Mimic-code: خطأ في صورة عامل الإرساء: السجل: طول حزمة بدء التشغيل غير صالح

تم إنشاؤها على ٤ فبراير ٢٠٢٠  ·  23تعليقات  ·  مصدر: MIT-LCP/mimic-code

المتطلبات الأساسية

وصف

تحيات،

أواجه مشكلة صغيرة في إعداد صورة عامل ميناء. لقد اتبعت الدليل هنا: https://github.com/MIT-LCP/mimic-code/tree/master/buildmimic/docker

نظامي:

System Information
------------------
Operating System: Windows 10 Pro 64-bit (10.0, Build 18363) (18362.19h1_release.190318-1202)
    Language: English (Regional Setting: English)
Processor: Intel(R) Core(TM) i7-3520M CPU @ 2.90GHz (4 CPUs), ~2.9GHz
Memory: 16384MB RAM
Available OS Memory: 16080MB RAM
Page File: 14726MB used, 10058MB available
Windows Dir: C:\WINDOWS

شجرة مجلداتي الحالية في (D :):

.
|-- mimic_code
|   |-- benchmark
|   |-- buildmimic
|   |-- concepts
|   |-- notebooks
|   |-- tests
|   `-- tutorials
|-- mimic_data
|   `-- csv
`-- mimic_pgdata

يحتوي المجلد الموجود في \mimic-data\csv على ملفات بيانات MIMIC-III .csv.gz . المجلد mimic_pgdata فارغ وقت تشغيل الحاوية. إنها فارغة حتى بعد تشغيل الحاوية. أفترض أن السبب في ذلك هو أنني لا أقوم بتنفيذ أي أوامر بعد إنشاء الحاوية.

الأمر الذي استخدمته (باستخدام محطة Git Bash):

docker run \
--name mimic \
-p 5433:5432 \
-e BUILD_MIMIC=1 \
-e POSTGRES_PASSWORD=postgres \
-e MIMIC_PASSWORD=mimic \
-v //d/mimic_data/csv:/mimic_data \
-v //d/mimic_pgdata:/var/lib/postgresql/data \
-d postgres/mimic

نتيجتي من Docker Dashboard:

PostgreSQL Database directory appears to contain a database; Skipping initialization
2020-02-04 15:23:25.966 UTC [1] LOG:  starting PostgreSQL 12.1 (Debian 12.1-1.pgdg100+1) on x86_64-pc-linux-gnu, compiled by gcc (Debian 8.3.0-6) 8.3.0, 64-bit
2020-02-04 15:23:25.974 UTC [1] LOG:  listening on IPv4 address "0.0.0.0", port 5432
2020-02-04 15:23:25.974 UTC [1] LOG:  listening on IPv6 address "::", port 5432
2020-02-04 15:23:25.995 UTC [1] LOG:  listening on Unix socket "/var/run/postgresql/.s.PGSQL.5432"
2020-02-04 15:23:26.014 UTC [25] LOG:  database system was shut down at 2020-02-04 15:20:26 UTC
2020-02-04 15:23:26.020 UTC [1] LOG:  database system is ready to accept connections
2020-02-04 15:23:26.034 UTC [32] LOG:  invalid length of startup packet
2020-02-04 15:23:26.086 UTC [33] LOG:  invalid length of startup packet
2020-02-04 15:23:27.219 UTC [34] LOG:  invalid length of startup packet
2020-02-04 15:23:27.219 UTC [35] LOG:  invalid length of startup packet
2020-02-04 15:23:28.257 UTC [36] LOG:  invalid length of startup packet
2020-02-04 15:23:28.259 UTC [37] LOG:  invalid length of startup packet
2020-02-04 15:23:29.264 UTC [38] LOG:  invalid length of startup packet
2020-02-04 15:23:29.269 UTC [39] LOG:  invalid length of startup packet
2020-02-04 15:23:29.795 UTC [40] LOG:  invalid length of startup packet
2020-02-04 15:23:30.278 UTC [42] LOG:  invalid length of startup packet
2020-02-04 15:23:30.278 UTC [41] LOG:  invalid length of startup packet
2020-02-04 15:23:30.824 UTC [43] LOG:  invalid length of startup packet
2020-02-04 15:23:31.287 UTC [44] LOG:  invalid length of startup packet
2020-02-04 15:23:31.292 UTC [45] LOG:  invalid length of startup packet
2020-02-04 15:23:31.834 UTC [46] LOG:  invalid length of startup packet
2020-02-04 15:23:32.854 UTC [47] LOG:  invalid length of startup packet
2020-02-04 15:23:33.863 UTC [48] LOG:  invalid length of startup packet
2020-02-04 15:23:34.875 UTC [49] LOG:  invalid length of startup packet

ناتج docker images :

REPOSITORY                           TAG                 IMAGE ID            CREATED             SIZE
postgres/mimic                       latest              10d900d346ac        19 minutes ago      440MB
postgres                             latest              cf879a45faaa        2 days ago          394MB
k8s.gcr.io/kube-apiserver            v1.15.5             e534b1952a0d        3 months ago        207MB
k8s.gcr.io/kube-controller-manager   v1.15.5             1399a72fa1a9        3 months ago        159MB
k8s.gcr.io/kube-proxy                v1.15.5             cbd7f21fec99        3 months ago        82.4MB
k8s.gcr.io/kube-scheduler            v1.15.5             fab2dded59dd        3 months ago        81.1MB
golang                               1.11-alpine         e116d2efa2ab        5 months ago        312MB
docker/kube-compose-controller       v0.4.23             a8c3d87a58e7        8 months ago        35.3MB
docker/kube-compose-api-server       v0.4.23             f3591b2cb223        8 months ago        49.9MB
alpine                               3.5                 f80194ae2e0c        12 months ago       4MB
k8s.gcr.io/coredns                   1.3.1               eb516548c180        12 months ago       40.3MB
k8s.gcr.io/etcd                      3.3.10              2c4adeb21b4f        14 months ago       258MB
k8s.gcr.io/pause                     3.1                 da86e6ba6ca1        2 years ago         742kB

لقد حاولت:

  1. حذف الصورة وإعادة إنشائها مرة أخرى ولكن دون جدوى.
  2. أرقام منافذ HOST مختلفة ولكن ما زلت أحصل على نفس الإخراج.
  3. باستخدام شرطة مائلة واحدة للعناوين في تشغيل الحاوية ، لكنها فشلت على الرغم من استخدام محطة Git Bash.

التعليق الأكثر فائدة

تحديث : ما زلت أواجه نفس المشكلة. لقد قمت بتحديث setup.sh و Dockerfile أيضًا لكنها لا تزال تعطيني نفس الناتج.

ال 23 كومينتر

بصراحة ، لست مألوفًا مع Docker - ولكن ربما يمكن لـ xiaosongz أو haobibo التعليق لأن كلاهما كان يعمل مؤخرًا مع البناء.

مرحبًا @ khalid-hussain ، وجد xiaosongz خطأ في ملف إنشاء صورة عامل ميناء setup.sh .
وقمت بإنشاء صفحة علاقات عامة https://github.com/MIT-LCP/mimic-code/pull/693 في محاولة لإصلاح ذلك.

هل يمكنك اتباع setup.sh المحدث (أو استنساخه مباشرة من https://github.com/haobibo/mimic-code) لمعرفة ما إذا كان الرمز المحدث يعمل أم لا.

أنا آسف ، لقد انشغلت ببعض الأمور الأخرى. سأحاول غدا. شكرا لردود سريعة.

تحديث : ما زلت أواجه نفس المشكلة. لقد قمت بتحديث setup.sh و Dockerfile أيضًا لكنها لا تزال تعطيني نفس الناتج.

مرحبًا ، لقد وجدت أيضًا هذه المشكلة. هل يوجد أي حل الآن؟

+1

نفس المشكلة هنا.

+1

هل لدى أي شخص حل! نفس المشكلة مع نظامنا.

+1

+1

+1

+1

+1

+1

+1

اي حل؟

الله يوفقني ، أنا عالق هنا لساعات

قد يلقي شخص ما في المختبر نظرة على إصلاح صورة Docker في مرحلة ما ، ولكن لدينا موارد محدودة وهذا ليس من أولوياتنا. سنكون سعداء لمراجعة طلب سحب من المجتمع.

نفس المشكلة هنا

نفس المشكلة هنا

أواجه نفس المشكلة؟

-03-11 08: 31: 31.885 UTC [1] LOG: بدء PostgreSQL 13.2 (Debian 13.2-1.pgdg100 + 1) على x86_64-pc-linux-gnu ، المُجمع بواسطة مجلس التعاون الخليجي (Debian 8.3.0-6) 8.3. 0 ، 64 بت
2021-03-11 08: 31: 31.885 UTC [1] LOG: الاستماع على عنوان IPv4 "0.0.0.0" ، المنفذ 5432
2021-03-11 08: 31: 31.885 UTC [1] LOG: الاستماع على عنوان IPv6 "::" ، المنفذ 5432
2021-03-11 08: 31: 31.899 UTC [1] LOG: الاستماع على مقبس Unix "/var/run/postgresql/.s.PGSQL.5432"
2021-03-11 08: 31: 31.914 بالتوقيت العالمي المنسق [66] السجل: تم إغلاق نظام قاعدة البيانات في 2021-03-11 08:31:31 بالتوقيت العالمي المنسق
2021-03-11 08: 31: 31.924 UTC [1] LOG: نظام قاعدة البيانات جاهز لقبول الاتصالات
2021-03-11 08: 31: 51.485 UTC [73] فادح: فشلت مصادقة كلمة المرور للمستخدم "pgadmin"
2021-03-11 08: 31: 51.485 UTC [73] التفاصيل: الدور "pgadmin" غير موجود.
تطابق الاتصال مع سطر pg_hba.conf 99: "استضافة كافة ملفات md5"
2021-03-11 08: 32: 00.969 UTC [74] فادح: فشلت مصادقة كلمة المرور للمستخدم "pgadmin"
2021-03-11 08: 32: 00.969 UTC [74] التفاصيل: الدور "pgadmin" غير موجود.
تطابق الاتصال مع سطر pg_hba.conf 99: "استضافة كافة ملفات md5"
2021-03-11 08: 32: 06.826 UTC [75] فادح: فشلت مصادقة كلمة المرور للمستخدم "pgadmin"
2021-03-11 08: 32: 06.826 UTC [75] التفاصيل: الدور "pgadmin" غير موجود.
تطابق الاتصال مع سطر pg_hba.conf 99: "استضافة كافة ملفات md5"
2021-03-11 08: 33: 38.128 UTC [78] فادح: فشلت مصادقة كلمة المرور للمستخدم "pgadmin"
2021-03-11 08: 33: 38.128 UTC [78] التفاصيل: الدور "pgadmin" غير موجود.
تطابق الاتصال مع سطر pg_hba.conf 99: "استضافة كافة ملفات md5"
2021-03-11 08: 33: 52.780 التوقيت العالمي المنسق [79] السجل: طول غير صالح لحزمة بدء التشغيل
2021-03-11 08: 33: 52.783 التوقيت العالمي المنسق [80] السجل: طول غير صالح لحزمة بدء التشغيل ............................. .............

المشكلة نفسها

هل كانت هذه الصفحة مفيدة؟
0 / 5 - 0 التقييمات