Mimic-code: Vue d'ensemble sur MIMIC-III

Il n'y a pas de tableau de fréquence accessible au public pour les diagnostics psychiatriques CIM (-9) dans MIMIC, pour autant que je sache. Vous pouvez explorer la démo MIMIC-III pour voir si vous pouvez trouver les informations qui vous intéressent (https://physionet.org/content/mimiciii-demo/1.4/), mais le petit nombre de patients peut limiter vos connaissances . Si vous listez certains codes ICD-9 ici, quelqu'un qui lit le numéro peut trouver le temps d'y jeter un coup d'œil.

L'ensemble de données de démonstration contient uniquement des données pour _"tous les séjours en unité de soins intensifs (USI) pour 100 patients"_. Donc, ce n'est pas utile dans mon cas (c'est-à-dire obtenir un aperçu du nombre de patients psychiatriques et de leurs codes ICD-9 : 290-319 ). Pour moi, il serait très utile d'avoir un aperçu des diagnostics ICD afin que je puisse décider à l'avance s'il est logique pour moi de suivre le cours d'inscription.

Par exemple, la banque de données des signatures offre une telle vue d'ensemble.

Pour commencer, voici une requête rapide pour extraire les patients avec cette gamme de codes ICD-9 (classés par nombre de patients distincts) :

SELECT a.icd9_code, b.long_title, count(distinct a.subject_id) as n_patient, 
FROM `physionet-data.mimiciii_clinical.diagnoses_icd` a
LEFT JOIN `physionet-data.mimiciii_clinical.d_icd_diagnoses` b
ON a.icd9_code = b.icd9_code
WHERE a.ICD9_CODE BETWEEN '290%' and '319%'
GROUP BY a.icd9_code, b.long_title
ORDER BY count(distinct a.subject_id) DESC
LIMIT 40;

code_icd9 | titre_long | n_patient
-- | -- | --
3051 | Trouble du tabagisme | 3001
311 | Trouble dépressif, non classé ailleurs | 2926
30000 | État d'anxiété, sans précision | 1452
2930 | Délire dû à des affections classées ailleurs | 1398
2948 | Autres troubles mentaux persistants dus à des affections classées ailleurs | 1026
30500 | Abus d'alcool, sans précision | 954
3004 | Trouble dysthymique | 928
29181 | Sevrage alcoolique | 675
30391 | Dépendance à l'alcool, autre et sans précision, continue | 653
30390 | Dépendance à l'alcool, autre et sans précision, sans précision | 568
29410 | Démence dans des affections classées ailleurs sans perturbation du comportement | 551
29680 | Trouble bipolaire, sans précision | 507
30501 | Abus d'alcool, continu | 388
30560 | Abus de cocaïne, sans précision | 368
29281 | Délire d'origine médicamenteuse | 361
30301 | Intoxication alcoolique aiguë dans l'alcoolisme, continue | 301
2910 | Délire de sevrage alcoolique | 292
30393 | Dépendance à l'alcool, autre et sans précision, en rémission | 281
30401 | Dépendance de type opioïde, continue | 251
30981 | Trouble de stress post-traumatique | 229
2967 | Trouble bipolaire I, épisode le plus récent (ou actuel) sans précision | 187
29590 | Schizophrénie, sans précision | 182
30590 | Abus de drogues autre, mixte ou non précisé, sans précision | 177
30550 | Abus d'opioïdes, sans précision | 174
2920 | Sevrage médicamenteux | 167
29570 | Trouble schizo-affectif, sans précision | 163
29620 | Trouble affectif dépressif majeur, épisode unique, sans précision | 158
29420 | Démence, sans précision, sans trouble du comportement | 158
3079 | Symptômes ou syndromes particuliers, autres et sans précision, non classés ailleurs | 153
29040 | Démence vasculaire, non compliquée | 136
2939 | Trouble mental transitoire, sans précision, dans des affections classées ailleurs | 130
319 | Déficience intellectuelle non précisée | 129
31401 | Trouble déficitaire de l'attention avec hyperactivité | 121
30503 | Abus d'alcool, en rémission | 112
2989 | Psychose, sans précision | 107
30001 | Trouble panique sans agoraphobie | 104
30400 | Dépendance de type opioïde, sans précision | 102
30520 | Abus de cannabis, sans précision | 95
29650 | Trouble bipolaire I, épisode le plus récent (ou en cours) dépressif, sans précision | 77
30300 | Intoxication alcoolique aiguë dans l'alcoolisme, sans précision | 77

Merci, c'est un bon début et c'est exactement ce que je voulais. Bien sûr, ce serait toujours pratique si cette vue d'ensemble pouvait être mise en œuvre en tant que fonctionnalité à l'avenir.