAPackage di pustaka python.

iyerkrithika21 pada 2 Mar 2021

Studio menggunakan kelas ParticleShapeStatistics:

https://github.com/SCIInstitute/ShapeWorks/blob/master/Libs/Particles/ParticleShapeStatistics.h

FYI, ada beberapa rencana berbeda untuk masa depan analisis statistik termasuk menggunakan R.

akenmorris pada 2 Mar 2021

👍3

Apakah kita berencana membuat pembungkus pybind dari ParticleShapeStatistics?