Pyradiomics: La « fonctionnalité 3D (par tranche) » est-elle la moyenne des fonctionnalités de tranche 2D dérivées de l'ensemble du retour sur investissement 3D ?

Créé le 24 août 2018  ·  5Commentaires  ·  Source: AIM-Harvard/pyradiomics

La « fonctionnalité 3D (par tranche) » est-elle la moyenne des fonctionnalités de tranche 2D dérivées de l'ensemble du retour sur investissement 3D ?

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Non, les tranches sont combinées. Par exemple, dans le cas de GLSZM, 1 matrice sera construite en utilisant les voxels de toutes les tranches. La différence est qu'en 3D, les voxels adjacents sur d'autres tranches sont considérés comme voisins, en force 2D seuls les voxels adjacents sur la même tranche sont voisins. Cela fait que les zones sont respectivement 3D et 2D.

Dans le cas de GLCM, GLRLM, il y a une matrice créée pour chaque angle (décalages indiquant où se trouve le voisin). Les caractéristiques sont ensuite calculées pour chaque matrice et une moyenne est renvoyée. En cas d'extraction 3D, ces angles décrivent des décalages qui se déplacent dans le plan, hors du plan ou les deux. En cas de 2D, seuls les angles dans le plan sont retenus. C'est à dire que moins de matrices sont calculées, mais celles qui le sont, sont identiques à celles calculées en 3D

Tous les 5 commentaires

Qu'entendez-vous par fonctionnalité 3D (par tranche) ? Où est-ce que ça mentionne ça

PyRadiomics a à la fois une extraction 3D et 2D, la différence étant que pour la 2D, aucun décalage qui se déplace entre les tranches n'est utilisé. Par conséquent, il n'y a pas de différence dans les caractéristiques de premier ordre ou de forme et pour les caractéristiques de texture, toutes les tranches sont combinées. voisins.

"force2D [False] : booléen, défini sur true pour forcer un calcul de texture par tranche. La dimension qui identifie la 'tranche' peut être définie dans force2Ddimension"

Compte tenu du ROI 3D et du paramètre "force2d=True", comment les valeurs des caractéristiques seront-elles combinées ? chaque tranche a sa propre valeur de caractéristique de texture, par exemple si A ROI a 32 tranches et force2D est True, il y aura 32 valeurs GLSZM, non? ,comment ces valeurs seront-elles combinées ? moyenne ?

Non, les tranches sont combinées. Par exemple, dans le cas de GLSZM, 1 matrice sera construite en utilisant les voxels de toutes les tranches. La différence est qu'en 3D, les voxels adjacents sur d'autres tranches sont considérés comme voisins, en force 2D seuls les voxels adjacents sur la même tranche sont voisins. Cela fait que les zones sont respectivement 3D et 2D.

Dans le cas de GLCM, GLRLM, il y a une matrice créée pour chaque angle (décalages indiquant où se trouve le voisin). Les caractéristiques sont ensuite calculées pour chaque matrice et une moyenne est renvoyée. En cas d'extraction 3D, ces angles décrivent des décalages qui se déplacent dans le plan, hors du plan ou les deux. En cas de 2D, seuls les angles dans le plan sont retenus. C'est à dire que moins de matrices sont calculées, mais celles qui le sont, sont identiques à celles calculées en 3D

@JoostJM Je pense qu'il serait bien d'ajouter cette explication à la documentation, si ce n'est déjà fait ! Je pense que cette question a déjà été posée.

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