Mimic-code: Descripción general de MIMIC-III

No hay un gráfico de frecuencia disponible públicamente para los diagnósticos psiquiátricos de ICD (-9) en MIMIC, que yo sepa. Puede explorar la demostración de MIMIC-III para ver si puede encontrar la información que le interesa (https://physionet.org/content/mimiciii-demo/1.4/), pero el pequeño número de pacientes podría limitar sus conocimientos. . Si enumera algunos códigos ICD-9 aquí, alguien que lea el problema puede encontrar el tiempo para echar un vistazo.

El conjunto de datos de demostración contiene solo datos para _"todas las estancias en la unidad de cuidados intensivos (UCI) para 100 pacientes"_. Por lo tanto, no es útil en mi caso (es decir, obtener una descripción general sobre el número de pacientes psiquiátricos y sus códigos ICD-9: 290-319 ). Para mí, sería muy útil obtener una descripción general de los diagnósticos de ICD para poder decidir de antemano si tiene sentido para mí tomar el curso de registro.

Por ejemplo, el banco de datos de firmas ofrece una visión general de este tipo.

Para empezar, aquí hay una consulta rápida para extraer pacientes con este rango de códigos ICD-9 (ordenados por número de pacientes distintos):

SELECT a.icd9_code, b.long_title, count(distinct a.subject_id) as n_patient, 
FROM `physionet-data.mimiciii_clinical.diagnoses_icd` a
LEFT JOIN `physionet-data.mimiciii_clinical.d_icd_diagnoses` b
ON a.icd9_code = b.icd9_code
WHERE a.ICD9_CODE BETWEEN '290%' and '319%'
GROUP BY a.icd9_code, b.long_title
ORDER BY count(distinct a.subject_id) DESC
LIMIT 40;

código_icd9 | título_largo | n_paciente
-- | -- | --
3051 | Trastorno por consumo de tabaco | 3001
311 | Trastorno depresivo, no clasificado en otra parte | 2926
30000 | Estado de ansiedad, no especificado | 1452
2930 | Delirio debido a condiciones clasificadas en otra parte | 1398
2948 | Otros trastornos mentales persistentes debidos a condiciones clasificadas en otra parte | 1026
30500 | Abuso de alcohol, no especificado | 954
3004 | Trastorno distímico | 928
29181 | Abstinencia de alcohol | 675
30391 | Otra dependencia del alcohol y la no especificada, continua | 653
30390 | Otra dependencia del alcohol y la no especificada, no especificada | 568
29410 | Demencia en condiciones clasificadas en otra parte sin alteración del comportamiento | 551
29680 | Trastorno bipolar, no especificado | 507
30501 | Abuso de alcohol, continuo | 388
30560 | Abuso de cocaína, no especificado | 368
29281 | Delirio inducido por fármacos | 361
30301 | Intoxicación alcohólica aguda en el alcoholismo continuo | 301
2910 | Delirio por abstinencia de alcohol | 292
30393 | Otra dependencia del alcohol y la no especificada, en remisión | 281
30401 | Dependencia de tipo opioide, continua | 251
30981 | Trastorno de estrés postraumático | 229
2967 | Trastorno bipolar I, episodio más reciente (o actual) no especificado | 187
29590 | Esquizofrenia no especificada, no especificada | 182
30590 | Otro abuso de drogas, mixto o no especificado, no especificado | 177
30550 | Abuso de opioides, no especificado | 174
2920 | Retiro de drogas | 167
29570 | Trastorno esquizoafectivo, no especificado | 163
29620 | Trastorno afectivo depresivo mayor, episodio único, no especificado | 158
29420 | Demencia, no especificada, sin alteración del comportamiento | 158
3079 | Otros síntomas o síndromes especiales y los no especificados, no clasificados en otra parte | 153
29040 | Demencia vascular, sin complicaciones | 136
2939 | Trastorno mental transitorio no especificado en condiciones clasificadas en otra parte | 130
319 | Discapacidades intelectuales no especificadas | 129
31401 | Trastorno por déficit de atención con hiperactividad | 121
30503 | Abuso de alcohol, en remisión | 112
2989 | Psicosis no especificada | 107
30001 | Trastorno de pánico sin agorafobia | 104
30400 | Dependencia de tipo opioide, no especificada | 102
30520 | Uso indebido de cannabis, no especificado | 95
29650 | Trastorno bipolar I, episodio depresivo más reciente (o actual), no especificado | 77
30300 | Intoxicación alcohólica aguda en el alcoholismo, no especificado | 77

Gracias, es un buen comienzo y es exactamente lo que quería. Por supuesto, aún sería práctico si esta descripción general pudiera implementarse como una característica en el futuro.