Pecan: рд╢рд╛рдЗрдиреА рдРрдк рддреНрд░реБрдЯрд┐рдпрд╛рдБ - рд╡реАрдПрдо рдкрд░ рд╢рд╛рдЗрдиреА рдХреЛрдб рд╣рд╛рд░реНрдбрдирд┐рдВрдЧ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдПрдкрд┐рдХ рдЗрд╢реНрдпреВ

рдХреЛ рдирд┐рд░реНрдорд┐рдд 20 рдЕрдЧре░ 2018  ┬╖  11рдЯрд┐рдкреНрдкрдгрд┐рдпрд╛рдБ  ┬╖  рд╕реНрд░реЛрдд: PecanProject/pecan

рд╣рд░ рд╢рд╛рдЗрдиреА рдРрдк рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдЗрд╕ рдПрдкрд┐рдХ рдЗрд╢реНрдпреВ рд╕реЗ рдЫреЛрдЯреЗ-рдЫреЛрдЯреЗ рдЗрд╢реНрдпреВ рдЬреЛрдбрд╝реЗ рдЬрд╛рдПрдВрдЧреЗред рд▓рдХреНрд╖реНрдп 1.6.0 рд░рд┐рд▓реАрдЬ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рд╡рд░реНрдХрдлрд╝реНрд▓реЛрдкреНрд▓реЙрдЯ рд╕реЗ рд╢реБрд░реВ рд╣реЛрдиреЗ рд╡рд╛рд▓реЗ рдПрдЬреАрдпреВ рджреНрд╡рд╛рд░рд╛ рдЙрди рд╕рднреА рдХреЛ рд▓реЛрдб рдХрд░рдирд╛ рдФрд░ рдХрд╛рдо рдХрд░рдирд╛ рд╣реИред

рдмрдЧ рдХрд╛ рд╡рд░реНрдгрди рдХрд░реЗрдВ
VM рдкрд░ рдмреЙрдХреНрд╕ рд╕реЗ рдмрд╛рд╣рд░ SHINY рдРрдк рдкреЗрдЬ рд▓реЛрдб рд╣реЛрдиреЗ рд╕реЗ рдХреБрдЫ рдЧрд▓рдд рд╣реЛрдиреЗ рдкрд░ рд╕рдлрд▓рддрд╛ рдФрд░ рд╡реНрдпрд╡рд╣рд╛рд░ рдХреЗ рд╡рд┐рднрд┐рдиреНрди рд╕реНрддрд░ рдкреНрд░рд╛рдкреНрдд рд╣реЛрддреЗ рд╣реИрдВред
рдмреЗрдВрдЪрдорд╛рд░реНрдХрд┐рдВрдЧ рд░рд┐рдкреЛрд░реНрдЯ - рд▓реЙрдЧ рдХреА рдЬрд╛рдВрдЪ рдХрд░рдиреЗ рдФрд░ рдРрдк рд▓реЗрдЦрдХ рд╕реЗ рд╕рдВрдкрд░реНрдХ рдХрд░рдиреЗ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рд╕рдВрджреЗрд╢ рдХреА рдУрд░ рдЗрд╢рд╛рд░рд╛ рдХрд░рддреЗ рд╣реБрдП рддреНрд░реБрдЯрд┐
BrowDog - рдареАрдХ рд▓реЛрдб рд╣реЛ рд░рд╣рд╛ рд╣реИ
рдбреЗрдЯрд╛-рдЗрдирдЬреЗрд╕реНрдЯ - "рдПрдкреНрд▓рд┐рдХреЗрд╢рди рдкреНрд░рд╛рд░рдВрдн рдХрд░рдиреЗ рдореЗрдВ рд╡рд┐рдлрд▓ рд░рд╣рд╛ред рдПрдкреНрд▓рд┐рдХреЗрд╢рди рдкреНрд░рд╛рд░рдВрдн рдХрд░рдиреЗ рдХреЗ рджреМрд░рд╛рди рдмрд╛рд╣рд░ рдирд┐рдХрд▓ рдЧрдпрд╛" рдХреЗ рд╕рд╛рде рддреНрд░реБрдЯрд┐ред
рд╡рд┐рд╢реЗрд╖рдЬреНрдЮ рдПрд▓рд┐рд╕рд┐рдЯреЗрд╢рди - "рд╕рд░реНрд╡рд░ рд╕реЗ рдбрд┐рд╕реНрдХрдиреЗрдХреНрдЯ рдХрд┐рдпрд╛ рдЧрдпрд╛" рдХрд╣рдиреЗ рд╡рд╛рд▓реА рдЧреНрд░реЗ рд╕реНрдХреНрд░реАрди рдореЗрдВ рддреНрд░реБрдЯрд┐
рд╡реИрд╢реНрд╡рд┐рдХ рд╕рдВрд╡реЗрджрдирд╢реАрд▓рддрд╛ - "рд╕рд░реНрд╡рд░ рд╕реЗ рдбрд┐рд╕реНрдХрдиреЗрдХреНрдЯ рдХрд┐рдпрд╛ рдЧрдпрд╛" рдХрд╣рдиреЗ рд╡рд╛рд▓реА рдЧреНрд░реЗ рд╕реНрдХреНрд░реАрди рдореЗрдВ рддреНрд░реБрдЯрд┐
PEcAn.depend - рдкреНрд░реЙрдХреНрд╕реА рдХреЗ рд╕рд╛рде рддреНрд░реБрдЯрд┐, "рдкреНрд░реЙрдХреНрд╕реА рд╕рд░реНрд╡рд░ рдХреЛ рдЕрдкрд╕реНрдЯреНрд░реАрдо рд╕рд░реНрд╡рд░ рд╕реЗ рдПрдХ рдЕрдорд╛рдиреНрдп рдкреНрд░рддрд┐рдХреНрд░рд┐рдпрд╛ рдорд┐рд▓реАред рдкреНрд░реЙрдХреНрд╕реА рд╕рд░реНрд╡рд░ GET/рдЪрдордХрджрд╛рд░/Pecan.depend/ рдХреЗ рдЕрдиреБрд░реЛрдз рдХреЛ рд╣реИрдВрдбрд▓ рдирд╣реАрдВ рдХрд░ рд╕рдХрд╛ред рдХрд╛рд░рдг: рджреВрд░рд╕реНрде рд╕рд░реНрд╡рд░ рд╕реЗ рдкрдврд╝рдиреЗ рдореЗрдВ
рд╡реНрдпреВрдореЗрдЯ - рдареАрдХ рд▓реЛрдб рд╣реЛ рд░рд╣рд╛ рд╣реИ
рд╡рд░реНрдХрдлрд╝реНрд▓реЛрдкреНрд▓реЙрдЯ- рдЧреНрд░реЗ рд╕реНрдХреНрд░реАрди рдХреЗ рд╕рд╛рде рддреНрд░реБрдЯрд┐ "рд╕рд░реНрд╡рд░ рд╕реЗ рдбрд┐рд╕реНрдХрдиреЗрдХреНрдЯ" рдХрд╣ рд░рд╣реА рд╣реИ

рдкреНрд░рдЬрдирди рдХрд░рдирд╛
рд╡реНрдпрд╡рд╣рд╛рд░ рдХреЛ рдкреБрди: рдкреЗрд╢ рдХрд░рдиреЗ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдХрджрдо:

  1. рд╕реНрдерд╛рдиреАрдп рдмреНрд░рд╛рдЙрдЬрд╝рд░ рдореЗрдВ http://localhost :6480/ рдкрд░ рдЬрд╛рдХрд░ pecan VM рдХреЗ рд╕рд╛рде рд╡реЗрдм GUI рдЦреЛрд▓реЗрдВ
  2. 'рдЖрдЙрдЯрдкреБрдЯ рд╡рд┐рдЬрд╝реБрдЕрд▓рд╛рдЗрдЬрд╝реЗрд╢рди' рдкрд░ рдХреНрд▓рд┐рдХ рдХрд░реЗрдВ
  3. рдкреНрд░рддреНрдпреЗрдХ рдЪрдордХрджрд╛рд░ рдРрдк рдкрд░ рдХреНрд▓рд┐рдХ рдХрд░реЗрдВ
  4. рдкреНрд░рддреНрдпреЗрдХ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рддреНрд░реБрдЯрд┐ рджреЗрдЦреЗрдВ

рдЕрдкреЗрдХреНрд╖рд┐рддреН рд╡реНрдпрд╡рд╣рд╛рд░
рдПрдХ рдЗрдВрдЯрд░реИрдХреНрдЯрд┐рд╡ рдкреЗрдЬ рдЬреЛ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдЕрдиреБрдорддрд┐ рджреЗрддрд╛ рд╣реИ

рд╕реНрдХреНрд░реАрдирд╢реЙрдЯ
рдпрджрд┐ рд▓рд╛рдЧреВ рд╣реЛ, рддреЛ рдЕрдкрдиреА рд╕рдорд╕реНрдпрд╛ рд╕рдордЭрд╛рдиреЗ рдореЗрдВ рд╕рд╣рд╛рдпрддрд╛ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рд╕реНрдХреНрд░реАрдирд╢реЙрдЯ рдЬреЛрдбрд╝реЗрдВред
image

рдорд╢реАрди (рдХреГрдкрдпрд╛ рдирд┐рдореНрдирд▓рд┐рдЦрд┐рдд рдЬрд╛рдирдХрд╛рд░реА рдХреЛ рдкреВрд░рд╛ рдХрд░реЗрдВ):

  • рд╡реАрдПрдо 1.6.0-рдЖрд░рд╕реА1
  • рд▓рд┐рдирдХреНрд╕
  • рд╕реНрдерд╛рдиреАрдп рдорд╢реАрди рдкрд░ Firefox

рдЕрддрд┐рд░рд┐рдХреНрдд рд╕рдВрджрд░реНрдн
рдпрд╣рд╛рдВ рд╕рдорд╕реНрдпрд╛ рдХреЗ рдмрд╛рд░реЗ рдореЗрдВ рдХреЛрдИ рдЕрдиреНрдп рд╕рдВрджрд░реНрдн рдЬреЛрдбрд╝реЗрдВред

Bug VM 02 - Normal Not started Epic Stale

рд╕рднреА 11 рдЯрд┐рдкреНрдкрдгрд┐рдпрд╛рдБ

рдирд┐рдореНрдирд▓рд┐рдЦрд┐рдд рдХреЛрдб VM рдкрд░ рд▓реЙрдЧ рдлрд╝рд╛рдЗрд▓реЛрдВ рдХреЛ рд╕реБрд░рдХреНрд╖рд┐рдд рд░рдЦреЗрдЧрд╛:

sudo -s
echo "preserve_logs true;" >> /etc/shiny-server/shiny-server.conf
service shiny-server restart

VM рдореЗрдВ рдЗрди R рдкреИрдХреЗрдЬреЛрдВ рдХреА рдХрдореА рд╣реИ рдЬрд┐рдирдХреА SHINY рдРрдкреНрд╕ рдХреЛ рдЖрд╡рд╢реНрдпрдХрддрд╛ рд╣реИ:
Data-Ingest . рдХреЗ рд▓рд┐рдП 'shinytoast'
рдЙрддреНрддреЗрдЬрдирд╛ рдХреЗ рд▓рд┐рдП 'рд╢реЗрд▓реНрдл'
Pecan.depend . рдХреЗ рд▓рд┐рдП 'рдЧреНрд░рд╛рдл' рдлрд┐рд░ 'рдХреЛрдб рдбрд┐рдкреЗрдВрдбреНрд╕'

рдмреЗрдВрдЪрдорд╛рд░реНрдХ рд░рд┐рдкреЛрд░реНрдЯ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдПрдХ рд╡рд╕реНрддреБ "рдкрд░рд┐рдгрд╛рдо" рдЧрд╛рдпрдм рд╣реИ рдЗрд╕рд▓рд┐рдП рдкреГрд╖реНрда рд▓реЛрдб рдирд╣реАрдВ рд╣реЛрддрд╛ рд╣реИред рдореЗрд░рд╛ рдорд╛рдирдирд╛ тАЛтАЛрд╣реИ рдХрд┐ рдРрд╕рд╛ рдЗрд╕рд▓рд┐рдП рд╣реИ рдХреНрдпреЛрдВрдХрд┐ рдореИрдВрдиреЗ рдмреЗрдВрдЪрдорд╛рд░реНрдХ рд░рди рдирд╣реАрдВ рдХрд┐рдпрд╛ рд╣реИред рдпрд╣рд╛рдВ @bcow рдХреА рд╡рд┐рд╢реЗрд╖рдЬреНрдЮрддрд╛ рдЪрд╛рд╣рд┐рдПред

@robkooper рдкреИрдХреЗрдЬ рдЬреЛрдбрд╝рдиреЗ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдЧрдпрд╛ рдФрд░ рджреЗрдЦрд╛ рдХрд┐ рд╡реЗ рд╕рднреА "рдирд┐рд░реНрднрд░" рдХреЗ рддрд╣рдд рд╕реВрдЪреАрдмрджреНрдз рдЙрдирдХреА рд╕рдВрдмрдВрдзрд┐рдд рдЪрдордХрджрд╛рд░ рдирд┐рд░реНрджреЗрд╢рд┐рдХрд╛рдУрдВ рдХреА рд╡рд┐рд╡рд░рдг рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдореЗрдВ рд╣реИрдВред рдХреНрдпрд╛ рд╡рд╣ рдЧрд▓рдд рдЬрдЧрд╣ рд╣реИ? рд░рд┐рд▓реАрдЬ рд╢рд╛рдЦрд╛ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдЖрдкрдХреА рдирд╡реАрдирддрдо рдкреНрд░рддрд┐рдмрджреНрдзрддрд╛ рднреА рджреЗрдЦреАред рдХреНрдпрд╛ рдпрд╣ рдЗрд╕реЗ рд╣рд▓ рдХрд░рддрд╛ рд╣реИ?

рдирд╣реАрдВ, рдпрд╣ рд╕рд╣реА рдЬрдЧрд╣ рд╣реИ, рд╕рдорд╕реНрдпрд╛ рдпрд╣ рд╣реИ рдХрд┐ рдЖрдк рдЪрдордХрджрд╛рд░ рдкреИрдХреЗрдЬ рд╕реНрдерд╛рдкрд┐рдд рдирд╣реАрдВ рдХрд░рддреЗ рд╣реИрдВ, рдФрд░ рдЗрд╕ рдкреНрд░рдХрд╛рд░ рдирд┐рд░реНрднрд░ рдХреЛ рдкрд╛рд░реНрд╕ рдирд╣реАрдВ рдХрд┐рдпрд╛ рдЬрд╛рддрд╛ рд╣реИ, рдпрд╣ рдЬрд╛рдирдХрд░ рдЕрдЪреНрдЫрд╛ рд▓рдЧрд╛ рдХрд┐ рд╡реЗ рд╡рд╣рд╛рдВ рд╕реВрдЪреАрдмрджреНрдз рд╣реИрдВред

рдореБрдЭреЗ рд▓рдЧрддрд╛ рд╣реИ рдХрд┐ рд╣рдо рдЕрднреА рддрдХ рдЬрд╛рд░реА рд╣реЛрдиреЗ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рд╡реНрдпреВрдореЗрдЯ рд╕реНрдерд┐рд░ рдирд╣реАрдВ рдорд╛рдирддреЗ рд╣реИрдВ, рдЗрд╕рд▓рд┐рдП рдЗрд╕ рдирдИ рдмрдЧ рдХреЛ рдпрд╣рд╛рдВ рдкреЛрд╕реНрдЯ рдХрд░ рд░рд╣реЗ рд╣реИрдВ?

2018-08-27 09:02:24 DEBUG  [server.R#148: PEcAn.logger::logger.debug] :
2018-08-27 09:02:25 DEBUG  [server.R#25: PEcAn.logger::logger.debug] : Site 76 selected
2018-08-27 09:02:48 DEBUG  [server.R#25: PEcAn.logger::logger.debug] :
   Site 1000000146 selected
2018-08-27 09:03:07 DEBUG  [server.R#109: PEcAn.logger::logger.debug] :
   Loading AmerifluxLBL_CF_gapfill
2018-08-27 09:03:07 DEBUG  [server.R#110: PEcAn.logger::logger.debug] : Loading 2005
Warning in postgresqlExecStatement(conn, statement, ...) :
  RS-DBI driver warning: (unrecognized PostgreSQL field type geometry (id:77969) in column 17)
2018-08-27 09:03:07 WARN   [server.R#124: query.format.vars] :
   Units not convertible for precipitation_flux with units of Kg/m2/s .
   Please make sure the varible has units that can be converted to kg m-2
   s-1

Attaching package: тАШPEcAn.utilsтАЩ

The following object is masked from тАШpackage:utilsтАЩ:

    download.file


Attaching package: тАШlubridateтАЩ

The following objects are masked from тАШpackage:data.tableтАЩ:

    hour, isoweek, mday, minute, month, quarter, second, wday, week,
    yday, year

The following object is masked from тАШpackage:baseтАЩ:

    date

udunits system database read
Warning in dat %in% as.numeric(format$na.strings) :
  NAs introduced by coercion
Error in str_detect(t.units, "ince\\s[0-9]{4}[.-][0-9]{2}[.-][0-9]{2}.*\\s-\\d+") :
  could not find function "str_detect"

@serbinsh рдореБрдЭреЗ рд▓рдЧрддрд╛ рд╣реИ рдХрд┐ рдЖрдкрдиреЗ рдЬреЛ рдкреЛрд╕реНрдЯ рдХрд┐рдпрд╛ рд╣реИ рд╡рд╣ рд╡рд╛рд╕реНрддрд╡ рдореЗрдВ рдПрдХ рдпреВрдбреБрдирд┐рдЯреНрд╕ рдкрд╛рд░реНрд╕рд┐рдВрдЧ рд╕рдорд╕реНрдпрд╛ рд╣реИ - рдмреАрдЯрд╛ рдореЗрдВ рд╕рдмрд╕реЗ рдкреБрд░рд╛рдиреЗ рдЪрд░ рдореЗрдВ рд╕реЗ рдХреБрдЫ рдЗрдХрд╛рдЗрдпрд╛рдВ рд╣реИрдВ рдЬрд┐рдиреНрд╣реЗрдВ рдкрд╛рд░реНрд╕ рдирд╣реАрдВ рдХрд┐рдпрд╛ рдЬрд╛ рд╕рдХрддрд╛ рд╣реИред рддреЛ рдореБрдЭреЗ рд▓рдЧрддрд╛ рд╣реИ рдХрд┐ рдЬрдм рднреА рдпрд╣ рдЖрддрд╛ рд╣реИ рддреЛ рдкреНрд░рд╡рд┐рд╖реНрдЯрд┐рдпреЛрдВ рдХреЛ рдареАрдХ рдХрд░рдиреЗ рдХрд╛ рд╕рдмрд╕реЗ рдЕрдЪреНрдЫрд╛ рд╕рдорд╛рдзрд╛рди рд╣реИред

> ud.is.parseable("Kg/m2/s")
[1] FALSE

рд╕рд╛рде рд╣реА, udunits2 рдХрд┐рд▓реЛрдЧреНрд░рд╛рдо рдХрд╛ рд╡рд┐рд╢реНрд▓реЗрд╖рдг рдирд╣реАрдВ рдХрд░реЗрдЧрд╛ред

> ud.is.parseable("Kg")
[1] FALSE
> ud.is.parseable("kg")
[1] TRUE

@bcow рд╕реЗ рд╕рд╣рдордд рд╣реИрдВ рдХрд┐ рд╕рдорд╛рдзрд╛рди

рдпрд╣ рд╕рдорд╕реНрдпрд╛ рдкреБрд░рд╛рдиреА рд╣реИ рдХреНрдпреЛрдВрдХрд┐ рдпрд╣ рдмрд┐рдирд╛ рдХрд┐рд╕реА рдЧрддрд┐рд╡рд┐рдзрд┐ рдХреЗ 365 рджрд┐рдиреЛрдВ рд╕реЗ рдЦреБрд▓рд╛ рд╣реИред

@mdietze @bcow @robkooper рдХреНрдпрд╛ рдпрд╣ рдЕрднреА рднреА рд╕рдХреНрд░рд┐рдп рд╣реИ? рд╢рд╛рдпрдж #2162 рдХреЛ рд▓рд╛рдЧреВ рдХрд░рдиреЗ рдХреЗ рд╣рд┐рд╕реНрд╕реЗ рдХреЗ рд░реВрдк рдореЗрдВ рдХреБрдЫ рдлрд┐рд░ рд╕реЗ рдЬрд╛рдирд╛ рд╣реИ?

рд╣рдорд╛рд░реА рдЕрдЧрд▓реА рд░рд┐рд▓реАрдЬрд╝ рдХрдм рдирд┐рд░реНрдзрд╛рд░рд┐рдд рд╣реИ? рдореИрдВ рдХрд╣реВрдВрдЧрд╛ рдХрд┐ рд╣рдореЗрдВ рдпрд╣ рд╕реБрдирд┐рд╢реНрдЪрд┐рдд рдХрд░рдиреЗ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдЕрдЧрд▓реА рд░рд┐рд▓реАрдЬ рдореЗрдВ рдЗрд╕реЗ рдЯреИрдЧ рдХрд░рдирд╛ рдЪрд╛рд╣рд┐рдП рдХрд┐ рд╣рдорд╛рд░реЗ рдкрд╛рд╕ рд╕рднреА рдЪрдордХрджрд╛рд░ рдРрдкреНрд╕ рдХрд╛рдо рдХрд░ рд░рд╣реЗ рд╣реИрдВ, рдФрд░ рд╕реБрдирд┐рд╢реНрдЪрд┐рдд рдХрд░реЗрдВ рдХрд┐ рд╣рдо рдЙрд╕ рдмрд┐рдВрджреБ рдкрд░ рдЗрд╕реЗ рдмрдВрдж рдХрд░ рджреЗрдВред

рдХреНрдпрд╛ рдпрд╣ рдкреГрд╖реНрда рдЙрдкрдпреЛрдЧреА рдерд╛?
0 / 5 - 0 рд░реЗрдЯрд┐рдВрдЧреНрд╕

рд╕рдВрдмрдВрдзрд┐рдд рдореБрджреНрджреЛрдВ

ashiklom picture ashiklom  ┬╖  7рдЯрд┐рдкреНрдкрдгрд┐рдпрд╛рдБ

tonygardella picture tonygardella  ┬╖  7рдЯрд┐рдкреНрдкрдгрд┐рдпрд╛рдБ

tonygardella picture tonygardella  ┬╖  8рдЯрд┐рдкреНрдкрдгрд┐рдпрд╛рдБ

mccabete picture mccabete  ┬╖  9рдЯрд┐рдкреНрдкрдгрд┐рдпрд╛рдБ

ashiklom picture ashiklom  ┬╖  4рдЯрд┐рдкреНрдкрдгрд┐рдпрд╛рдБ