<p>Тестирование ShapeWorks 6.0</p>
Пожалуйста, отредактируйте и добавьте ✅, указывающий на успех, и ❌, указывающий на неудачу, или 🕒 для текущего теста с вашим именем пользователя, когда вы выполняете задачу для данной платформы. Если тест не пройден, добавьте проблему на github и свяжите ее (* проблема, когда она исправлена и готова к повторному тестированию). Кроме того, продолжайте и добавляйте новые задачи, которых здесь еще нет.
Пожалуйста, используйте самый последний релиз-кандидат для всех тестов (будьте осторожны, какой shapeworks находится в вашем $PATH ). Самая последняя находится здесь:
https://github.com/SCIInstitute/ShapeWorks/releases/tag/v6.0.0-rc10
Пример:
| | Окна | Мак | Линукс |
|-----------------|------------------------------| --------------|----------------|
| Ноутбуки | | 🕒 (@archanasri) | |
| Вариант использования: Эллипсоид | ✅ ( @akenmorris ) | | |
| Вариант использования: все крошечные тесты | ❌ (#1073) | ✅ (@cchriste) | |
Хорошо, теперь самое главное!
| | Окна | Мак | Линукс |
|-----------------|------------------------------| --------------|----------------|
| Чистая установка | ✅ (@cchriste) (#1097, #1098) |✅ ( @akenmorris RC10) | |
| Ноутбуки: начало работы с ноутбуками Jupyter | ✅ (@cchriste) | ✅ ( @akenmorris RC10) | ✅ ( @jadie1 , @riddhishb) |
| Ноутбуки: настройка среды shapeworks | ✅ (@cchriste) | ✅ ( @akenmorris RC10) | ✅ ( @jadie1 , @riddhishb)|
| Ноутбуки: начало сегментации | ✅ (@cchriste) (#1113) | ✅ ( @akenmorris RC10) | ✅ ( @jadie1 RC10) |
| Ноутбуки: начало работы с изучением сегментации | ✅ (@cchriste) (#1113)| ✅ ( @akenmorris RC10) | ✅ ( @jadie1 RC10) |
| Блокноты: начало работы с сетками | ✅ (@cchriste) (#1142) | ✅( @akenmorris RC10) | ✅ ( @jadie1 RC10) |
| Ноутбуки: начало работы с увеличением данных | ✅ (@cchriste) | ✅(@akenmorris) | ✅ (@jadie1) |
| Ноутбуки: когорта начала работы с формами | ✅ (@cchriste) (#1113) | ✅ (@akenmorris) | ✅ ( @jadie1 RC10) |
| Вариант использования: эллипсоид | ✅ ( @akenmorris RC10) | ✅ (@akenmorris) |✅ ( @jadie1 RC10) |
| Вариант использования: эллипсоид --tiny_test | ✅ (@akenmorris) | ✅ (@archanasri) | ✅ ( @jadie1 , @riddhishb)|
| Вариант использования: ellipsoid_cut | ✅ ( @akenmorris RC10) | ✅ (@akenmorris) | (✅ @jadie1 RC10) |
| Вариант использования: ellipsoid_cut --tiny_test |✅ (@akenmorris) | ✅ (@archanasri) | ✅ (@jadie1) |
| Вариант использования: ellipsoid_evaluate | ✅ (@akenmorris) (RC6) | ✅ (@akenmorris) (RC6) | ✅ (@iyerkrithika21)|
| Вариант использования: ellipsoid_fd | ✅ (@cchriste) | ✅ (@akenmorris) | ✅ ( @jadie1 RC10, @riddhishb)|
| Вариант использования: ellipsoid_mesh | ✅ ( @iyerkrithika21 , @cchriste) | ✅ (@archanasri) | ✅ (@medakk) ( @jadie1 RC10) |
| Вариант использования: ellipsoid_mesh --tiny-test | ✅ (@iyerkrithika21) | ✅ (@archanasri) | ✅ (@medakk) |
| Вариант использования: бедренная кость | ✅ (@cchriste) | ✅ ( @akenmorris RC10) | ✅ (@jadie1) |
| Вариант использования: бедренная кость --tiny-test | ✅ (@iyerkrithika21) | ✅ (@archanasri) | ✅ (@jadie1) |
| Вариант использования: бедро --groom_images | ✅ (@cchriste) | ✅ (@akenmorris) | ✅ (@jadie1) |
| Вариант использования: бедро --groom_images --tiny-test |✅ (@iyerkrithika21) | ✅ (@archanasri) | ✅ (@jadie1) |
| Пример использования: femur_mesh | ✅ (@cchriste) | ✅ (@archanasri) | ✅ (@jadie1) |
| Пример использования: femur_mesh --tiny-test | ✅ (@iyerkrithika21)| ✅ (@archanasri) | ✅ (@jadie1) |
| Пример использования: femur_cut | ✅ (@cchriste) | ✅ (акенморрис) | ✅ (@jadie1) |
| Пример использования: femur_cut --tiny-test | ✅ (@iyerkrithika21) | ✅ (@archanasri) | ✅ (@jadie1) |
| Пример использования: femur_cut --tiny-test (анизотропный)| ✅ (@akenmorris) | ✅ (@akenmorris) | ✅ (@jadie1) |
| Пример использования: left_atrium |✅ ( @akenmorris , @cchriste) | ✅ (@akenmorris) | ✅ (@jadie1) |
| Пример использования: left_atrium --tiny-test |✅ (@akenmorris) | ✅ (@archanasri) | ✅ (@jadie1) |
| Вариант использования: куски | ✅ ( @iyerkrithika21 , @cchriste) | ✅ (@akenmorris) | ✅ (@jadie1) |
| Пример использования: lumps --tiny-test |✅ (@iyerkrithika21) | ✅ (@archanasri) | ✅ (@jadie1) |
| Вариант использования: deep_ssm --tiny-test | ✅ (@cchriste) | ✅ ( @akenmorris RC10) | ✅ (@jadie1) |
| Вариант использования: deep_ssm | ✅ (@cchriste) | ✅ ( @akenmorris RC10) | ✅ (@jadie1) |
| Studio: пример эллипсоида | ✅ (@akenmorris) | ✅ (@akenmorris) | ✅ (@medakk) |
| Studio: Пример карты объектов | ✅ (@akenmorris) | ✅ (@akenmorris) | ✅ (@medakk) |
| ... | | | |
Пожалуйста, сведите комментарии по этому вопросу к минимуму. Постараемся сохранить статус в таблице, а не в комментариях.
akenmorris
Все 16 Комментарий
Есть ли у нас где-нибудь инструкции по тестированию (скажем) ноутбуков? Просто открыть и запустить?
Я так думаю. В них, в основном, есть инструкции. Обычно они требуют, чтобы вы загрузили данные и поместили их в нужное место. Вы не можете просто вслепую открыть и запустить все.
akenmorris
2 мар. 2021
Что касается № 1102, ответ должен быть да или нет?
Текущий тест дал положительный ответ (использование изотропного интервала для растеризации сетки).
Для тестирования? Это должно работать в любом случае, хотя тестирования с ответами «да» и «нет» только на крошечном тесте должно быть достаточно. Нет необходимости тестировать весь вариант использования с обоими.
jadie1
4 мар. 2021
Я отключил это сейчас, но есть ли способ заставить Windows бодрствовать, когда работает shapeworks?
Я бы порекомендовал отключить спящий режим в параметрах питания, пока вы не закончите тестирование форм.
Вы спрашиваете, есть ли API-интерфейс Windows для отключения сна, который может изменить пользовательская программа? Даже если и есть, я бы не рекомендовал этим заниматься.
akenmorris
4 мар. 2021
Я запустил вариант использования deep_ssm с RC8 в Windows. Вот чем это закончилось. Это то, что ожидается? @jadie1
Вот что было на терминале:
akenmorris
8 мар. 2021
@ jadie1 разве мы не добавили графики скрипки для увеличения данных, а именно?
sheryjoe
8 мар. 2021
@ jadie1 разве мы не добавили графики скрипки для увеличения данных, а именно?
Да, и он используется в блокноте увеличения данных. Я не менял вариант использования DeepSSM, чтобы использовать его, могу, если хотите.
jadie1
8 мар. 2021
@jadie1 , это можно считать успехом? Можем ли мы закрыть проблему и отметить ее как успешную выше?
akenmorris
8 мар. 2021
@jadie1 , это можно считать успехом? Можем ли мы закрыть проблему и отметить ее как успешную выше?
Да, если в Windows или без графического процессора, это ожидаемый результат.
jadie1
8 мар. 2021
@ jadie1 разве мы не добавили графики скрипки для увеличения данных, а именно?
Да, и он используется в блокноте увеличения данных. Я не менял вариант использования DeepSSM, чтобы использовать его, могу, если хотите.
@ jadie1 для согласованности давайте добавим графики скрипки в вариант использования глубокого ssm. это также лучше, а именно, чтобы передать результаты увеличения.
sheryjoe
8 мар. 2021
Просто хотел убедиться, что этот результат выглядит хорошо для полной вырезки бедра. Пробег занял 2-3 дня. Я отметил это как успешное выше, но хотел быть уверенным. Спасибо!
cchriste
10 мар. 2021
@cchriste , мне кажется, хорошо.
akenmorris
10 мар. 2021
@jadie1 , это можно считать успехом? Можем ли мы закрыть проблему и отметить ее как успешную выше?
Да, если в Windows или без графического процессора, это ожидаемый результат.
Есть ли проблема с github для включения использования графических процессоров в Windows? В этой коробке их двое, и им _действительно_ скучно.
Он будет работать в Windows, если пользователь сам установит правильную версию Pytorch в среду ShapeWorks, следуя этому документу: Поддержка графического процессора PyTorch для ShapeWorks . Кажется, нет надежного способа автоматически определить версию CUDA в Windows, поэтому у нас нет conda_installs.bat для установки с поддержкой GPU. Мы можем создать проблему, но я не уверен, что в настоящее время есть решение.
К сожалению, эти инструкции не предоставляют никакого метода для определения версии CUDA, доступной в Windows (необходимо что-то установить, поэтому этот процесс, вероятно, начинается здесь . Я изучу его подробнее, когда у меня будет шанс.
cchriste
10 мар. 2021
Я думаю, что в этом выпуске мы остановились только на двух вариантах использования эллипсоида. Может у кого-нибудь есть идеи для вещей, которые мы просто еще не подумали проверить? Что-то конкретное мы должны обязательно запускать снова на какой-то конкретной платформе?
cchriste
11 мар. 2021
Вариант использования эллипсоида и записная книжка работают над веткой one_mode_ellipsoid (issue #1133). Единственное, чего мы ждем, это параметры, которые нужно настроить для варианта использования ellipsoid_cut, потому что соответствие все еще невелико (issue #1104). @HeavenlyBerserker и @akenmorris Должен ли я сейчас сделать PR для ветки one_mode_ellipsoid? Или подождать, пока параметры ellipsoid_cut обновятся?
jadie1
11 мар. 2021
Я не обнаружил никаких проблем с RC10 в Linux!
jadie1
22 мар. 2021
Сделанный!
akenmorris
31 мар. 2021
Смежные вопросы
jadie1
·
8Комментарии
akenmorris
·
22Комментарии
iyerkrithika21
·
12Комментарии
sheryjoe
·
13Комментарии
cchriste
·
3Комментарии