Pyradiomics: É "recurso 3D (por fatia)" a média de recursos 2d-slice derivados de todo o ROI 3D?

Criado em 24 ago. 2018  ·  5Comentários  ·  Fonte: AIM-Harvard/pyradiomics

É "recurso 3D (por fatia)" a média de recursos 2d-slice derivados de todo o ROI 3D?

THX

question

Comentários muito úteis

Não, as fatias são combinadas. Por exemplo, no caso de GLSZM, 1 matriz será construída usando voxels de todas as fatias. A diferença é que em 3D, voxels adjacentes em outras fatias são considerados vizinhos, na força 2D apenas voxels adjacentes na mesma fatia são vizinhos. Isso faz com que as zonas sejam 3D e 2D, respectivamente.

No caso de GLCM, GLRLM, existe uma matriz criada para cada ângulo (deslocamentos indicando onde está o neigbor). Os recursos são calculados para cada matriz e uma média é retornada. No caso de extração 3D, esses ângulos descrevem deslocamentos que se movem no plano, fora do plano ou ambos. No caso de 2D, apenas os ângulos no plano são mantidos. Ou seja, menos matrizes são calculadas, mas aquelas que são, são idênticas às calculadas em 3D

Todos 5 comentários

O que você quer dizer com recurso 3D (por fatia)? Onde menciona isso?

PyRadiomics tem extração 3D e 2D, com a diferença de que para 2D, nenhum deslocamento que se move entre as fatias é usado. Portanto, não há diferença nos recursos de primeira ordem ou forma e para recursos de textura, todas as fatias são combinadas, por exemplo, GLSZM define apenas zonas 2D, GLRLM apenas as execuções no plano e GLCM / NGTDM / GLDM consideram apenas voxels adjacentes no plano como sendo vizinhos.

"force2D [False]: Booleano, definido como verdadeiro para forçar um cálculo de textura por fatia. A dimensão que identifica a 'fatia' pode ser definida em force2Ddimension"

Dado o ROI 3D e a configuração "force2d = True", como os valores dos recursos serão combinados? todas as fatias têm seu próprio valor de recurso de textura, por exemplo, se A ROI tem 32 fatias e force2D é True, haverá 32 valores GLSZM, certo? , como esses valores serão combinados? média ?

Não, as fatias são combinadas. Por exemplo, no caso de GLSZM, 1 matriz será construída usando voxels de todas as fatias. A diferença é que em 3D, voxels adjacentes em outras fatias são considerados vizinhos, na força 2D apenas voxels adjacentes na mesma fatia são vizinhos. Isso faz com que as zonas sejam 3D e 2D, respectivamente.

No caso de GLCM, GLRLM, existe uma matriz criada para cada ângulo (deslocamentos indicando onde está o neigbor). Os recursos são calculados para cada matriz e uma média é retornada. No caso de extração 3D, esses ângulos descrevem deslocamentos que se movem no plano, fora do plano ou ambos. No caso de 2D, apenas os ângulos no plano são mantidos. Ou seja, menos matrizes são calculadas, mas aquelas que são, são idênticas às calculadas em 3D

@JoostJM Acho que seria bom adicionar esta explicação à documentação, se ainda não estiver lá! Acho que essa pergunta já foi feita antes.

Entenda sabe, obrigado

Esta página foi útil?
0 / 5 - 0 avaliações