Mimic-code: MIMIC-III 概述

创建于 2020-01-27  ·  4评论  ·  资料来源: MIT-LCP/mimic-code

我对处理来自精神病患者(特别是精神分裂症患者)的 EHR 数据感兴趣。 MIMIC-III 数据库对我来说似乎很有希望,但是,我不清楚如何粗略了解这个数据集以及它是否符合我的需求。 是否有一个“概述”功能可以为我做到这一点? 我错过了类似精神病 ICD-10 诊断的频率图表之类的东西,让我对精神病患者的数量有直觉。

最有用的评论

据我所知,在 MIMIC 中没有公开的精神病 ICD (-9) 诊断频率图。 您可以探索 MIMIC-III 演示,看看是否可以找到您感兴趣的信息 (https://physionet.org/content/mimiciii-demo/1.4/),但患者人数较少可能会限制您的洞察力. 如果您在此处列出一些 ICD-9 代码,阅读该问题的人可能会抽空查看一下。

所有4条评论

据我所知,在 MIMIC 中没有公开的精神病 ICD (-9) 诊断频率图。 您可以探索 MIMIC-III 演示,看看是否可以找到您感兴趣的信息 (https://physionet.org/content/mimiciii-demo/1.4/),但患者人数较少可能会限制您的洞察力. 如果您在此处列出一些 ICD-9 代码,阅读该问题的人可能会抽空查看一下。

演示数据集仅包含 _“100 名患者的所有重症监护病房 (ICU) 停留”_ 的数据。 所以在我的情况下它没有用(即了解精神病患者的数量及其ICD-9 代码:290-319 )。 对我来说,了解 ICD 诊断的概述会非常有帮助,这样我就可以提前决定参加注册课程是否对我有意义。

例如,签名数据库提供了这样的概述。

首先,这里是一个快速查询,用于提取具有此 ICD-9 代码范围的患者(按不同患者的数量排序):

SELECT a.icd9_code, b.long_title, count(distinct a.subject_id) as n_patient, 
FROM `physionet-data.mimiciii_clinical.diagnoses_icd` a
LEFT JOIN `physionet-data.mimiciii_clinical.d_icd_diagnoses` b
ON a.icd9_code = b.icd9_code
WHERE a.ICD9_CODE BETWEEN '290%' and '319%'
GROUP BY a.icd9_code, b.long_title
ORDER BY count(distinct a.subject_id) DESC
LIMIT 40;

icd9_code | 长标题 | n_患者
-- | -- | --
3051 | 烟草使用障碍 | 3001
311 | 抑郁症,未分类在他处| 2926
30000 | 焦虑状态,未指明 | 1452
2930 | 由于分类在别处的情况而导致的谵妄| 1398
2948 | 其他因分类在他处的疾病而导致的持续性精神障碍 | 1026
30500 | 酒精滥用,未指明 | 954
3004 | 心境障碍 | 928
29181 | 戒酒 | 675
30391 | 其他和未指明的酒精依赖,持续 | 653
30390 | 其他和未指明的酒精依赖,未指明 | 568
29410 | 没有行为障碍的分类在其他地方的痴呆症| 551
29680 | 双相情感障碍,未指明 | 507
30501 | 酗酒,持续| 388
30560 | 可卡因滥用,未指明 | 368
29281 | 药物性谵妄 | 361
30301 | 酒精中毒中的急性酒精中毒,持续 | 301
2910 | 酒精戒断谵妄 | 292
30393 | 缓解中的其他和未指明的酒精依赖 | 281
30401 | 阿片类药物依赖,持续 | 251
30981 | 创伤后应激障碍 | 229
2967 | 双相 I 型障碍,最近发作(或当前)未指明 | 187
29590 | 未指明的精神分裂症,未指明 | 182
30590 | 其他、混合或未指明的药物滥用,未指明 | 177
30550 | 阿片类药物滥用,未指明 | 174
2920 | 停药 | 167
29570 | 分裂情感障碍,未指明 | 163
29620 | 重度抑郁情感障碍,单次发作,未指明 | 158
29420 | 痴呆,未指明,无行为障碍 | 158
3079 | 其他未指定的特殊症状或综合征,未分类在他处 | 153
29040 | 血管性痴呆,无并发症 | 136
2939 | 分类在他处的情况下未特指的短暂性精神障碍 | 130
319 | 未指明的智力障碍 | 129
31401 | 注意缺陷障碍伴多动| 121
30503 | 酒精滥用,缓解| 112
2989 | 未指明的精神病 | 107
30001 | 无广场恐惧症的恐慌症| 104
30400 | 阿片类药物类型依赖性,未指明 | 102
30520 | 大麻滥用,未指明 | 95
29650 | 双相 I 型障碍,最近发作(或当前)抑郁,未指明 | 77
30300 | 酒精中毒中的急性酒精中毒,未指明 | 77

谢谢,这是一个好的开始,正是我想要的。 当然,如果将来可以将此概述作为功能实现,它仍然是实用的。

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