Pecan: SHINYアプリエラー-VMでのSHINYコード強化に関するEPICISSUE

次のコードは、VM上のログファイルを保持します。

sudo -s
echo "preserve_logs true;" >> /etc/shiny-server/shiny-server.conf
service shiny-server restart

VMには、SHINYアプリに必要なこれらのRパッケージがありません。
データ取り込み用の「shinytoastr」
引き出し用の「棚」
Pecan.dependの場合は「graph」、次に「CodeDepends」

BenchmarkReportの場合、オブジェクトの「結果」が欠落しているため、ページが読み込まれません。 ベンチマークを実行していないからだと思います。 ここで@bcowの専門知識が必要です。

@robkooperパッケージを追加し、それらすべてが「依存」の下にリストされているそれぞれの光沢のあるディレクトリの説明ファイルにあることを確認しました。 それは間違った場所ですか？ また、リリースブランチへの最新のコミットも確認​​しました。 それはこれを解決しますか？

いいえ、それは正しい場所です。問題は、光沢のあるパッケージをインストールしないことです。したがって、依存関係は解析されません。そこにリストされていることを知っておくとよいでしょう。

viewMetの安定版がリリースされるとはまだ考えていないので、この新しいバグをここに投稿しますか？

2018-08-27 09:02:24 DEBUG  [server.R#148: PEcAn.logger::logger.debug] :
2018-08-27 09:02:25 DEBUG  [server.R#25: PEcAn.logger::logger.debug] : Site 76 selected
2018-08-27 09:02:48 DEBUG  [server.R#25: PEcAn.logger::logger.debug] :
   Site 1000000146 selected
2018-08-27 09:03:07 DEBUG  [server.R#109: PEcAn.logger::logger.debug] :
   Loading AmerifluxLBL_CF_gapfill
2018-08-27 09:03:07 DEBUG  [server.R#110: PEcAn.logger::logger.debug] : Loading 2005
Warning in postgresqlExecStatement(conn, statement, ...) :
  RS-DBI driver warning: (unrecognized PostgreSQL field type geometry (id:77969) in column 17)
2018-08-27 09:03:07 WARN   [server.R#124: query.format.vars] :
   Units not convertible for precipitation_flux with units of Kg/m2/s .
   Please make sure the varible has units that can be converted to kg m-2
   s-1

Attaching package: ‘PEcAn.utils’

The following object is masked from ‘package:utils’:

    download.file


Attaching package: ‘lubridate’

The following objects are masked from ‘package:data.table’:

    hour, isoweek, mday, minute, month, quarter, second, wday, week,
    yday, year

The following object is masked from ‘package:base’:

    date

udunits system database read
Warning in dat %in% as.numeric(format$na.strings) :
  NAs introduced by coercion
Error in str_detect(t.units, "ince\\s[0-9]{4}[.-][0-9]{2}[.-][0-9]{2}.*\\s-\\d+") :
  could not find function "str_detect"

@serbinshあなたが投稿したのは、実際にはudunitsの解析の問題だと思います。betyの最も古い変数のいくつかには、解析できない単位があります。 したがって、最善の解決策は、これが発生するたびにエントリを修正することだと思います。

> ud.is.parseable("Kg/m2/s")
[1] FALSE

また、 udunits2はKgを解析しません。

> ud.is.parseable("Kg")
[1] FALSE
> ud.is.parseable("kg")
[1] TRUE

解決策はBetyエントリを修正することであるという@bcowに同意します。 古いエントリに戻って修正できるように、すべてのbety変数ユニットでチェックを実行することについて別の問題を開くとよいでしょう。 また、FWIWは、この正確なチェックを彼の新しいデータ取り込みアプリのフォーマット変数部分に入れて、これが前進するのを回避するのに役立てました。

この問題は365日間開いており、アクティビティがないため、古くなっています。

@mdietze @bcow @robkooperこれはまだアクティブですか？ たぶん、＃2162の実装の一部として再検討する何かがありますか？

次のリリースはいつ予定されていますか？ これを次のリリースにタグ付けして、すべてのShinyアプリが機能していることを確認し、その時点でこれを閉じる必要があると思います。