Pyradiomics: “3D 特征(按切片)”是从整个 3d ROI 派生的 2d 切片特征的平均值吗?

创建于 2018-08-24  ·  5评论  ·  资料来源: AIM-Harvard/pyradiomics

“3D 特征(按切片)”是从整个 3d ROI 派生的 2d 切片特征的平均值吗?

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不,切片是组合在一起的。 例如,在 GLSZM 的情况下,将使用来自所有切片的体素构建 1 个矩阵。 不同之处在于,在 3D 中,其他切片上的相邻体素被认为是邻居,而在 2D 中,只有同一切片上的相邻体素才是邻居。 这会导致区域分别为 3D 和 2D。

在 GLCM、GLRLM 的情况下,为每个角度创建一个矩阵(偏移指示相邻位置)。 然后为每个矩阵计算特征并返回平均值。 在 3D 提取的情况下,这些角度描述了在平面内、平面外或两者同时移动的偏移。 在 2D 的情况下,仅保留平面内角度。 即计算较少的矩阵,但那些与 3D 中计算的相同

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3D 特征(按切片)是什么意思? 哪里提到这个?

PyRadiomics 具有 3D 和 2D 提取,不同之处在于对于 2D,不使用切片之间移动的偏移量。 因此,一阶或形状特征没有区别,对于纹理特征,所有切片都组合在一起,例如 GLSZM 仅定义 2D 区域,GLRLM 仅定义面内运行,而 GLCM/NGTDM/GLDM 仅考虑面内相邻体素为邻居。

“force2D [False]:布尔值,设置为 true 以强制按切片纹理计算。标识‘切片’的维度可以在 force2Ddimension 中定义”

给定 3D ROI 并设置“force2d=True”,特征值将如何组合? 每个切片都有其 onw 纹理特征值,例如,如果 ROI 有 32 个切片并且 force2D 为 True,则将有 32 个 GLSZM 值,对吗? ,这些值将如何组合? 平均数 ?

不,切片是组合在一起的。 例如,在 GLSZM 的情况下,将使用来自所有切片的体素构建 1 个矩阵。 不同之处在于,在 3D 中,其他切片上的相邻体素被认为是邻居,而在 2D 中,只有同一切片上的相邻体素才是邻居。 这会导致区域分别为 3D 和 2D。

在 GLCM、GLRLM 的情况下,为每个角度创建一个矩阵(偏移指示相邻位置)。 然后为每个矩阵计算特征并返回平均值。 在 3D 提取的情况下,这些角度描述了在平面内、平面外或两者同时移动的偏移。 在 2D 的情况下,仅保留平面内角度。 即计算较少的矩阵,但那些与 3D 中计算的相同

@JoostJM我认为将此解释添加到文档中会很好,如果它还没有的话! 我想这个问题之前就出现过。

了解了解,谢谢

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