<p>Pengujian ShapeWorks 6.0</p>

Dibuat pada 2 Mar 2021  ·  16Komentar  ·  Sumber: SCIInstitute/ShapeWorks

Harap edit dan tambahkan yang menunjukkan keberhasilan dan yang menunjukkan kegagalan atau untuk pengujian yang sedang berlangsung dengan nama pengguna Anda saat Anda menyelesaikan tugas untuk platform tertentu. Saat pengujian gagal, tambahkan masalah github dan tautkan (* masalah saat telah diperbaiki dan siap untuk diuji lagi). Juga, lanjutkan dan tambahkan tugas baru yang mungkin belum ada di sini.

Harap gunakan kandidat rilis terbaru untuk semua pengujian (hati-hati dengan shapeworks yang ada di $PATH Anda). Yang terbaru dapat ditemukan di sini:

https://github.com/SCIInstitute/ShapeWorks/releases/tag/v6.0.0-rc10

Contoh:

| | Jendela | Mac | Linux |
|------------------|-----------------------------| --------------|----------------|
| Notebook | | (@archanasri) | |
| Kasus penggunaan: Ellipsoid | ( @akenmorris ) | | |
| Usecase: Semua tes kecil | (#1073) | (@ckriste) | |

Oke, sekarang hal yang nyata!

| | Jendela | Mac | Linux |
|------------------|-----------------------------| --------------|----------------|
| Instalasi bersih | (@cchriste) (#1097, #198) |✅ ( @akenmorris RC10) | |
| Notebook: memulai-dengan-jupyter-notebook | (@ckriste) | ( @akenmorris RC10) | ( @jadie1 , @riddhishb) |
| Notebook: pengaturan-up-shapeworks-lingkungan | (@ckriste) | ( @akenmorris RC10) | ( @jadie1 , @riddhishb)|
| Notebook: memulai-dengan-segmentasi | (@cchriste) (#1113) | ( @akenmorris RC10) | ( @jadie1 RC10) |
| Notebook: memulai-dengan-menjelajahi-segmentasi | (@ccriste) (#1113)| ( @akenmorris RC10) | ( @jadie1 RC10) |
| Notebook: memulai-dengan-jejaring | (@cchriste) (#1142) | ( @akenmorris RC10) | ( @jadie1 RC10) |
| Notebook: memulai-dengan-tambahan data | (@ckriste) | (@akenmorris) | (@jadie1) |
| Notebook: memulai-dengan-bentuk-generasi kohort | (@cchriste) (#1113) | (@akenmorris) | ( @jadie1 RC10) |
| Kasus penggunaan: ellipsoid | ( @akenmorris RC10) | (@akenmorris) |✅ ( @jadie1 RC10) |
| Kasus penggunaan: ellipsoid --tiny_test | (@akenmorris) | (@archanasri) | ( @jadie1 , @riddhishb)|
| Kasus penggunaan: ellipsoid_cut | ( @akenmorris RC10) | (@akenmorris) | (✅ @jadie1 RC10) |
| Kasus penggunaan: ellipsoid_cut --tiny_test |✅ (@akenmorris) | (@archanasri) | (@jadie1) |
| Kasus penggunaan: ellipsoid_evaluate | (@akenmorris) (RC6) | (@akenmorris) (RC6) | (@iyerkrithika21)|
| Kasus penggunaan: ellipsoid_fd | (@ckriste) | (@akenmorris) | ( @jadie1 RC10, @riddhishb)|
| Kasus penggunaan: ellipsoid_mesh | ( @iyerkrithika21 , @cchriste) | (@archanasri) | (@medakk) ( @jadie1 RC10) |
| Kasus penggunaan: ellipsoid_mesh --tiny-test | (@iyerkrithika21) | (@archanasri) | (@medakk) |
| Kasus penggunaan: tulang paha | (@ckriste) | ( @akenmorris RC10) | (@jadie1) |
| Kasus penggunaan: tulang paha --tiny-test | (@iyerkrithika21) | (@archanasri) | (@jadie1) |
| Kasus penggunaan: tulang paha --groom_images | (@ckriste) | (@akenmorris) | (@jadie1) |
| Usecase: tulang paha --groom_images --tiny-test |✅ (@iyerkrithika21) | (@archanasri) | (@jadie1) |
| Kasus penggunaan: femur_mesh | (@ckriste) | (@archanasri) | (@jadie1) |
| Kasus penggunaan: femur_mesh --tiny-test | (@iyerkrithika21)| (@archanasri) | (@jadie1) |
| Kasus penggunaan: femur_cut | (@ckriste) | (akenmorris) | (@jadie1) |
| Kasus penggunaan: femur_cut --tiny-test | (@iyerkrithika21) | (@archanasri) | (@jadie1) |
| Usecase: femur_cut --tiny-test (anisotropic)| (@akenmorris) | (@akenmorris) | (@jadie1) |
| Usecase: left_atrium |✅ ( @akenmorris , @cchriste) | (@akenmorris) | (@jadie1) |
| Usecase: left_atrium --tiny-test |✅ (@akenmorris) | (@archanasri) | (@jadie1) |
| Kasus penggunaan: gumpalan | ( @iyerkrithika21 , @cchriste) | (@akenmorris) | (@jadie1) |
| Usecase: benjolan --tiny-test |✅ (@iyerkrithika21) | (@archanasri) | (@jadie1) |
| Kasus penggunaan: deep_ssm --tiny-test | (@ckriste) | ( @akenmorris RC10) | (@jadie1) |
| Kasus penggunaan: deep_ssm | (@ckriste) | ( @akenmorris RC10) | (@jadie1) |
| Studio: Contoh Ellipsoid | (@akenmorris) | (@akenmorris) | (@medakk) |
| Studio: Contoh Peta Fitur | (@akenmorris) | (@akenmorris) | (@medakk) |
| ... | | | |

Harap simpan komentar tentang masalah ini seminimal mungkin. Mari kita coba menjaga status di tabel dan bukan di komentar.

High Priority

Semua 16 komentar

Apakah kami memiliki instruksi di mana saja tentang cara menguji (katakanlah) notebook? Buka dan jalankan saja?

Aku pikir begitu. Ada instruksi di dalamnya untuk sebagian besar. Mereka biasanya mengharuskan Anda mengunduh data dan meletakkannya di tempat yang tepat. Anda tidak bisa begitu saja membuka dan menjalankan semuanya secara membabi buta.

Mengenai #1102, haruskah jawabannya ya atau tidak?
Tes yang sedang berjalan dijawab ya (gunakan jarak isotropik untuk rasterisasi mesh).

Untuk pengujian? Ini harus bekerja dengan cara apa pun, pengujian dengan ya dan tidak pada tes kecil saja sudah cukup. Tidak perlu menguji seluruh kasus penggunaan dengan keduanya.

Saya telah menonaktifkannya sekarang, tetapi apakah ada cara untuk memberi tahu Windows agar tetap terjaga saat shapework sedang berjalan?

Saya akan merekomendasikan menonaktifkan sleep dalam opsi daya sampai Anda selesai menguji shapework.

Apakah Anda bertanya apakah ada Windows API untuk menonaktifkan sleep, yang dapat diubah oleh program pengguna? Bahkan jika ada, saya akan merekomendasikan untuk tidak mengejar itu.

Saya menjalankan kasus penggunaan deep_ssm dengan RC8 di windows. Ini adalah apa yang berakhir dengan. Apakah ini yang diharapkan? @jadie1

Screenshot (28)

Inilah yang ada di terminal:

Screenshot (29)

@ jadie1 bukankah kita menambahkan plot biola untuk augmentasi data yaitu?

@ jadie1 bukankah kita menambahkan plot biola untuk augmentasi data yaitu?

Ya dan digunakan dalam buku catatan augmentasi data. Saya tidak mengubah kasus penggunaan DeepSSM untuk menggunakannya, saya bisa jika Anda mau.

@jadie1 , haruskah ini dianggap sukses? Bisakah kita menutup masalah dan menandainya sebagai berhasil di atas?

@jadie1 , haruskah ini dianggap sukses? Bisakah kita menutup masalah dan menandainya sebagai berhasil di atas?

Ya, jika di windows atau tidak ada GPU itulah output yang diharapkan.

@ jadie1 bukankah kita menambahkan plot biola untuk augmentasi data yaitu?

Ya dan digunakan dalam buku catatan augmentasi data. Saya tidak mengubah kasus penggunaan DeepSSM untuk menggunakannya, saya bisa jika Anda mau.

@jadie1 untuk konsistensi, mari tambahkan plot biola ke dalam kasus penggunaan ssm. itu juga lebih baik yaitu untuk menyampaikan hasil augmentasi.

Hanya ingin memverifikasi hasil ini terlihat bagus untuk femur_cut penuh. Perjalanan memakan waktu 2-3 hari. Saya menandainya sebagai berhasil di atas, tetapi ingin memastikan. Terima kasih!

Screen Shot 2021-03-10 at 8 05 05 AM

@cchriste , terlihat bagus untuk saya.

@jadie1 , haruskah ini dianggap sukses? Bisakah kita menutup masalah dan menandainya sebagai berhasil di atas?

Ya, jika di windows atau tidak ada GPU itulah output yang diharapkan.

Apakah ada masalah github untuk mengaktifkan pemanfaatan GPU di Windows? Kotak ini memiliki dua dari mereka dan mereka _sangat_ bosan.

Ini akan berfungsi di windows jika pengguna menginstal versi Pytorch yang benar sendiri ke lingkungan ShapeWorks mengikuti dokumen ini: Dukungan GPU PyTorch untuk ShapeWorks . Tampaknya tidak ada cara yang dapat diandalkan untuk secara otomatis mendeteksi versi CUDA di Windows, itulah sebabnya kami tidak menginstal conda_installs.bat dengan dukungan GPU. Kami dapat membuat masalah tetapi saya tidak yakin apakah saat ini ada solusi.

Sayangnya instruksi tersebut tidak menyediakan metode apapun untuk menentukan versi CUDA yang tersedia di Windows (sesuatu akan perlu diinstal, jadi ini adalah proses yang mungkin dimulai di sini . Saya akan memeriksanya lebih lanjut ketika saya memiliki kesempatan.

Saya pikir kita hanya menggunakan dua kasus penggunaan ellipsoid untuk rilis ini. Mungkin ada yang punya ide untuk hal-hal yang belum terpikirkan untuk kami uji? Adakah hal khusus yang harus kami pastikan untuk dijalankan lagi di platform tertentu?

Kasus penggunaan ellipsoid dan notebook bekerja pada cabang one_mode_ellipsoid (masalah #1133). Satu-satunya hal yang kita tunggu adalah parameter perlu disetel untuk kasus penggunaan ellipsoid_cut karena korespondensinya masih belum bagus (masalah #1104). @HeavenlyBerserker dan @akenmorris Haruskah saya membuat PR sekarang untuk cabang one_mode_ellipsoid? Atau tunggu seandainya params ellipsoid_cut diperbarui?

Saya tidak menemukan masalah dengan RC10 di Linux!

Selesai!

Apakah halaman ini membantu?
0 / 5 - 0 peringkat