Scikit-learn: Comportamiento inesperado del análisis de correlación canónica (CCA)

Creado en 23 jun. 2019  ·  3Comentarios  ·  Fuente: scikit-learn/scikit-learn

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Descripción

Dadas dos matrices de vista X y Y , CCA debería devolver las combinaciones lineales n_components de los elementos en X 'sy Y ' s vectores con la correlación más grande, es decir, el primer componente tiene la correlación más grande, el segundo tiene la correlación más grande en una dirección que no está correlacionada con la primera, etc. Sin embargo, en el siguiente código, las segundas columnas son claramente menos correlacionado que las terceras columnas:

Pasos / Código para reproducir

from sklearn.cross_decomposition import CCA
import numpy as np
from scipy import stats

X = [[0.006061109337620652, 0.0392466675239141, -0.04312459861840733], [-0.6652995467596429, 0.2076410843346226, -0.7817536882379651], [-1.4060868112838942, -0.055029478343267685, -1.006415484608637], [-2.170613455952169, -0.15770102997315535, -1.5223958036356375], [-2.895702070412092, -0.20498481413822175, -1.8232022285963847], [-3.687452614812402, -0.543003880524402, -2.2952030829468533], [-4.206168972149556, -0.3365693935548624, -2.841946351795423], [-5.231288268781064, -0.8024321344988571, -3.40532581256557], [-6.095805742721522, -0.9381144689340173, -3.593752186094848], [-6.297988264542059, -0.7231985020991631, -3.9435579269998406], [-7.10897027952524, -0.8639925998765747, -4.264992629284153], [-8.116238092376772, -1.0123970020855437, -4.96858178622968], [-8.969468878952105, -1.0235782019578692, -5.617282941713933], [-9.839359511108077, -1.2819621078971968, -5.8901943190245625], [-10.181936322525571, -0.9904671991812529, -6.240811384647836]]
Y = [[0.032927114749911154, 0.21320841666565743, -0.23427536580450153], [1.431742605643286, 0.23963850202268067, 0.8438745303679628], [2.908798834568648, 0.7357229001312737, 1.325345683629048], [4.438824821921929, 0.9473643810538429, 2.35038560647864], [5.887201894166226, 1.0302756424934638, 2.964806513433767], [7.409049064480012, 1.3070946380395154, 4.347473875547982], [8.51501831350366, 1.3380108570442941, 4.9533251686263275], [10.57244384646805, 2.31627294094068, 6.028949244604159], [12.22872203222364, 2.1165257564864675, 6.923464021607424], [12.664660419747504, 1.8911363532121173, 7.398432173930664], [14.29235367239137, 2.2098221962551343, 8.000538342827351], [16.327977920399373, 2.643183255720207, 9.257671785118596], [18.081288169620517, 2.968898443090926, 10.221747267811098], [19.754046559146662, 3.051682253577557, 11.244435627784393], [20.466418131910004, 2.644933083198568, 11.752014917896375]]

cca = CCA(n_components=3)
cca.fit(X, Y)
X_transformed, Y_transformed = cca.transform(X, Y)

print(X_transformed)

[[ 1.64277244  0.08237031  0.11724683]
 [ 1.41457457 -0.11600721  0.07162219]
 [ 1.18686358  0.00666119  0.08822118]
 [ 0.94070119 -0.02504267 -0.0112954 ]
 [ 0.71314666  0.02919558  0.25990473]
 [ 0.46246267  0.05607036 -0.16424275]
 [ 0.28625435 -0.09546609 -0.02850206]
 [-0.03644528 -0.03407977 -0.55790786]
 [-0.30127324  0.12266269 -0.12622283]
 [-0.37581414 -0.01941656 -0.0343278 ]
 [-0.62900674  0.05973748  0.13448604]
 [-0.95400947  0.0082079  -0.05487306]
 [-1.23214839 -0.07548718 -0.08864002]
 [-1.50031366  0.05776429  0.00665019]
 [-1.61776455 -0.0571703   0.38788062]]

print(Y_transformed)

[[ 1.64131294  0.01428169  0.11343087]
 [ 1.41330957 -0.06169376  0.06929115]
 [ 1.18580457  0.04946041  0.0853499 ]
 [ 0.9398609   0.01613582 -0.01092778]
 [ 0.71251056  0.06356946  0.25144578]
 [ 0.46205587 -0.05371303 -0.15889725]
 [ 0.28599564 -0.05298207 -0.02757442]
 [-0.03641563  0.02220818 -0.53975   ]
 [-0.30099795  0.01004611 -0.12211474]
 [-0.37547807 -0.063071   -0.03321056]
 [-0.62844374  0.02679924  0.13010901]
 [-0.95315959  0.0185694  -0.05308714]
 [-1.23105629  0.03726576 -0.08575511]
 [-1.49897395  0.01483407  0.00643375]
 [-1.61632484 -0.04171028  0.37525653]]

Resultados previstos

La correlación entre las terceras columnas de X_transfomed y Y_transformed es aproximadamente 1, mientras que la correlación entre las segundas columnas es de solo 0,389. Por lo tanto, esperaba que la tercera columna apareciera en el lugar de la segunda columna.

Resultados actuales

Cuando ejecuto CCA con n_components=2 obtengo la primera y la segunda columna, mientras que debería haber obtenido la primera y la tercera.

Versiones

Linux-4.13.0-16-genérico-x86_64-con-Ubuntu-17.10-artful
Python 3.6.3 (predeterminado, 3 de octubre de 2017, 21:45:48)
NumPy 1.14.3
Ciencia ficción 1.2.0
Scikit-Learn 0.19.1

¡Gracias por contribuir!

Todos 3 comentarios

No quiero ser grosero, pero ¿cuál es el propósito de esto? ¿Por qué estás haciendo esto?

Hago esto para obtener los componentes compartidos entre dos vistas de algunos datos.

cómo establecer un valor de umbral usando cca

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