Shapeworks: MacOS पर "femur --groom_images" के साथ क्रैश

को निर्मित 25 मार्च 2021 · 23टिप्पणियाँ · स्रोत: SCIInstitute/ShapeWorks

$ अजगर RunUseCase.py --use_case फीमर --groom_images

...

##### केंद्रित

इनपुट फ़ाइल नाम: आउटपुट/फीमर/ग्रूम्ड/com_aligned/images/m03_L_1x_hip.isores.pad.com.nrrd
आउटपुट फ़ाइल नाम: आउटपुट/फीमर/ग्रूम्ड/सेंटेड/इमेज/m03_L_1x_hip.isores.pad.com.center.nrrd
इनपुट फ़ाइल नाम: आउटपुट/फीमर/ग्रूम्ड/com_aligned/images/m04_L_1x_hip.isores.pad.com.nrrd
.....
इनपुट फ़ाइल नाम: आउटपुट/फीमर/ग्रूम्ड/com_aligned/images/n19_L_1x_hip.isores.pad.com.nrrd
आउटपुट फ़ाइल नाम: आउटपुट/फीमर/ग्रूम्ड/सेंटेड/इमेज/n19_L_1x_hip.isores.pad.com.center.nrrd
इनपुट फ़ाइल नाम: आउटपुट/फीमर/ग्रूम्ड/com_aligned/images/n19_R_1x_hip.reflect.isores.pad.com.nrrd
आउटपुट फ़ाइल नाम: आउटपुट/फीमर/ग्रूम्ड/सेंटेड/इमेज/n19_R_1x_hip.reflect.isores.pad.com.center.nrrd
zsh: विभाजन दोष अजगर RunUseCase.py --use_case फीमर --groom_images

यह RC10 के साथ MacOS पर था।

QA bug

स्रोत

akenmorris

सभी 23 टिप्पणियाँ

क्या यह tiny_test के साथ क्रैश होता है?

archanasri 25 मार्च 2021

Little_test क्रैश नहीं होता है।

akenmorris 25 मार्च 2021

परावर्तित फीमर के साथ कुछ लेना-देना हो सकता है, क्योंकि छोटे परीक्षण ने केवल फीमर को छोड़ दिया है।

jadie1 25 मार्च 2021

अद्यतन: मैंने दोबारा जांच की और ऐसा लगता है कि यह लिनक्स पर काम करता है।

akenmorris 25 मार्च 2021

मैंने 2 बाएँ फीमर और एक दाएँ फीमर के साथ tiny_test चलाने की कोशिश की। वहां कोई समस्या नहीं है।

archanasri 25 मार्च 2021

* thread #1, queue = 'com.apple.main-thread', stop reason = EXC_BAD_ACCESS (code=1, address=0x0)
  * frame #0: 0x000000016b8612ad libvnl_algo.dylib`vnl_qr<double>::vnl_qr(this=0x00007ffeefbfd568, M=0x00007ffeefbfd6f0) at vnl_qr.hxx:51:24 [opt]
    frame #1: 0x000000016b85cf1d libvnl_algo.dylib`double vnl_determinant<double>(M=<unavailable>, balance=<unavailable>) at vnl_determinant.hxx:107:14 [opt]
    frame #2: 0x00000003dec807ac _ITKIOImageBasePython.so`___lldb_unnamed_symbol9961$$_ITKIOImageBasePython.so + 252
    frame #3: 0x00000003deba7ff4 _ITKIOImageBasePython.so`___lldb_unnamed_symbol7056$$_ITKIOImageBasePython.so + 132
    frame #4: 0x00000003dec80586 _ITKIOImageBasePython.so`___lldb_unnamed_symbol9956$$_ITKIOImageBasePython.so + 38
    frame #5: 0x00000003dea1d188 _ITKIOImageBasePython.so`___lldb_unnamed_symbol1480$$_ITKIOImageBasePython.so + 1560
    frame #6: 0x00000003ded50753 _ITKIOImageBasePython.so`itk::ProcessObject::UpdateOutputInformation() + 351
    frame #7: 0x00000003dec7fec2 _ITKIOImageBasePython.so`___lldb_unnamed_symbol9945$$_ITKIOImageBasePython.so + 70
    frame #8: 0x00000003ded5b6f4 _ITKIOImageBasePython.so`itk::DataObject::Update() + 18
    frame #9: 0x000000041a65c177 _ITKCommonPython.so`___lldb_unnamed_symbol8759$$_ITKCommonPython.so + 58
    frame #10: 0x000000010002c843 python`_PyMethodDef_RawFastCallKeywords + 131
    frame #11: 0x000000010002c1d6 python`_PyObject_FastCallKeywords + 598
    frame #12: 0x0000000100164bb7 python`call_function + 455
    frame #13: 0x000000010015c604 python`_PyEval_EvalFrameDefault + 20180
    frame #14: 0x0000000100155f04 python`_PyEval_EvalCodeWithName + 532
    frame #15: 0x000000010002c5e3 python`_PyFunction_FastCallKeywords + 403
    frame #16: 0x0000000100164aa7 python`call_function + 183
    frame #17: 0x000000010015c604 python`_PyEval_EvalFrameDefault + 20180
    frame #18: 0x000000010002c535 python`_PyFunction_FastCallKeywords + 229
    frame #19: 0x0000000100164aa7 python`call_function + 183
    frame #20: 0x000000010015cdb0 python`_PyEval_EvalFrameDefault + 22144
    frame #21: 0x0000000100155f04 python`_PyEval_EvalCodeWithName + 532
    frame #22: 0x000000010002c5e3 python`_PyFunction_FastCallKeywords + 403
    frame #23: 0x0000000100164aa7 python`call_function + 183
    frame #24: 0x000000010015c604 python`_PyEval_EvalFrameDefault + 20180
    frame #25: 0x0000000100155f04 python`_PyEval_EvalCodeWithName + 532
    frame #26: 0x00000001001c1afb python`PyRun_FileExFlags + 235
    frame #27: 0x00000001001c14c6 python`PyRun_SimpleFileExFlags + 502
    frame #28: 0x00000001001ede30 python`pymain_run_file + 160
    frame #29: 0x00000001001ed72b python`pymain_run_filename + 123
    frame #30: 0x00000001001ecf11 python`pymain_run_python + 145
    frame #31: 0x00000001001ecb8b python`pymain_main + 27
    frame #32: 0x00000001000018c9 python`main + 89
    frame #33: 0x00007fff6aedfcc9 libdyld.dylib`start + 1
    frame #34: 0x00007fff6aedfcc9 libdyld.dylib`start + 1

क्या यह #1168 से संबंधित हो सकता है?

akenmorris 25 मार्च 2021

ITKIOImageBasePython.so इस स्टैक ट्रेस में क्यों दिखाई दे रहा है? मुझे लगा कि हम शेपवर्क्स पायथन बाइंडिंग (जैसे इमेज क्लास) का उपयोग कर रहे हैं?

akenmorris 25 मार्च 2021

इसके अलावा, कुछ चेतावनियां lldb दुर्घटनाग्रस्त होने से ठीक पहले थूकती हैं:

2021-03-25 11:57:01.360622-0600 python[22532:5953417] dynamic_cast error 1: Both of the following type_info's should have public visibility. At least one of them is hidden. N3itk10DataObjectE, N3itk5ImageIfLj3EEE.
2021-03-25 11:57:01.360667-0600 python[22532:5953417] dynamic_cast error 2: One or more of the following type_info's has hidden visibility or is defined in more than one translation unit. They should all have public visibility. N3itk10DataObjectE, N3itk5ImageIfLj3EEE, N3itk9ImageBaseILj3EEE.
2021-03-25 11:57:01.905525-0600 python[22532:5953417] dynamic_cast error 1: Both of the following type_info's should have public visibility. At least one of them is hidden. N3itk10DataObjectE, N3itk5ImageIfLj3EEE.
2021-03-25 11:57:01.905556-0600 python[22532:5953417] dynamic_cast error 2: One or more of the following type_info's has hidden visibility or is defined in more than one translation unit. They should all have public visibility. N3itk10DataObjectE, N3itk5ImageIfLj3EEE, N3itk9ImageBaseILj3EEE.
2021-03-25 11:57:02.113545-0600 python[22532:5953417] dynamic_cast error 1: Both of the following type_info's should have public visibility. At least one of them is hidden. N3itk10DataObjectE, N3itk5ImageIfLj3EEE.
2021-03-25 11:57:02.113577-0600 python[22532:5953417] dynamic_cast error 2: One or more of the following type_info's has hidden visibility or is defined in more than one translation unit. They should all have public visibility. N3itk10DataObjectE, N3itk5ImageIfLj3EEE, N3itk9ImageBaseILj3EEE.
2021-03-25 11:57:02.646500-0600 python[22532:5953417] dynamic_cast error 1: Both of the following type_info's should have public visibility. At least one of them is hidden. N3itk10DataObjectE, N3itk5ImageIfLj3EEE.
2021-03-25 11:57:02.646531-0600 python[22532:5953417] dynamic_cast error 2: One or more of the following type_info's has hidden visibility or is defined in more than one translation unit. They should all have public visibility. N3itk10DataObjectE, N3itk5ImageIfLj3EEE, N3itk9ImageBaseILj3EEE.
2021-03-25 11:57:03.535838-0600 python[22532:5953417] dynamic_cast error 1: Both of the following type_info's should have public visibility. At least one of them is hidden. N3itk10DataObjectE, N3itk5ImageIfLj3EEE.
2021-03-25 11:57:03.535870-0600 python[22532:5953417] dynamic_cast error 2: One or more of the following type_info's has hidden visibility or is defined in more than one translation unit. They should all have public visibility. N3itk10DataObjectE, N3itk5ImageIfLj3EEE, N3itk9ImageBaseILj3EEE.
2021-03-25 11:57:05.224328-0600 python[22532:5953417] dynamic_cast error 1: Both of the following type_info's should have public visibility. At least one of them is hidden. N3itk10DataObjectE, N3itk5ImageIfLj3EEE.
2021-03-25 11:57:05.224362-0600 python[22532:5953417] dynamic_cast error 2: One or more of the following type_info's has hidden visibility or is defined in more than one translation unit. They should all have public visibility. N3itk10DataObjectE, N3itk5ImageIfLj3EEE, N3itk9ImageBaseILj3EEE.

akenmorris 25 मार्च 2021

क्या यह बाएं आलिंद उपयोग के मामले में भी केंद्र के चरण में हो रहा है?

jadie1 25 मार्च 2021

क्या यह डीबग में भी दुर्घटनाग्रस्त हो जाता है? यह एक पूर्ण स्टैक ट्रेस प्रकट कर सकता है। तब से
इमेज को itk::Image के आस-पास बनाया गया है शेपवर्क्स इमेज फ़ंक्शंस के लिए कुछ कॉल
बस अनुकूलित किया जा सकता है।

बहुत पहले और बहुत दूर (शाखा अब मौजूद नहीं हो सकती है) मैंने निर्माण करने की कोशिश की
itk की पायथन बाइंडिंग itk के साथ build_dependencies में है, लेकिन मैं नहीं था
सफल। मुझे संदेह है कि यह एक और जाने लायक है, खासकर जब से कोंडा/पाइप is
विशेष रूप से कुछ के विभिन्न संस्करणों को स्थापित करना, लेकिन सभी को नहीं, itk python
घटक (5.0 और 5.1), मुसीबत के लिए एक स्पष्ट नुस्खा।

गुरु, 25 मार्च, 2021 को पूर्वाह्न 11:59 बजे एलन मॉरिस @ । * >
लिखा था:

धागा # 1, कतार = 'com.apple.main-थ्रेड', कारण रोकें = EXC_BAD_ACCESS (कोड = 1, पता = 0x0)

फ़्रेम #0: 0x000000016b8612ad libvnl_algo.dylib vnl_qr<double>::vnl_qr(this=0x00007ffeefbfd568, M=0x00007ffeefbfd6f0) at vnl_qr.hxx:51:24 [opt] frame #1: 0x000000016b85cf1d libvnl_algo.dylib डबल vnl_determinant(एम =, संतुलन =) vnl_determinant पर। एचएक्सएक्स:107 :14 [ऑप्ट]

फ़्रेम #2: 0x00000003dec807ac _ITKIOImageBasePython.so ___lldb_unnamed_symbol9961$$_ITKIOImageBasePython.so + 252 frame #3: 0x00000003deba7ff4 _ITKIOImageBasePython.so ___lldb_unnamed_symbol7056$$_ITKIOImageBasePython.so + 132

फ़्रेम #4: 0x00000003dec80586 _ITKIOImageBasePython.so ___lldb_unnamed_symbol9956$$_ITKIOImageBasePython.so + 38 frame #5: 0x00000003dea1d188 _ITKIOImageBasePython.so ___lldb_unnamed_symbol1480$$_ITKIOImageBasePython.so + 1560

फ़्रेम #6: 0x00000003ded50753 _ITKIOImageBasePython.so itk::ProcessObject::UpdateOutputInformation() + 351 frame #7: 0x00000003dec7fec2 _ITKIOImageBasePython.so ___lldb_unnamed_symbol9945$$_ITKIOImageBasePython.so + 70

फ़्रेम #8: 0x00000003ded5b6f4 _ITKIOImageBasePython.so itk::DataObject::Update() + 18 frame #9: 0x000000041a65c177 _ITKCommonPython.so ___lldb_unnamed_symbol8759$$_ITKCommonPython.so + 58

फ्रेम #10: 0x000000010002c843 अजगर _PyMethodDef_RawFastCallKeywords + 131 frame #11: 0x000000010002c1d6 python _PyObject_FastCallकीवर्ड + 598

फ्रेम #12: 0x0000000100164bb7 अजगर call_function + 455 frame #13: 0x000000010015c604 python _PyEval_EvalFrameDefault + 20180

फ्रेम #14: 0x0000000100155f04 अजगर _PyEval_EvalCodeWithName + 532 frame #15: 0x000000010002c5e3 python _PyFunction_FastCallकीवर्ड + 403

फ्रेम #16: 0x0000000100164aa7 अजगर call_function + 183 frame #17: 0x000000010015c604 python _PyEval_EvalFrameDefault + 20180

फ्रेम #18: 0x000000010002c535 अजगर _PyFunction_FastCallKeywords + 229 frame #19: 0x0000000100164aa7 python call_function + 183

फ्रेम #20: 0x000000010015cdb0 अजगर _PyEval_EvalFrameDefault + 22144 frame #21: 0x0000000100155f04 python _PyEval_EvalCodeWithName + 532

फ्रेम #22: 0x000000010002c5e3 अजगर _PyFunction_FastCallKeywords + 403 frame #23: 0x0000000100164aa7 python call_function + 183

फ्रेम #24: 0x000000010015c604 अजगर _PyEval_EvalFrameDefault + 20180 frame #25: 0x0000000100155f04 python _PyEval_EvalCodeWithName + 532

फ्रेम #26: 0x00000001001c1afb अजगर PyRun_FileExFlags + 235 frame #27: 0x00000001001c14c6 python PyRun_SimpleFileExFlags + 502

फ्रेम #28: 0x00000001001ede30 अजगर pymain_run_file + 160 frame #29: 0x00000001001ed72b python pymain_run_filename + 123

फ्रेम #30: 0x00000001001ecf11 अजगर pymain_run_python + 145 frame #31: 0x00000001001ecb8b python pymain_main + 27

फ्रेम #32: 0x00000001000018c9 अजगर main + 89 frame #33: 0x00007fff6aedfcc9 libdyld.dylib प्रारंभ + 1

फ्रेम #34: 0x00007fff6aedfcc9 libdyld.dylib`start + 1

क्या यह #1168 . से संबंधित हो सकता है
https://github.com/SCIInstitute/ShapeWorks/issues/1168
-
आप इसे प्राप्त कर रहे हैं क्योंकि आपको असाइन किया गया था।
इस ईमेल का सीधे उत्तर दें, इसे GitHub पर देखें
https://github.com/SCIInstitute/ShapeWorks/issues/1179#issuecomment-807193351 ,
या सदस्यता समाप्त करें
https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AAJT3EKCRFSERHDJ5XDPHCDTFN2ZPANCNFSM4ZZUXDBQ
.

cchriste 25 मार्च 2021

अद्यतन। ठीक है, मैं पायथन आउटपुट से भ्रमित था, मैंने मान लिया कि यह अभी भी केंद्र के कदम पर था क्योंकि आगे कोई आउटपुट नहीं था। यह FindReferenceImage में क्रैश हो रहा है:

    dim = itk.GetArrayFromImage(itk.imread(inDataList[i])).shape

मेरा अनुमान है कि समस्या यह है कि हमारे पास स्मृति में लोड दो अलग-अलग आईटीके पुस्तकालय हैं। मैं

akenmorris 25 मार्च 2021

बहुत पहले और बहुत दूर (शाखा अब मौजूद नहीं हो सकती है) मैंने itk के पायथन बाइंडिंग को itk के साथ build_dependencies में बनाने की कोशिश की, लेकिन मैं सफल नहीं हुआ। मुझे संदेह है कि यह एक और जाने लायक है, खासकर जब से कोंडा/पाइप विशेष रूप से कुछ के विभिन्न संस्करणों को स्थापित कर रहा है, लेकिन सभी नहीं, itk अजगर घटक (5.0 और 5.1), परेशानी के लिए एक स्पष्ट नुस्खा।

मैं सहमत हूं कि यह इस मुद्दे को ठीक कर सकता है, लेकिन #1168 के बारे में क्या। क्या हमें फिर से शुरू से itkwidgets बनाने और इसे प्रदान करने की आवश्यकता है ताकि यह हमारे ITK के साथ निर्मित हो?

akenmorris 25 मार्च 2021

😕1

मैं सहमत हूं कि यह इस मुद्दे को ठीक कर सकता है, लेकिन #1168 के बारे में क्या। क्या हमें फिर से शुरू से itkwidgets बनाने और इसे प्रदान करने की आवश्यकता है ताकि यह हमारे ITK के साथ निर्मित हो?

यदि यह एक साझा पुस्तकालय समस्या है, तो शायद हम नोटबुक चलाने से पहले LD_LIBRARY_PATH सेट कर सकते हैं।
अद्यतन: मैंने यह कोशिश की और परिणाम वही था
अद्यतन 2: मैंने केवल # 1168 उपयोग के मामले की कोशिश की, यह नहीं।

cchriste 26 मार्च 2021

यह FindReferenceImage में क्रैश हो रहा है:
    dim = itk.GetArrayFromImage(itk.imread(inDataList[i])).shape

शेपवर्क्स इस कॉल में शामिल नहीं है। मुझे आश्चर्य है कि pdb माध्यम से इसे चलाकर अधिक जानकारी साफ़ की जा सकती है:
python -m pub RunUseCase.py --use_case femur --groom_images (फिर चलाने के लिए 'r' दबाएं)

(मैं इसे अभी चला रहा हूं। क्रैश होने में कितना समय लगता है? क्या कोई इसे कम करने में सक्षम है?)
अद्यतन: इसमें इतना लंबा (~ एक घंटा) लगता है, लेकिन कम मददगार यह है कि यह केवल एक seg दोष की रिपोर्ट करता है और आपको डीबगर में भी नहीं छोड़ता है। मुझे बाहरी स्क्रिप्ट के लिए कोई कॉल नहीं दिख रही है, इसलिए मैं इससे भ्रमित हूं।

cchriste 26 मार्च 2021

समस्या यह प्रतीत होती है कि पायथन आईटीके पुस्तकालय हमारे वीएक्सएल पुस्तकालय को हल कर रहा है और इसके साथ बनाया गया है:

  * frame #0: 0x000000016b8612ad libvnl_algo.dylib`vnl_qr<double>::vnl_qr(this=0x00007ffeefbfd568, M=0x00007ffeefbfd6f0) at vnl_qr.hxx:51:24 [opt]
    frame #1: 0x000000016b85cf1d libvnl_algo.dylib`double vnl_determinant<double>(M=<unavailable>, balance=<unavailable>) at vnl_determinant.hxx:107:14 [opt]
    frame #2: 0x00000003dec807ac _ITKIOImageBasePython.so`___lldb_unnamed_symbol9961$$_ITKIOImageBasePython.so + 252
    frame #3: 0x00000003deba7ff4 _ITKIOImageBasePython.so`___lldb_unnamed_symbol7056$$_ITKIOImageBasePython.so + 132

याद रखें कि हम अपने आईटीके को वैकल्पिक वीएक्सएल/वीएनएल के साथ बनाते हैं, आईटीके नहीं। libvnl_algo.dylib हमारा है, _ITKIOImageBasePython.so कोंडा से है।

हम विभिन्न संस्करणों को मिला रहे हैं, इसलिए इसमें कोई आश्चर्य की बात नहीं है कि यह क्रैश हो रहा है।

akenmorris 26 मार्च 2021

@archanasri और मैंने अभी शामिल करने के क्रम को उलटने की कोशिश की (फिर से, परीक्षण # 1168), और यह विफल हो गया।
मुझे लगता है कि #1168 समस्या का समाधान केवल itkwidgets बनाने के लिए है (हम इसे अभी कोशिश कर रहे हैं)।
इस मुद्दे के लिए, क्या हम इसे अपने vnl इंगित कर सकते हैं जैसे हम इसे अपने eigen इंगित करते हैं?

cchriste 26 मार्च 2021

हमारे पास पहले से ही हमारे वीएक्सएल का उपयोग कर आईटीके है।

-DITK_USE_SYSTEM_VXL=on -DVXL_DIR=${INSTALL_DIR}

akenmorris 26 मार्च 2021

अद्यतन। ठीक है, मैं पायथन आउटपुट से भ्रमित था, मैंने मान लिया कि यह अभी भी केंद्र के कदम पर था क्योंकि आगे कोई आउटपुट नहीं था। यह FindReferenceImage में क्रैश हो रहा है:
    dim = itk.GetArrayFromImage(itk.imread(inDataList[i])).shape
मेरा अनुमान है कि समस्या यह है कि हमारे पास स्मृति में लोड दो अलग-अलग आईटीके पुस्तकालय हैं। मैं

अजगर itk का उपयोग करने के बजाय, हम Shapeworks.Image.toArray() का उपयोग कर सकते हैं। तो मैंने बदल दिया

dim = itk.GetArrayFromImage(itk.imread(inDataList[i])).shape

साथ

img = Image(inDataList[i])
tmp = img.toArray()
dim = tmp.shape

यह अब दुर्घटनाग्रस्त नहीं होता है।

archanasri 26 मार्च 2021

🎉1

अच्छा @archanasri। हाँ, मुझे लगा कि हम इस तरह से इसके आसपास हो सकते हैं। हमें मूल रूप से यह सुनिश्चित करने की आवश्यकता है कि हम एक ही समय में अजगर itk + हमारे itk का उपयोग नहीं करते हैं। मुझे लगता है कि itkwidgets समस्या बड़ी समस्या है, हालांकि मुझे लगता है कि यह आंतरिक रूप से आईटीके पायथन इंटरफ़ेस का उपयोग करता है।

akenmorris 26 मार्च 2021

हाँ और हम itkwidgets बनाने में सक्षम नहीं हैं।
हमें अपने itk का उपयोग करने के लिए itkwidgets के लिए एक रास्ता खोजने की जरूरत है।

archanasri 26 मार्च 2021

हाँ और हम itkwidgets बनाने में सक्षम नहीं हैं।
हमें अपने itk का उपयोग करने के लिए itkwidgets के लिए एक रास्ता खोजने की जरूरत है।

itkwidgets 0.32.0 (नवीनतम टैग किया गया संस्करण) setup.py में यह इन आवश्यकताओं को निर्दिष्ट करता है:

    'install_requires': [
        'colorcet>=2.0.0',
        'itk-core>=5.1.0.post2',
        'itk-filtering>=5.1.0.post2',
        'itk-meshtopolydata>=0.6.2',
        'ipydatawidgets>=4.0.1',
        'ipywidgets>=7.5.1',
        'ipympl>=0.4.1',
        'matplotlib',
        'numpy',
        'six',
        'zstandard',
    ],

इसके लिए, मुझे लगता है कि यह हमें अजगर के निर्माण में वापस लाता है।
इस तक पहुंचने का एक और तरीका यह सुनिश्चित करना होगा कि ये पीआईपी (ज्यादातर) और कोंडा द्वारा स्थापित संस्करण हैं।
मेरे सिस्टम पर इन सभी के संस्करण सभी नए हैं।

यही सब कुछ मेरे पास है:

(shapeworks) cam<strong i="15">@ananda</strong>:~/code/ShapeWorks/ShapeWorks/Examples/Python$ conda list | grep itk
itk                       5.0.1                    pypi_0    pypi
itk-core                  5.1.2                    pypi_0    pypi
itk-filtering             5.1.2                    pypi_0    pypi
itk-io                    5.0.1                    pypi_0    pypi
itk-meshtopolydata        0.6.3                    pypi_0    pypi
itk-numerics              5.1.2                    pypi_0    pypi
itk-registration          5.0.1                    pypi_0    pypi
itk-segmentation          5.0.1                    pypi_0    pypi
itkwidgets                0.32.0                   pypi_0    pypi
(shapeworks) cam<strong i="16">@ananda</strong>:~/code/ShapeWorks/ShapeWorks/Examples/Python$ conda list | grep ipy
brotlipy                  0.7.0           py37hf967b71_1001    conda-forge
ipycanvas                 0.8.2                    pypi_0    pypi
ipydatawidgets            4.2.0                    pypi_0    pypi
ipyevents                 0.8.2                    pypi_0    pypi
ipykernel                 5.5.0            py37he01cfaa_1    conda-forge
ipympl                    0.7.0                    pypi_0    pypi
ipython                   7.21.0           py37he01cfaa_0    conda-forge
ipython_genutils          0.2.0                      py_1    conda-forge
ipyvtk-simple             0.1.4                    pypi_0    pypi
ipywidgets                7.6.3                    pypi_0    pypi

एक लाल झंडा itk-io, -registration, -segmentation, और सबसे बढ़कर, itk के 5.0.1 संस्करण हैं।

cchriste 26 मार्च 2021

मैंने पाइप इंस्टाल को नवीनतम में अपडेट किया (ऐसा कुछ कारण था जो हम ऐसा नहीं कर सके, लेकिन अभी के लिए इसे एक तरफ रख दिया) और सभी निर्भरताओं को फिर से बनाया। #1168 अभी भी उसी तरह से क्रैश होता है जैसा उसमें वर्णित है।

cchriste 26 मार्च 2021

स्थिर।

akenmorris 31 मार्च 2021

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Shapeworks: MacOS पर "femur --groom_images" के साथ क्रैश

##### केंद्रित

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